几个常见的小技巧加快Pytorch训练速度

简介: 几个常见的小技巧加快Pytorch训练速度

image.png文中讨论的各种优化,都可以在Pytorch-Lightning找到:github.com/williamFalc…


Lightning是基于Pytorch的一个光包装器,它可以帮助研究人员自动训练模型,但关键的模型部件还是由研究人员完全控制。


参照此篇教程,获得更有力的范例:github.com/williamFalc…


Lightning采用最新、最尖端的方法,将犯错的可能性降到最低。


MNIST定义的Lightning模型可适用于训练器:github.com/williamFalc…


**

from pytorch-lightning import Trainer
model = LightningModule(…)
trainer = Trainer()
trainer.fit(model)

1. DataLoader


这可能是最容易提速的地方。靠保存h5py或numpy文件来加速数据加载的日子已经一去不复返了。用 Pytorch dataloader 加载图像数据非常简单:pytorch.org/tutorials/b…

关于NLP数据,请参照TorchText:torchtext.readthedocs.io/en/latest/d…


**

dataset = MNIST(root=self.hparams.data_root, train=train, download=True)
loader = DataLoader(dataset, batch_size=32, shuffle=True)
for batch in loader: 
  x, y = batch
  model.training_step(x, y)
  ...


在Lightning中,你无需指定一个训练循环,只需定义dataLoaders,训练器便会在需要时调用它们。

2. DataLoaders中的进程数


加快速度的第二个秘诀在于允许批量并行加载。所以,你可以一次加载许多批量,而不是一次加载一个。

# slow
loader = DataLoader(dataset, batch_size=32, shuffle=True)
# fast (use 10 workers)
loader = DataLoader(dataset, batch_size=32, shuffle=True, num_workers=10)


3.批量大小(Batch size)


在开始下一步优化步骤之前,将批量大小调高到CPU内存或GPU内存允许的最大值。

接下来的部分将着重于减少内存占用,这样就可以继续增加批尺寸。


记住,你很可能需要再次更新学习率。如果将批尺寸增加一倍,最好将学习速度也提高一倍。


4. 累积梯度


假如已经最大限度地使用了计算资源,而批尺寸仍然太低(假设为8),那我们则需为梯度下降模拟更大的批尺寸,以供精准估计。


假设想让批尺寸达到128。然后,在执行单个优化器步骤前,将执行16次前向和后向传播(批量大小为8)。


# clear last step
optimizer.zero_grad()
# 16 accumulated gradient steps
scaled_loss = 0
for accumulated_step_i in range(16): 
     out = model.forward()
     loss = some_loss(out,y)    
     loss.backward()     
       scaled_loss += loss.item()
# update weights after 8 steps. effective batch = 8*16
optimizer.step()
# loss is now scaled up by the number of accumulated batches
actual_loss = scaled_loss / 16properties

而在Lightning中,这些已经自动执行了。只需设置标记:

trainer = Trainer(accumulate_grad_batches=16)
trainer.fit(model)



5. 保留计算图


撑爆内存很简单,只要不释放指向计算图形的指针,比如……为记录日志保存loss。

losses = []
...
losses.append(loss)
print(f'current loss: )

上述的问题在于,loss仍然有一个图形副本。在这种情况中,可用.item()来释放它。

# bad
losses.append(loss)
# good
losses.append(loss.item())


Lightning会特别注意,让其无法保留图形副本。示例:github.com/williamFalc…



6. 单GPU训练


一旦完成了前面的步骤,就可以进入GPU训练了。GPU的训练将对许多GPU核心上的数学计算进行并行处理。能加速多少取决于使用的GPU类型。个人使用的话,推荐使用2080Ti,公司使用的话可用V100。


刚开始你可能会觉得压力很大,但其实只需做两件事: 1)将你的模型移动到GPU上,2)在用其运行数据时,把数据导至GPU中。


# put model on GPU
model.cuda(0)
# put data on gpu (cuda on a variable returns a cuda copy)
x = x.cuda(0)
# runs on GPU now
model(x)

如果使用Lightning,则不需要对代码做任何操作。只需设置标记:

# ask lightning to use gpu 0 for training
trainer = Trainer(gpus=[0])
trainer.fit(model)

在GPU进行训练时,要注意限制CPU和GPU之间的传输量。

# expensive
x = x.cuda(0)
# very expensive
x = x.cpu()
x = x.cuda(0)

例如,如果耗尽了内存,不要为了省内存,将数据移回CPU。尝试用其他方式优化代码,或者在用这种方法之前先跨GPUs分配代码。


此外还要注意进行强制GPUs同步的操作。例如清除内存缓存。


**


# really bad idea.Stops all the GPUs until they all catch up
torch.cuda.empty_cache()


但是如果使用Lightning,那么只有在定义Lightning模块时可能会出现这种问题。Lightning特别注意避免此类错误。



7. 16位精度


16位精度可以有效地削减一半的内存占用。大多数模型都是用32位精度数进行训练的。然而最近的研究发现,使用16位精度,模型也可以很好地工作。混合精度指的是,用16位训练一些特定的模型,而权值类的用32位训练。


要想在Pytorch中用16位精度,先从NVIDIA中安装 apex 图书馆 并对你的模型进行这些更改。


# enable 16-bit on the model and the optimizer
model, optimizers = amp.initialize(model, optimizers, opt_level='O2')
# when doing .backward, let amp do it so it can scale the loss
with amp.scale_loss(loss, optimizer) as scaled_loss:                       
    scaled_loss.backward()


amp包会处理大部分事情。如果梯度爆炸或趋于零,它甚至会扩大loss。


在Lightning中, 使用16位很简单,不需对你的模型做任何修改,也不用完成上述操作。

**


trainer = Trainer(amp_level=’O2', use_amp=False)
trainer.fit(model)



8. 移至多GPU


现在,事情就变得有意思了。有3种(也许更多?)方式训练多GPU。


  • 分批量训练

image.png


A)在每个GPU上复制模型;B)给每个GPU分配一部分批量。


第一种方法叫做分批量训练。这一策略将模型复制到每个GPU上,而每个GPU会分到该批量的一部分。


# copy model on each GPU and give a fourth of the batch to each
model = DataParallel(model, devices=[0, 1, 2 ,3])
# out has 4 outputs (one for each gpu)
out = model(x.cuda(0))


在Lightning中,可以直接指示训练器增加GPU数量,而无需完成上述任何操作。

# ask lightning to use 4 GPUs for training
trainer = Trainer(gpus=[0, 1, 2, 3])
trainer.fit(model)

image.png


将模型的不同部分分配给不同的GPU,按顺序分配批量


有时模型可能太大,内存不足以支撑。比如,带有编码器和解码器的Sequence to Sequence模型在生成输出时可能会占用20gb的内存。在这种情况下,我们希望把编码器和解码器放在单独的GPU上。


# each model is sooo big we can't fit both in memory
encoder_rnn.cuda(0)
decoder_rnn.cuda(1)
# run input through encoder on GPU 0
out = encoder_rnn(x.cuda(0))
# run output through decoder on the next GPU
out = decoder_rnn(x.cuda(1))
# normally we want to bring all outputs back to GPU 0
out = out.cuda(0)


对于这种类型的训练,无需将Lightning训练器分到任何GPU上。与之相反,只要把自己的模块导入正确的GPU的Lightning模块中:

class MyModule(LightningModule):
def __init__(): 
        self.encoder = RNN(...)
        self.decoder = RNN(...)
def forward(x):
    # models won't be moved after the first forward because 
        # they are already on the correct GPUs
        self.encoder.cuda(0)
        self.decoder.cuda(1)     
out = self.encoder(x)
        out = self.decoder(out.cuda(1))
# don't pass GPUs to trainer
model = MyModule()
trainer = Trainer()
trainer.fit(model)


  • 混合两种训练方法


在上面的例子中,编码器和解码器仍然可以从并行化每个操作中获益。我们现在可以更具创造力了。


**

# change these lines
self.encoder = RNN(...)
self.decoder = RNN(...)
# to these
# now each RNN is based on a different gpu set
self.encoder = DataParallel(self.encoder, devices=[0, 1, 2, 3])
self.decoder = DataParallel(self.encoder, devices=[4, 5, 6, 7])
# in forward...
out = self.encoder(x.cuda(0))
# notice inputs on first gpu in device
sout = self.decoder(out.cuda(4))  # <--- the 4 here
  • 使用多GPUs时需注意的事项


  • 如果该设备上已存在model.cuda(),那么它不会完成任何操作。


  • 始终输入到设备列表中的第一个设备上。


  • 跨设备传输数据非常昂贵,不到万不得已不要这样做。


  • 优化器和梯度将存储在GPU 0上。因此,GPU 0使用的内存很可能比其他处理器大得多。


9. 多节点GPU训练

image.png



每台机器上的各GPU都可获取一份模型的副本。每台机器分得一部分数据,并仅针对该部分数据进行训练。各机器彼此同步梯度。


做到了这一步,就可以在几分钟内训练Imagenet数据集了! 这没有想象中那么难,但需要更多有关计算集群的知识。这些指令假定你正在集群上使用SLURM。


Pytorch在各个GPU上跨节点复制模型并同步梯度,从而实现多节点训练。因此,每个模型都是在各GPU上独立初始化的,本质上是在数据的一个分区上独立训练的,只是它们都接收来自所有模型的梯度更新。


高级阶段:


1.  在各GPU上初始化一个模型的副本(确保设置好种子,使每个模型初始化到相同的权值,否则操作会失效。)


2.  将数据集分成子集。每个GPU只在自己的子集上训练。


3.  On .backward() 所有副本都会接收各模型梯度的副本。只有此时,模型之间才会相互通信。


Pytorch有一个很好的抽象概念,叫做分布式数据并行处理,它可以为你完成这一操作。要使用DDP(分布式数据并行处理),需要做4件事:

def tng_dataloader():
d = MNIST()
     # 4: Add distributed sampler
     # sampler sends a portion of tng data to each machine
     dist_sampler = DistributedSampler(dataset)
     dataloader = DataLoader(d, shuffle=False, sampler=dist_sampler)
def main_process_entrypoint(gpu_nb): 
     # 2: set up connections  between all gpus across all machines
     # all gpus connect to a single GPU "root"
     # the default uses env://
     world = nb_gpus * nb_nodes
     dist.init_process_group("nccl", rank=gpu_nb, world_size=world)
     # 3: wrap model in DPP
     torch.cuda.set_device(gpu_nb)
     model.cuda(gpu_nb)
     model = DistributedDataParallel(model, device_ids=[gpu_nb])
     # train your model now...
if  __name__ == '__main__': 
     # 1: spawn number of processes
     # your cluster will call main for each machine
     mp.spawn(main_process_entrypoint, nprocs=8)


Pytorch团队对此有一份详细的实用教程:github.com/pytorch/exa…


然而,在Lightning中,这是一个自带功能。只需设定节点数标志,其余的交给Lightning处理就好。


# train on 1024 gpus across 128 nodes
trainer = Trainer(nb_gpu_nodes=128, gpus=[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7])


Lightning还附带了一个SlurmCluster管理器,可助你简单地提交SLURM任务的正确细节。示例:github.com/williamFalc…


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