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2024年07月

  • 07.16 15:57:40
    发表了文章 2024-07-16 15:57:40

    Sentieon | 应用教程：唯一分子标识符(UMI)

    **Sentieon®工具通过UMI处理NGS数据，减少PCR误差和提高变异检测准确性。流程包括：umi extract（提取UMI标签），bwa mem对齐，umi consensus（创建一致性分子），再次对齐并排序。umi extract根据读取结构提取条形码，umi consensus生成共识Fastq，最终比对产生用于变异调用的BAM文件。该流程适用于体细胞突变检测，推荐使用TNscope®。日志提供质量控制信息，如组大小直方图和双工统计。**
  • 07.15 16:41:50
    发表了文章 2024-07-15 16:41:50

    Sentieon | 应用教程：Sentieon分布模式

    本文档描述了如何利用Sentieon®基因组学工具的分片能力将DNAseq®流程分布到多台服务器上；将其他流程（如TNseq®）进行分布遵循相同原则，因为所有Sentieon®基因组学工具都具有相同的内置分布式处理能力。这种分布的目标是为了减少流程的总运行时间，以更快地生成结果；然而，这种分布也会带来一些额外的开销，使计算成本增加。

2024年05月

2023年08月

  • 发表了文章 2025-10-30

    sentieon | 泛基因组分析流程详解

  • 发表了文章 2025-10-27

    毅硕HPC | HPC环境下的LDAP配置

  • 发表了文章 2025-09-25

    Sentieon | 小麦全基因组（WGS）分析流程

  • 发表了文章 2025-08-14

    Sentieon 项目文章 | 一例中国男童及139例Pearson综合征患者的临床和遗传特征

  • 发表了文章 2025-08-06

    Sentieon 项目文章 | 偏远社区原住民澳大利亚人的血型基因组图谱

  • 发表了文章 2025-07-09

    Sentieon 项目文章 | 通过深度测序对血浆中游离线粒体 DNA 进行定量和表征

  • 发表了文章 2025-07-03

    Sentieon项目文章 | 儿童罕见病队列研究：整合研究与临床基因组学计划

  • 发表了文章 2025-06-12

    Sentieon 项目文章 | 长读长基因组测序在神经发育障碍分子诊断中的应用

  • 发表了文章 2025-05-29

    Sentieon 项目文章 | 社区努力识别和纠正蛋白质基因组研究中标签错误的样本

  • 发表了文章 2025-05-22

    文献解读-使用 Sentieon ctDNA 分析管道高精度、高效地处理 UMI 数据集

  • 发表了文章 2025-05-15

    文献解读-Sentieon DNAscope LongRead – A highly Accurate, Fast, and Efficient Pipeline for Germline Variant Calling from PacBio HiFi reads

  • 发表了文章 2025-04-29

    文献解读-The chromosome-scale genome of the raccoon dog: Insights into its evolutionary characteristics

  • 发表了文章 2025-04-24

    Sentieon软件发布V202503版本

  • 发表了文章 2025-04-17

    文献解读-Identification of driver genes for critical forms of COVID-19 in a deeply phenotyped young patient cohort

  • 发表了文章 2025-04-09

    文献解读-CRISPR-Cas9 generated Pompe knock-in murine model exhibits early-onset hypertrophic cardiomyopathy and skeletal muscle weakness

  • 发表了文章 2025-03-26

    文献解读-SARS-CoV-2 variant Delta rapidly displaced variant Alpha in the United States and led to higher viral loads

  • 发表了文章 2025-03-14

    文献解读-Identification of Key Candidate Genes for Beak Length Phenotype by Whole-Genome Resequencing in Geese

  • 发表了文章 2025-03-05

    文献解读-Chromosome-Scale Genome of Masked Palm Civet (Paguma larvata) Shows Genomic Signatures of Its Biological Characteristics and Evolution

  • 发表了文章 2025-02-26

    文献解读-Integrative Genomic Analysis of Drug Resistance in MET Exon 14 Skipping Lung Cancer Using Patient-Derived Xenograft Models

  • 发表了文章 2025-02-20

    文献解读-Thiabendazole Inhibits Glioblastoma Cell Proliferation and Invasion Targeting Mini-chromosome Maintenance Protein 2

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