说明:这是一个机器学习实战项目(附带数据+代码+文档+视频讲解),如需数据+代码+文档+视频讲解可以直接到文章最后获取。
1.项目背景
CatBoost是一种基于对称决策树(oblivious trees)为基学习器实现的参数较少、支持类别型变量和高准确性的GBDT框架,主要解决的痛点是高效合理地处理类别型特征,这一点从它的名字中可以看出来,CatBoost是由Categorical和Boosting组成。此外,CatBoost还解决了梯度偏差(Gradient Bias)以及预测偏移(Prediction shift)的问题,从而减少过拟合的发生,进而提高算法的准确性和泛化能力。本文使用CatBoostRegressor来解决回归问题。
2.数据获取
本次建模数据来源于网络(本项目撰写人整理而成),数据项统计如下:
编号 |
变量名称 |
描述 |
1 |
id |
|
2 |
spacegroup |
|
3 |
number_of_total_atoms |
|
4 |
percent_atom_al |
|
5 |
percent_atom_ga |
|
6 |
percent_atom_in |
|
7 |
lattice_vector_1_ang |
|
8 |
lattice_vector_2_ang |
|
9 |
lattice_vector_3_ang |
|
10 |
lattice_angle_alpha_degree |
|
11 |
lattice_angle_beta_degree |
|
12 |
lattice_angle_gamma_degree |
|
13 |
formation_energy_ev_natom |
|
14 |
bandgap_energy_ev |
标签 |
数据详情如下(部分展示):
3.数据预处理
3.1 用Pandas工具查看数据
使用Pandas工具的head()方法查看前五行数据:
从上图可以看到,总共有14个字段:参与机器学习的变量13个,其中id只是一个编号,建模时我们要去掉它。
关键代码:
3.2缺失值统计
使用Pandas工具的info()方法统计每个特征缺失情况:
从上图可以看到,数据不存在缺失值,总数据量为2400条。
关键代码:
3.3变量描述性统计分析
通过Pandas工具的describe()方法来来统计变量的平均值、标准差、最大值、最小值、分位数等信息:
关键代码如下:
4.探索性数据分析
4.1 spacegroup特征分布分析
用Pandas工具的value_counts().plot()方法进行统计绘图,输出结果如下:
图形化展示如下:
从上面两个图中可以看到,分类为206的有490条,分类为33的有432条。
4.2 number_of_total_atoms特征分布分析
从上面两个图中可以看到,分类为80的有1410条,分类为40的有519条。
4.3 相关性分析
通过Pandas工具的corr()方法和seaborn工具的heatmap()方法绘制相关性热力图:
从图中可以看到,正数为正相关,负数为负相关,绝对值越大相关性越强。
4.4 变量的相关关系
从图中可以看到,变量percent_atom_al和变量bandgap_energy_ev呈线性关系。
4.5 bandgap_energy_ev变量直方图
通过Matplotlib工具的hist()方法绘制直方图:
从上图可以看到bandgap_energy_ev变量数据存在右偏现象。
5.特征工程
5.1 建立特征数据和标签数据
bandgap_energy_ev为标签数据,除 id和bandgap_energy_ev之外的为特征数据。关键代码如下:
5.2 数据集拆分
数据集集拆分,分为训练集和测试集,80%训练集和20%测试集。关键代码如下:
6.构建CatBoost回归模型
主要使用CatBoostRegressor算法,用于目标回归。
6.1模型参数
编号 |
模型名称 |
参数 |
1 |
CatBoost回归模型 |
iterations=100 |
2 |
learning_rate=0.03 |
|
3 |
depth=4 |
|
4 |
loss_function='RMSE' |
|
5 |
eval_metric='RMSE' |
|
6 |
random_seed=99 |
|
7 |
od_type='Iter' |
|
8 |
od_wait=50 |
关键代码如下:
7.模型评估
7.1评估指标及结果
评估指标主要包括可解释方差值、平均绝对误差、均方误差、R方值等等。
模型名称 |
指标名称 |
指标值 |
测试集 |
||
CatBoost回归模型 |
可解释方差值 |
0.93 |
平均绝对误差 |
0.18 |
|
均方误差 |
0.06 |
|
R方 |
0.93 |
从上表可以看出,R方为93% 可解释方差值为93%,CatBoost回归模型比较优秀,效果非常好。
关键代码如下:
7.2 模型特征重要性
特征重要性绘图展示:
从上图可以看到特征变量对此模型的重要性依次为:
columns |
feature_importances |
percent_atom_in |
0.344317161 |
percent_atom_al |
0.323864627 |
formation_energy_ev_natom |
0.085339896 |
lattice_vector_3_ang |
0.061193613 |
spacegroup |
0.060865826 |
lattice_angle_alpha_degree |
0.03502702 |
lattice_vector_2_ang |
0.029488005 |
lattice_vector_1_ang |
0.028583657 |
percent_atom_ga |
0.01398625 |
lattice_angle_beta_degree |
0.008160385 |
lattice_angle_gamma_degree |
0.007168071 |
number_of_total_atoms |
0.002005489 |
7.3 真实值与预测值对比图
从上图可以看出真实值和预测值波动基本一致,模型拟合效果非常棒。
8.结论与展望
综上所述,本文采用了CatBoost回归模型,最终证明了我们提出的模型效果良好。
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