Sentieon | 每周文献-Gene Editing-第二十八期

简介: Sentieon | 每周文献-Gene Editing-第二十八期

基因编辑系列文章-1

  • 标题(英文):CRISPR-Cas9 generated Pompe knock-in murine model exhibits early-onset hypertrophic cardiomyopathy and skeletal muscle weakness
  • 标题(中文):CRISPR-Cas9 生成的庞贝敲入小鼠模型表现出早发性肥厚型心肌病和骨骼肌无力
  • 发表期刊:scientific reports
  • 作者单位:加州大学圣地亚哥分校等
  • 发表年份:2020
  • 文章地址:
  • https://doi.org/10.1038/s41598-020-65259-8

 

庞贝病,由酸α-葡萄糖苷酶(GAA;EC 3.2.1.20),其特征在于糖原在身体组织(主要是心脏和骨骼肌)中的溶酶体积累。肌肉溶酶体糖原贮积导致肌无力,发病年龄和严重程度根据残留的 GAA 酶活性而变化。婴儿发病的庞贝病 (IOPD) 由几乎缺失的 GAA 酶引起,通常在出生后前2个月内表现为进行性和重度肥厚型心肌病、心力衰竭、肌张力减退、呼吸衰竭和出生后14个月内死亡

婴儿发病的庞贝病 (IOPD) 由溶酶体酸 α-葡萄糖苷酶 (GAA) 突变引起,表现为快速进展的致死性心脏和骨骼肌病,通过合成 GAA 静脉输注不完全减弱。目前可用的小鼠模型不能完全模拟人类眼压,显示骨骼肌病伴迟发性肥厚型心肌病。

在这项研究中,研究者报告了利用新的双单向导 RNA 方法,成功地产生了 Gaac.1826dupA (p.Y609*)14 小鼠庞贝氏症基因敲入模型。

在该研究中,研究者使用Sentieon软件进行胚系变异检测。

综上所述,该研究结果强烈表明 Gaac.1826dupA小鼠应用作首选的临床前庞贝病模型,用于评估基于基因组校正和其他基因组靶向治疗策略。

Sentieon软件介绍

Sentieon为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。

Sentieon软件团队拥有丰富的软件开发及算法优化工程经验,致力于解决生物数据分析中的速度与准确度瓶颈,为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、人群队列、动植物等多个领域的合作伙伴提供高效精准的软件解决方案,共同推动基因技术的发展。

截至2023年3月份,Sentieon已经在全球范围内为1300+用户提供服务,被世界一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等广泛引用,引用次数超过700篇。此外,Sentieon连续数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个权威评比的桂冠,在业内获得广泛认可。

 

软件试用: https://www.insvast.com/sentieon
目录
相关文章
|
开发框架 关系型数据库 PHP
Laravel
Laravel 是一款基于 PHP 的 Web 应用程序开发框架,它具有简洁、优雅的语法,强大的功能,以及丰富的组件,让开发者能够快速、高效地开发出功能丰富、性能优良的 Web 应用。要用 Laravel,首先需要安装 Laravel。
291 2
|
安全 应用服务中间件 Apache
目标URL存在http host头攻击漏洞
目标URL存在http host头攻击漏洞
1540 0
目标URL存在http host头攻击漏洞
|
存储 消息中间件 JavaScript
Vue3 多种组件通讯方法
【10月更文挑战第6天】
386 122
|
存储 缓存 固态存储
|
机器学习/深度学习 人工智能 搜索推荐
AI技术在情感识别方面有哪些具体应用
AI在元宇宙学习中扮演关键角色,通过数据收集分析用户习惯、兴趣,提供个性化推荐。情感识别调整教学策略,智能评估反馈学习效果,实时互动解答问题,自适应学习系统匹配个体需求。同时,注重隐私安全保护,打造高效、精准、个性化的学习环境。
|
设计模式 开发框架 .NET
分享一个 .NET Core Console 项目使用依赖注入的详细例子
分享一个 .NET Core Console 项目使用依赖注入的详细例子
256 0
|
算法 Java 开发者
深入理解死锁的原因、表现形式以及解决方法,对于提高Java并发编程的效率和安全性具有重要意义
【6月更文挑战第10天】本文探讨了Java并发编程中的死锁问题,包括死锁的基本概念、产生原因和解决策略。死锁是因线程间争夺资源导致的互相等待现象,常由互斥、请求与保持、非剥夺和循环等待条件引起。常见死锁场景包括资源请求顺序不一致、循环等待等。解决死锁的方法包括避免嵌套锁、设置锁获取超时、规定锁顺序、检测与恢复死锁,以及使用高级并发工具。理解并防止死锁有助于提升Java并发编程的效率和系统稳定性。
661 0
|
测试技术 API 数据库
微服务架构基础——解读六边形架构
追溯微服务架构的渊源,一般会涉及到六边形架构。追溯六边形架构的起源,要看始作俑者Alistair Cockburn的这篇文章 http://alistair.cockburn.us/Hexagonal+architecture, 读原文,译重点,记感受, 如下: 六边形架构的意图 采用同等的方式,应用可以通过用户,程序,自动化测试或批处理脚本来驱动,而独立于最终的运行环境及数据库进行开发和测试。
2669 0
|
JavaScript 数据可视化 物联网
iot studio中使用物联网平台提供的api
iot studio中使用物联网平台提供的api。
413 21
 iot studio中使用物联网平台提供的api
|
域名解析 边缘计算 缓存
DNS+,云服务时代下标识解析服务新机遇
DNS+,云服务时代下标识解析服务新机遇
DNS+,云服务时代下标识解析服务新机遇
下一篇
开通oss服务