技术干货|云原生数仓AnalyticDB MySQL实时存储引擎演进之路

本文涉及的产品
阿里云百炼推荐规格 ADB PostgreSQL,4核16GB 100GB 1个月
云原生数据仓库AnalyticDB MySQL版,基础版 8ACU 100GB 1个月
简介: AnalyticDB MySQL湖仓版已正式开放公测

背景


AnalyticDB MySQL作为一款实时数仓产品,在传统数仓的能力基础上为了支持低延迟的写入、更新场景,架构上设计了实时存储引擎;用户的写入、更新会以append_only的方式写入实时存储引擎,经过compact之后构建索引以支持复杂的计算场景。

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从架构上看,很庆幸SAP HANA、SingleStore有着类似的设计。


在线上服务大客户的同时,实时存储引擎也遇到了一些设计、性能上的瓶颈。

  • 在一些大宽表场景下,单行的更新带来了严重的写放大问题;
  • 实时存储引擎内存高频换入换出,cache miss高的同时,大量的压缩、解压缩带来cpu瓶颈。

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针对以上的几类问题,我们设计了新一代的实时存储引擎:

  1. 存储格式上,在确定的IO单位上设计行列混存格式,使得单行的IO大小可控;
  2. 学习学术界、工业界对Memory-centric架构的研究,在内存控制上实现了基于Anti-Caching的BufferPool。


存储格式


AnalyticDB MySQL实时存储引擎在最初的设计上仍然是一个列存实现,在宽表的更新(游戏业务中留存率计算、零售业务中订单统计等)场景下,IO放大导致的latency问题尤为明显。

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RowGroup作为行列混存的一个典型设计,在列存的基础上以行数对齐的方式使得一个group内逻辑行号对齐;这样的设计在宽表场景下出现了比较严重的弊端,当访问一行数据时,磁盘的IO单位变得不可控(列数*block_size)。

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针对IO的优化,我们在固定大小的Page上以PAX layout组织数据格式,page头部维护列数、当前记录数以及空闲大小;其次记录每个列起始offset和行粒度的bitmap信息。


每个列会在各个定长minipage中维护(变长的组织在下个小节介绍),同时每个F-minipage的分配上保证cacheline对齐。


基于PAX layout的设计,能够确保每个page的刷盘落到磁盘上都是确定的IO单位;同时同一个列的数据仍然保持在一个minipage上的连续布局,在顺序扫描的场景上仍然能够充分利用cache的能力。


VarlenEntry的设计

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针对变长字段的存储,AnalyticDB MySQL用16-byte来存储和表示;前4个字节存储字符串长度,对于超过12个字节的字段会记录4个字节的prefix之后,记录指向V-minipage中对应记录的起始地址。


内存控制


在内存控制的演进上,AnalyticDB MySQL实时存储引擎从最初的LRU-based Cache逐步走向以内存为中心的架构。


与传统数据库的Caching机制不同,AnalyticDB MySQL基于Anti-Caching的设计,将内存作为主存,仅将冷数据淘汰到磁盘上,磁盘的角色更像一个“backup”。学术界对于Anti-Caching的研究也是层出不穷,从H-Store孵化出的商业数据库VoltDB到微软的Siberia in Hekaton都提出了各自的解决方案。


Anti-Caching

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Caching和Anti-Caching设计上都是为了解决内存和磁盘速度和容量上的gap。Caching为了加速数据的访问速度缓存了磁盘数据到内存中;Anti-Caching则是为了容量将内存数据“anti-cache”到磁盘上。


Anti-Caching的实现上可以分为以下三类:

  • User-space 在User-space上实现Anti-Caching目前是比较广泛的,同时能够基于应用语义实现Ad-hoc的优化;另一方面从User-space实现Anti-Caching需要绕过OS,带来了一定的overhead。最早提出Anti-Caching的H-Store,是面向高性能的行存内存数据库,它去掉了传统面向磁盘数据库里的Lock、Buffer Management这类比较重的组件,同时基于LRU来做冷数据的Anti-Caching。H-Store维护了tuple级别的LRU访问,同时淘汰粒度上为了减少overhead,将tuple聚合到block级别。为了维护tuple的状态(磁盘还是内存)H-Store用了一张内存的evict table来存储这些meta信息,整体上来看,为了维护LRU对性能不可避免地带来了一定程度上的overhead。Siberia项目也在Hekaton中采用了Anti-Caching的技术,与H-Store维护LRU不同的是,Siberia采用离线分析logging的方式来为tuple的冷热做分类;同时维护了bloom filter来筛选需要访问磁盘的tuple。Siberia的实现在性能上避免了LRU的开销,但是实时性存在一定欠缺,对于内存并不能做到完全精准的控制上界。
  • Kernel-space Virtual memory management(VMM)是大部分OS都支持的功能,可以作为Anti-Caching的一种简单实现手段,但是缺乏了应用层面的语义,Kernel-space的淘汰可能并不能很准确。大体上有两种实现OS Paging的方式,一个是提前配置好swap分区,OS自动做Paging的换入换出应用程序不需要感知。另一种方式是使用memory-mapped文件,这个在MongoDB、MonetDB中广泛使用。
  • Hybrid of user- and kernel-space User-space的方式能够使用应用层的语义优化Ad-hoc的性能;Kernel-space能够针对I/O进行调度同时充分利用硬件特性。AnalyticDB MySQL采用了将user-和kernel-space结合到一起的实现方式。

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AnalyticDB MySQL的BufferManager在文件系统之上,通过mmap维护了一个buffer pool,不同大小的page都可以加载到buffer manager中。当一个page被淘汰出buffer manager时,首先保证该page被写回磁盘成功,随后通过madvise中的MADV_DONTNEED标记来通知内核立刻重用相关的物理内存。


Swizzling Pointer

当page被序列化到磁盘后,系统需要通过逻辑ID (PID)来再次访问对应的page。业界通常的设计是用全局的hashtable来维护PID的映射关系,老版本的AnalyticDB MySQL也不例外。

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然而这类设计在数据规模较大时,存在明显的性能瓶颈;同时早在08年Harizopoulos在SIGMOD发表的paper中就指出TPC-C场景下BufferManager在指令集层面的开销就占用了34.6%。

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为了避免Hash的开销,AnalyticDB MySQL采用了Swizzling Pointer的实现方案,以64bit来存储page的唯一标识;当page在内存中时,头部第一个bit标记为0,其余bit用来表征page的物理地址;当page在磁盘中时,头部第一bit标记为1,后6个bit记录page的size class来计算具体的page大小,剩余的57个bit记录page的PID。


Swizzling Pointer技术上本身带有一定的去中心化属性,避免了全局Hash的开销;同时在新版本的实时存储引擎中,page写盘没有采用传统的lz4、zstd等压缩算法,使得在cpu密集的场景下,性能有大幅的提升。


实时存储引擎性能对比


针对点查以及更新场景,我们选择YCSB测试集来做性能的测试对比。

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相比列存版本的实现,新版本的实时引擎存储格式的优化上对IO的控制有着明显的优势;同时内存控制的优化上大大减少了Cache Miss带来的CPU开销


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引用:

[1] OLTP Through the Looking Glass, and What We Found There

[2] Weaving Relations for Cache Performance

[3] In-Memory Performance for Big Data

[4] Cloud-Native Transactions and Analytics in SingleStore


 / End /  

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