(7)文件顺利执行,得出结果:
评估后得出结果:
loss=0.6918540149927139.acc=0.46750000305473804
可以看出效果并不是很理想,需要进一步调整学习率优化准确度
结论
在老师布置了创新创业大作业以后,我便开始选择题目,在浏览了十多题后,我最终选择了眼疾识别问题作为此次创新创业课程设计的大作业。如今近视已经成为困扰人们健康的一项全球性负担,在近视人群中,有超过35%的人患有重度近视。因此,及早发现近视患者眼睛的病变并采取治疗,显得非常重要。定题后,我便开始后面的设计。
我们是这学期学的Python语言和百度Paddle人工智能平台,一下子接触很多新的概念,多多少少有点不适应,平时忙着复习预习物理数学等科目,就仅仅周末有一些时间练习Python语言和百度Paddle人工智能平台,于是把paddle平台和python的训练给丢下了,在最后一个月,才开始抓紧学习两个平台的搭配使用。
从Paddle平台获得程序后,我首先下载平台提供的数据集,并对已完成的代码更改程序中打开的本地文件地址。
在检查好滴之后,第一次运行,出现了左右两只眼球的图,把我高兴坏了,但高兴没过一会儿,出现了一个文件报错,内容是:invalid literal for int() with base 10: '' 从CSDN上检索了相关问题的解决办法,首先尝试的是将数据先转为float类型,再用int函数强行变为整型,但是发现改正后运行还是继续报错,报错内容为:ValueError: could not convert string to float: '' 这个时候,心里是有点害怕的,到底是接着int(float())改还是退回int()改,再冷静思考后,我决定还是退回int()改,以防代码出现大面积更换,不利于后期程序运行和理解。
在CSDN上继续检索后,又发现一个解决的方案,就是用pass函数跳过,
将代码处理后,再次运行,完美得到结果,并且没有出现任何大面积的程序改动。
顿时,好像一下子从暗无天日的盲目中找到了方向,心中一下子开阔起来。
这个过程出现了曲折大致可以认为是编程软件的更新,以及本地环境的不匹配导致的,网上很多的代码的都是基于个人本地环境实现的,相关的代码我不能直接套用,针对这个问题,我首先是阅读他的程序,判断哪些是我能自主修改最终能在我本地运行的。
检阅python相关的语法,接着学习paddle的使用方法,在进行改码时,还是出现了很多错误,在一遍遍的修改查资料后,还是不能一下子就很快地将程序调出来,这个时候我们想到了学长,在学长的指导下,我们很快地找到了问题的症结———相关文件尺寸的问题。
接下来的过程就很轻松,一遍遍的运行代码,一遍遍的优化代码,最终获得了实验得出最优的眼疾识别代码。
最后一点最重要的体会就是:要学会查找资料,要学会请教他人,学会坚持和钻研。不要怕!不要悔!
五、参考文献
1、代码高亮处理http://www.codeinword.com
2、paddle人工智能平台飞桨PaddlePaddle-源于产业实践的开源深度学习平台
3、第一次处理方法https://blog.csdn.net/weixin_44034883/article/details/112918440
4、第二次处理办法
六、以下是完整代码:
- import os
- import numpy as np
- import matplotlib.pyplot as plt
- from PIL import Image
- DATADIR = '/Users/suncheng/PycharmProjects/测试/MNIST数据集/眼疾识别/PALM-Training400/PALM-Training400'
- # 文件名以N开头的是正常眼底图片,以P开头的是病变眼底图片
- file1 = '/Users/suncheng/PycharmProjects/测试/MNIST数据集/眼疾识别/PALM-Training400/PALM-Training400/N0012.jpg'
- file2 = '/Users/suncheng/PycharmProjects/测试/MNIST数据集/眼疾识别/PALM-Training400/PALM-Training400/P0095.jpg'
- # 读取图片
- img1 = Image.open(os.path.join(DATADIR, file1))
- img1 = np.array(img1)
- img2 = Image.open(os.path.join(DATADIR, file2))
- img2 = np.array(img2)
- # 画出读取的图片
- plt.figure(figsize=(16, 8))
- f = plt.subplot(121)
- f.set_title('Normal', fontsize=20)
- plt.imshow(img1)
- f = plt.subplot(122)
- f.set_title('PM', fontsize=20)
- plt.imshow(img2)
- plt.show()
- import cv2
- import random
- import numpy as np
- import os
- # 对读入的图像数据进行预处理
- def transform_img(img):
- # 将图片尺寸缩放道 224x224
- img = cv2.resize(img, (224, 224))
- # 读入的图像数据格式是[H, W, C]
- # 使用转置操作将其变成[C, H, W]
- img = np.transpose(img, (2,0,1))
- img = img.astype('float32')
- # 将数据范围调整到[-1.0, 1.0]之间
- img = img / 255.
- img = img * 2.0 - 1.0
- return img
- # 定义训练集数据读取器
- def data_loader(datadir, batch_size=10, mode = 'train'):
- # 将datadir目录下的文件列出来,每条文件都要读入
- filenames = os.listdir(datadir)
- def reader():
- if mode == 'train':
- # 训练时随机打乱数据顺序
- random.shuffle(filenames)
- batch_imgs = []
- batch_labels = []
- for name in filenames:
- filepath = os.path.join(datadir, name)
- img = cv2.imread(filepath)
- img = transform_img(img)
- if name[0] == 'H' or name[0] == 'N':
- # H开头的文件名表示高度近似,N开头的文件名表示正常视力
- # 高度近视和正常视力的样本,都不是病理性的,属于负样本,标签为0
- label = 0
- elif name[0] == 'P':
- # P开头的是病理性近视,属于正样本,标签为1
- label = 1
- else:
- raise('Not excepted file name')
- # 每读取一个样本的数据,就将其放入数据列表中
- batch_imgs.append(img)
- batch_labels.append(label)
- if len(batch_imgs) == batch_size:
- # 当数据列表的长度等于batch_size的时候,
- # 把这些数据当作一个mini-batch,并作为数据生成器的一个输出
- imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
- labels_array = np.array(batch_labels).astype('float32').reshape(-1, 1)
- yield imgs_array, labels_array
- batch_imgs = []
- batch_labels = []
- if len(batch_imgs) > 0:
- # 剩余样本数目不足一个batch_size的数据,一起打包成一个mini-batch
- imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
- labels_array = np.array(batch_labels).astype('float32').reshape(-1, 1)
- yield imgs_array, labels_array
- return reader
- # 定义验证集数据读取器
- def valid_data_loader(datadir, csvfile, batch_size=10, mode='valid'):
- # 训练集读取时通过文件名来确定样本标签,验证集则通过csvfile来读取每个图片对应的标签
- # 请查看解压后的验证集标签数据,观察csvfile文件里面所包含的内容
- # csvfile文件所包含的内容格式如下,每一行代表一个样本,
- # 其中第一列是图片id,第二列是文件名,第三列是图片标签,
- # 第四列和第五列是Fovea的坐标,与分类任务无关
- # ID,imgName,Label,Fovea_X,Fovea_Y
- # 1,V0001.jpg,0,1157.74,1019.87
- # 2,V0002.jpg,1,1285.82,1080.47
- # 打开包含验证集标签的csvfile,并读入其中的内容
- filelists = open(csvfile).readlines()
- def reader():
- batch_imgs = []
- batch_labels = []
- for line in filelists[1:]:
- line = line.strip().split(',')
- name = line[1]
- try:
- label = int(line[2])
- except ValueError as e:
- pass
- else:
- # 根据图片文件名加载图片,并对图像数据作预处理
- filepath = os.path.join(datadir, name)
- img = cv2.imread(filepath)
- img = transform_img(img)
- # 每读取一个样本的数据,就将其放入数据列表中
- batch_imgs.append(img)
- batch_labels.append(label)
- if len(batch_imgs) == batch_size:
- # 当数据列表的长度等于batch_size的时候,
- # 把这些数据当作一个mini-batch,并作为数据生成器的一个输出
- imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
- labels_array = np.array(batch_labels).astype('float32').reshape(-1, 1)
- yield imgs_array, labels_array
- batch_imgs = []
- batch_labels = []
- if len(batch_imgs) > 0:
- # 剩余样本数目不足一个batch_size的数据,一起打包成一个mini-batch
- imgs_array = np.array(batch_imgs).astype('float32')
- labels_array = np.array(batch_labels).astype('float32').reshape(-1, 1)
- yield imgs_array, labels_array
- return reader
- # 查看数据形状
- DATADIR = '/Users/suncheng/PycharmProjects/测试/MNIST数据集/眼疾识别/PALM-Training400/PALM-Training400'
- train_loader = data_loader(DATADIR,
- batch_size=10, mode='train')
- data_reader = train_loader()
- data = next(data_reader)
- data[0].shape, data[1].shape
- eval_loader = data_loader(DATADIR,
- batch_size=10, mode='eval')
- data_reader = eval_loader()
- data = next(data_reader)
- data[0].shape, data[1].shape
- # LeNet 识别眼疾图片
- import os
- import random
- import paddle
- import numpy as np
- DATADIR = '/Users/suncheng/PycharmProjects/测试/MNIST数据集/眼疾识别/PALM-Training400/PALM-Training400'
- DATADIR2 = '/Users/suncheng/PycharmProjects/测试/MNIST数据集/眼疾识别/PALM-Validation400'
- CSVFILE = '/Users/suncheng/PycharmProjects/测试/MNIST数据集/眼疾识别/PALM-Validation-GT/labels.csv'
- # 定义训练过程
- def train_pm(model, optimizer):
- # 开启0号GPU训练
- use_gpu = False
- paddle.set_device('gpu:0') if use_gpu else paddle.set_device('cpu')
- print('start training ... ')
- model.train()
- epoch_num = 5
- # 定义数据读取器,训练数据读取器和验证数据读取器
- train_loader = data_loader(DATADIR, batch_size=10, mode='train')
- valid_loader = valid_data_loader(DATADIR2, CSVFILE)
- for epoch in range(epoch_num):
- for batch_id, data in enumerate(train_loader()):
- x_data, y_data = data
- img = paddle.to_tensor(x_data)
- label = paddle.to_tensor(y_data)
- # 运行模型前向计算,得到预测值
- logits = model(img)
- loss = F.binary_cross_entropy_with_logits(logits, label)
- avg_loss = paddle.mean(loss)
- if batch_id % 10 == 0:
- print("epoch: {}, batch_id: {}, loss is: {}".format(epoch, batch_id, avg_loss.numpy()))
- # 反向传播,更新权重,清除梯度
- avg_loss.backward()
- optimizer.step()
- optimizer.clear_grad()
- model.eval()
- accuracies = []
- losses = []
- for batch_id, data in enumerate(valid_loader()):
- x_data, y_data = data
- img = paddle.to_tensor(x_data)
- label = paddle.to_tensor(y_data)
- # 运行模型前向计算,得到预测值
- logits = model(img)
- # 二分类,sigmoid计算后的结果以0.5为阈值分两个类别
- # 计算sigmoid后的预测概率,进行loss计算
- pred = F.sigmoid(logits)
- loss = F.binary_cross_entropy_with_logits(logits, label)
- # 计算预测概率小于0.5的类别
- pred2 = pred * (-1.0) + 1.0
- # 得到两个类别的预测概率,并沿第一个维度级联
- pred = paddle.concat([pred2, pred], axis=1)
- acc = paddle.metric.accuracy(pred, paddle.cast(label, dtype='int64'))
- accuracies.append(acc.numpy())
- losses.append(loss.numpy())
- print("[validation] accuracy/loss: {}/{}".format(np.mean(accuracies), np.mean(losses)))
- model.train()
- paddle.save(model.state_dict(), '眼疾识别.pdparams')
- paddle.save(optimizer.state_dict(), '眼疾识别.pdopt')
- # 定义评估过程
- def evaluation(model, params_file_path):
- # 开启0号GPU预估
- use_gpu = False
- paddle.set_device('gpu:0') if use_gpu else paddle.set_device('cpu')
- print('start evaluation .......')
- #加载模型参数
- model_state_dict = paddle.load(params_file_path)
- model.load_dict(model_state_dict)
- model.eval()
- eval_loader = data_loader(DATADIR,
- batch_size=10, mode='eval')
- acc_set = []
- avg_loss_set = []
- for batch_id, data in enumerate(eval_loader()):
- x_data, y_data = data
- img = paddle.to_tensor(x_data)
- label = paddle.to_tensor(y_data)
- y_data = y_data.astype(np.int64)
- label_64 = paddle.to_tensor(y_data)
- # 计算预测和精度
- prediction, acc = model(img, label_64)
- # 计算损失函数值
- loss = F.binary_cross_entropy_with_logits(prediction, label)
- avg_loss = paddle.mean(loss)
- acc_set.append(float(acc.numpy()))
- avg_loss_set.append(float(avg_loss.numpy()))
- # 求平均精度
- acc_val_mean = np.array(acc_set).mean()
- avg_loss_val_mean = np.array(avg_loss_set).mean()
- print('loss={}, acc={}'.format(avg_loss_val_mean, acc_val_mean))
- # -*- coding:utf-8 -*-
- # 导入需要的包
- import paddle
- import numpy as np
- from paddle.nn import Conv2D, MaxPool2D, Linear, Dropout
- import paddle.nn.functional as F
- # 定义 LeNet 网络结构
- class LeNet(paddle.nn.Layer):
- def __init__(self, num_classes=1):
- super(LeNet, self).__init__()
- # 创建卷积和池化层块,每个卷积层使用Sigmoid激活函数,后面跟着一个2x2的池化
- self.conv1 = Conv2D(in_channels=3, out_channels=6, kernel_size=5)
- self.max_pool1 = MaxPool2D(kernel_size=2, stride=2)
- self.conv2 = Conv2D(in_channels=6, out_channels=16, kernel_size=5)
- self.max_pool2 = MaxPool2D(kernel_size=2, stride=2)
- # 创建第3个卷积层
- self.conv3 = Conv2D(in_channels=16, out_channels=120, kernel_size=4)
- # 创建全连接层,第一个全连接层的输出神经元个数为64
- self.fc1 = Linear(in_features=300000, out_features=64)
- # 第二个全连接层输出神经元个数为分类标签的类别数
- self.fc2 = Linear(in_features=64, out_features=num_classes)
- # 网络的前向计算过程
- def forward(self, x, label=None):
- x = self.conv1(x)
- x = F.sigmoid(x)
- x = self.max_pool1(x)
- x = self.conv2(x)
- x = F.sigmoid(x)
- x = self.max_pool2(x)
- x = self.conv3(x)
- x = F.sigmoid(x)
- x = paddle.reshape(x, [x.shape[0], -1])
- x = self.fc1(x)
- x = F.sigmoid(x)
- x = self.fc2(x)
- if label is not None:
- acc = paddle.metric.accuracy(input=x, label=label)
- return x, acc
- else:
- return x
- # 创建模型
- model = LeNet(num_classes=1)
- # 启动训练过程
- opt = paddle.optimizer.Momentum(learning_rate=0.001, momentum=0.9, parameters=model.parameters())
- train_pm(model, opt)
- evaluation(model, params_file_path="眼疾识别.pdparams")