魔搭中文开源模型社区:模型即服务-药物设计中的开源AI模型Uni-Fold及Uni-Mol(中)

本文涉及的产品
交互式建模 PAI-DSW,5000CU*H 3个月
简介: 魔搭中文开源模型社区:模型即服务

二、 Uni-Fold概览

 

image.png

 

Uni-Fold为了打破AlphaFold的限制。目前已开源的Uni-Fold训练代码,经过MPI并行、数据异步读取、混合精度训练等优化工作,支持高效GPU训练。

 

基于优化后的训练代码,深势科技团队实现在128块NVIDIA GPU上进行AlphaFold2模型的全规模训练,并将持续优化所得模型。Uni-Fold的推理代码更加轻量、高效,在相同硬件环境下,可获得与公布的Alphafold2代码相比2-3倍的效率提升。

 

image.png

 

在2022年8月,深势科技最新发布的功能是对称蛋白的结构预测。跟据统计,在已知的蛋白结构中,72%的蛋白具有对称结构,包括离子通道、蛋白酶等重要类型对生命科学研究具有重大意义。

 

image.png

 

深势科技长期关注蛋白质折叠方法及其相关应用。自AlphaFold2发布后,深势科技团队第一时间与之对标,研发自主方案Uni-Fold。2021年12月,深势科技推出Uni-Fold v1.0.0,国际首次复现了AlphaFold2官方代码的全尺寸从头训练,并开源了训练与推理代码。

 

今年4月,深势科技于Hermite药物设计平台上线Uni-Fold v1.1.0,将代码框架由JAX迁移至PyTorch,并取得了对AlphaFold精度、速度的“双超越”;今年5月,深势科技上线Uni-Fold v2.0.0,国际首次复现了蛋白复合物结构预测模型AlphaFold-Multimer的全尺寸从头训练,并达到更优精度。

 

伴随新一轮的精度与效率提升,深势科技开源了最新版本Uni-Fold的代码与模型参数。借助本次开源,我们希望与志同道合的伙伴合作互助,共同开发下一代的蛋白质折叠模型。深势科技将继续关注领域最新进展,不断打磨算法与产品,为用户提供更加优质的服务,探索创造更多可能。

 

image.png

 

目前,AlphaFold的代码、模型、数据都已经开放。相关网址,如上图所示。

 

image.png

 

AlphaFold已经在ModelScope社区开源,大家可以在线体验。只要输入一个蛋白序列,就可以预测蛋白结构。

 

image.png

 

除此之外,AlphaFold的数据全部放到了ModelScope社区,用户可以直接使用数据进行训练,无需要任何额外的处理。

 

 

 

 

 

相关文章
|
1天前
|
机器学习/深度学习 人工智能 算法
AI大模型学习理论基础
本文探讨了AI大模型学习的理论基础,包括深度学习(模拟神经元工作原理,通过多层非线性变换提取特征)、神经网络结构(如前馈、循环和卷积网络)、训练方法(监督、无监督、强化学习)、优化算法(如SGD及其变种)、正则化(L1、L2和dropout防止过拟合)以及迁移学习(利用预训练模型加速新任务学习)。这些理论基础推动了AI大模型在复杂任务中的应用和人工智能的发展。
|
4天前
|
人工智能 搜索推荐 决策智能
【AI Agent系列】【阿里AgentScope框架】1. 深入源码:详细解读AgentScope中的智能体定义以及模型配置的流程
【AI Agent系列】【阿里AgentScope框架】1. 深入源码:详细解读AgentScope中的智能体定义以及模型配置的流程
35 0
|
4天前
|
数据采集 存储 人工智能
【AI大模型应用开发】【LangChain系列】实战案例4:再战RAG问答,提取在线网页数据,并返回生成答案的来源
【AI大模型应用开发】【LangChain系列】实战案例4:再战RAG问答,提取在线网页数据,并返回生成答案的来源
29 0
|
4天前
|
数据采集 存储 人工智能
【AI大模型应用开发】【LangChain系列】实战案例2:通过URL加载网页内容 - LangChain对爬虫功能的封装
【AI大模型应用开发】【LangChain系列】实战案例2:通过URL加载网页内容 - LangChain对爬虫功能的封装
14 0
|
4天前
|
人工智能 Python
【AI大模型应用开发】【LangChain系列】实战案例1:用LangChain写Python代码并执行来生成答案
【AI大模型应用开发】【LangChain系列】实战案例1:用LangChain写Python代码并执行来生成答案
9 0
|
机器学习/深度学习 人工智能 自然语言处理
搜狗翻宝Pro机再次开挂,智能翻译硬件成中国人工智能的新风口
第五届世界互联网大会正在如火如荼的举行。
搜狗翻宝Pro机再次开挂,智能翻译硬件成中国人工智能的新风口
|
机器学习/深度学习 人工智能 自然语言处理
与世界同行 2017中国人工智能大会有感
与世界同行 2017中国人工智能大会有感
1543 0
与世界同行 2017中国人工智能大会有感
|
人工智能 自动驾驶
2019年上半年收集到的中国人工智能发展详情文章
2019年上半年收集到的中国人工智能发展详情文章
|
人工智能 芯片
中国人工智能计划,我来说几句
中国人工智能计划,我来说几句
|
机器学习/深度学习 人工智能 自然语言处理
2022 年中国人工智能行业发展现状与市场规模分析 市场规模超 3000 亿元
人工智能产业是智能产业发展的核心,是其他智能科技产品发展的基础,近年来,中国人工智能产业在政策与技术双重驱动下呈现高速增长态势。
1566 0
2022 年中国人工智能行业发展现状与市场规模分析 市场规模超 3000 亿元