最常使用的数据挖掘算法——决策树

简介: 决策树(Decision Tree)算法主要用来处理分类问题,是最经常使用的数据挖掘算法之一。

决策树(Decision Tree)算法主要用来处理分类问题,是最经常使用的数据挖掘算法之一。

一、决策树 场景

一个叫做 "二十个问题" 的游戏,游戏的规则很简单:参与游戏的一方在脑海中想某个事物,其他参与者向他提问,只允许提 20 个问题,问题的答案也只能用对或错回答。问问题的人通过推断分解,逐步缩小待猜测事物的范围,最后得到游戏的答案。

一个邮件分类系统,大致工作流程如下:

image.png

首先检测发送邮件域名地址。如果地址为 myEmployer.com, 则将其放在分类 "无聊时需要阅读的邮件"中。

如果邮件不是来自这个域名,则检测邮件内容里是否包含单词 "曲棍球" , 如果包含则将邮件归类到 "需要及时处理的朋友邮件", 如果不包含则将邮件归类到 "无需阅读的垃圾邮件" 。

二、决策树 原理

1、决策树 须知概念

信息熵 & 信息增益

熵: 熵(entropy)指的是体系的混乱的程度,在不同的学科中也有引申出的更为具体的定义,是各领域十分重要的参量。

信息熵(香农熵): 是一种信息的度量方式,表示信息的混乱程度,也就是说:信息越有序,信息熵越低。例如:火柴有序放在火柴盒里,熵值很低,相反,熵值很高。

信息增益: 在划分数据集前后信息发生的变化称为信息增益。

2、决策树工作原理

如何构造一个决策树? 我们使用 createBranch() 方法,如下所示:

检测数据集中的所有数据的分类标签是否相同:
    If so return 类标签
    Else:
        寻找划分数据集的最好特征(划分之后信息熵最小,也就是信息增益最大的特征)
        划分数据集
        创建分支节点
            for 每个划分的子集
                调用函数 createBranch (创建分支的函数)并增加返回结果到分支节点中
        return 分支节点

3、决策树开发流程

  • 收集数据:可以使用任何方法。
  • 准备数据:树构造算法只适用于标称型数据,因此数值型数据必须离散化。
  • 分析数据:可以使用任何方法,构造树完成之后,我们应该检查图形是否符合预期。
  • 训练算法:构造树的数据结构。
  • 测试算法:使用经验树计算错误率。(经验树没有搜索到较好的资料,有兴趣的同学可以来补充)
  • 使用算法:此步骤可以适用于任何监督学习算法,而使用决策树可以更好地理解数据的内在含义。

4、决策树算法特点

优点:计算复杂度不高,输出结果易于理解,对中间值的缺失不敏感,可以处理不相关特征数据。

缺点:可能会产生过度匹配问题。

适用数据类型:数值型和标称型。

三、决策树 Demo演示

Demo1:决策树分类-鸢尾花数据

#!/usr/bin/python
# coding:utf-8

"""
Created on 2017-06-29
Updated on 2017-06-29
DecisionTree:决策树
@author: 小瑶
《机器学习实战》更新地址:https://github.com/apachecn/MachineLearning
"""
#print(__doc__)

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
%matplotlib inline

# 参数
n_classes = 3
plot_colors = "bmy"
plot_step = 0.02

# 加载数据
iris = load_iris()

for pairidx, pair in enumerate([[0, 1], [0, 2], [0, 3], [1, 2], [1, 3], [2, 3]]):
#for pairidx, pair in enumerate([[0, 1]]):
# 我们只用两个相应的features
    X = iris.data[:, pair]
    y = iris.target

    # 训练
    clf = DecisionTreeClassifier().fit(X, y)

    # 绘制决策边界
    plt.subplot(2, 3, pairidx + 1)
    #plt.subplot(1, 1, pairidx + 1)

    x_min, x_max = X[:, 0].min() - 1, X[:, 0].max() + 1
    y_min, y_max = X[:, 1].min() - 1, X[:, 1].max() + 1
    xx, yy = np.meshgrid(np.arange(x_min, x_max, plot_step),
                         np.arange(y_min, y_max, plot_step))

    Z = clf.predict(np.c_[xx.ravel(), yy.ravel()])
    Z = Z.reshape(xx.shape)
    cs = plt.contourf(xx, yy, Z, cmap=plt.cm.Paired)

    plt.xlabel(iris.feature_names[pair[0]])
    plt.ylabel(iris.feature_names[pair[1]])
    plt.axis("tight")

    # 绘制训练点
    for i, color in zip(range(n_classes), plot_colors):
        idx = np.where(y == i)
        plt.scatter(X[idx, 0], X[idx, 1], c=color, label=iris.target_names[i],
                    cmap=plt.cm.Paired)

    plt.axis("tight")

plt.suptitle("Decision surface of a decision tree using paired features")
plt.legend()
plt.show()

image.png

image.png


Demo2: 决策树 回归

#!/usr/bin/python
# coding:utf8

"""
Created on 2017-06-29
Updated on 2017-06-29
DecisionTree:决策树
@author: 小瑶
《机器学习实战》更新地址:https://github.com/apachecn/MachineLearning
"""

print(__doc__)

# 引入必要的模型和库
import numpy as np
from sklearn.tree import DecisionTreeRegressor
import matplotlib.pyplot as plt

# 创建一个随机的数据集
# 参考 https://docs.scipy.org/doc/numpy-1.6.0/reference/generated/numpy.random.mtrand.RandomState.html
rng = np.random.RandomState(1)
# print 'lalalalala===', rng
# rand() 是给定形状的随机值,rng.rand(80, 1)即矩阵的形状是 80行,1列
# sort() 
X = np.sort(5 * rng.rand(80, 1), axis=0)
# print 'X=', X
y = np.sin(X).ravel()
# print 'y=', y
y[::5] += 3 * (0.5 - rng.rand(16))
# print 'yyy=', y

# 拟合回归模型
# regr_1 = DecisionTreeRegressor(max_depth=2)
# 保持 max_depth=5 不变,增加 min_samples_leaf=6 的参数,效果进一步提升了
regr_2 = DecisionTreeRegressor(max_depth=5)
regr_2 = DecisionTreeRegressor(min_samples_leaf=6)
# regr_3 = DecisionTreeRegressor(max_depth=4)
# regr_1.fit(X, y)
regr_2.fit(X, y)
# regr_3.fit(X, y)

# 预测
X_test = np.arange(0.0, 5.0, 0.01)[:, np.newaxis]
# y_1 = regr_1.predict(X_test)
y_2 = regr_2.predict(X_test)
# y_3 = regr_3.predict(X_test)

# 绘制结果
plt.figure()
plt.scatter(X, y, c="darkorange", label="data")
# plt.plot(X_test, y_1, color="cornflowerblue", label="max_depth=2", linewidth=2)
plt.plot(X_test, y_2, color="yellowgreen", label="max_depth=5", linewidth=2)
# plt.plot(X_test, y_3, color="red", label="max_depth=3", linewidth=2)
plt.xlabel("data")
plt.ylabel("target")
plt.title("Decision Tree Regression")
plt.legend()
plt.show()

image.png

image.png

4、决策树 项目案例

项目案例1: 判定鱼类和非鱼类

1、项目概述:

根据以下2个特征,将动物分成两类:鱼类和非鱼类。

特征:

不浮出水面是否可以生存

是否有脚蹼

2、开发流程

收集数据:可以使用任何方法

准备数据:树构造算法只适用于标称型数据,因此数值型数据必须离散化

分析数据:可以使用任何方法,构造树完成之后,我们应该检查图形是否符合预期

训练算法:构造树的数据结构

测试算法:使用决策树执行分类

使用算法:此步骤可以适用于任何监督学习算法,而使用决策树可以更好地理解数据的内在含义

1 数据收集:可以使用任何方法
image.png

我们利用 createDataSet() 函数输入数据

def createDataSet():
    dataSet = [[1, 1, 'yes'],
            [1, 1, 'yes'],
            [1, 0, 'no'],
            [0, 1, 'no'],
            [0, 1, 'no']]
    labels = ['no surfacing', 'flippers']
    return dataSet, labels

2 准备数据:树构造算法只适用于标称型数据,因此数值型数据必须离散化,此处,由于我们输入的数据本身就是离散化数据,所以这一步就省略了。

3 分析数据:可以使用任何方法,构造树完成之后,我们应该检查图形是否符合预期
image.png

计算给定数据集的香农熵的函数

def calcShannonEnt(dataSet):
    """
    Desc:
        calculate Shannon entropy -- 计算给定数据集的香农熵
    Args:
        dataSet -- 数据集
    Returns:
        shannonEnt -- 返回 每一组 feature 下的某个分类下,香农熵的信息期望
    """
    # -----------计算香农熵的第一种实现方式start------------------------------------------------
    # 求list的长度,表示计算参与训练的数据量
    numEntries = len(dataSet)
    # 下面输出我们测试的数据集的一些信息
    # 例如:<type 'list'> numEntries:  5 是下面的代码的输出
    # print(type(dataSet), 'numEntries: ', numEntries)

    # 计算分类标签label出现的次数
    labelCounts = {}
    # the the number of unique elements and their occurance
    for featVec in dataSet:
        # 将当前实例的标签存储,即每一行数据的最后一个数据代表的是标签
        currentLabel = featVec[-1]
        # 为所有可能的分类创建字典,如果当前的键值不存在,则扩展字典并将当前键值加入字典。每个键值都记录了当前类别出现的次数。
        if currentLabel not in labelCounts.keys():
            labelCounts[currentLabel] = 0
        labelCounts[currentLabel] += 1
        # print('-----', featVec, labelCounts)

    # 对于label标签的占比,求出label标签的香农熵
    shannonEnt = 0.0
    for key in labelCounts:
        # 使用所有类标签的发生频率计算类别出现的概率。
        prob = float(labelCounts[key])/numEntries
        # log base 2
        # 计算香农熵,以 2 为底求对数
        shannonEnt -= prob * log(prob, 2)
        # print('---', prob, prob * log(prob, 2), shannonEnt)
    # -----------计算香农熵的第一种实现方式end--------------------------------------------------

    # # -----------计算香农熵的第二种实现方式start----------------------------------------------
    # # 统计标签出现的次数
    # label_count = Counter(data[-1] for data in dataSet)
    # # 计算概率
    # probs = [p[1] / len(dataSet) for p in label_count.items()]
    # # 计算香农熵
    # shannonEnt = sum([-p * log(p, 2) for p in probs])
    # # -----------计算香农熵的第二种实现方式end--------------------------------------------------------------------------------
    return shannonEnt

按照给定特征划分数据集

将指定特征的特征值等于 value 的行剩下列作为子数据集。

def splitDataSet(dataSet, index, value):
    """splitDataSet(通过遍历dataSet数据集,求出index对应的colnum列的值为value的行)
        就是依据index列进行分类,如果index列的数据等于 value的时候,就要将 index 划分到我们创建的新的数据集中
    Args:
        dataSet 数据集                 待划分的数据集
        index 表示每一行的index列        划分数据集的特征
        value 表示index列对应的value值   需要返回的特征的值。
    Returns:
        index列为value的数据集【该数据集需要排除index列】
    """
    retDataSet = []
    for featVec in dataSet: 
        # index列为value的数据集【该数据集需要排除index列】
        # 判断index列的值是否为value
        if featVec[index] == value:
            # chop out index used for splitting
            # [:index]表示前index行,即若 index 为2,就是取 featVec 的前 index 行
            reducedFeatVec = featVec[:index]
            '''
            请百度查询一下: extend和append的区别
            list.append(object) 向列表中添加一个对象object
            list.extend(sequence) 把一个序列seq的内容添加到列表中
            1、使用append的时候,是将new_media看作一个对象,整体打包添加到music_media对象中。
            2、使用extend的时候,是将new_media看作一个序列,将这个序列和music_media序列合并,并放在其后面。
            result = []
            result.extend([1,2,3])
            print result
            result.append([4,5,6])
            print result
            result.extend([7,8,9])
            print result
            结果:
            [1, 2, 3]
            [1, 2, 3, [4, 5, 6]]
            [1, 2, 3, [4, 5, 6], 7, 8, 9]
            '''
            reducedFeatVec.extend(featVec[index+1:])
            # [index+1:]表示从跳过 index 的 index+1行,取接下来的数据
            # 收集结果值 index列为value的行【该行需要排除index列】
            retDataSet.append(reducedFeatVec)
    return retDataSet

选择最好的数据集划分方式

def chooseBestFeatureToSplit(dataSet):
    """chooseBestFeatureToSplit(选择最好的特征)

    Args:
        dataSet 数据集
    Returns:
        bestFeature 最优的特征列
    """
    # 求第一行有多少列的 Feature, 最后一列是label列嘛
    numFeatures = len(dataSet[0]) - 1
    # 数据集的原始信息熵
    baseEntropy = calcShannonEnt(dataSet)
    # 最优的信息增益值, 和最优的Featurn编号
    bestInfoGain, bestFeature = 0.0, -1
    # iterate over all the features
    for i in range(numFeatures):
        # create a list of all the examples of this feature
        # 获取对应的feature下的所有数据
        featList = [example[i] for example in dataSet]
        # get a set of unique values
        # 获取剔重后的集合,使用set对list数据进行去重
        uniqueVals = set(featList)
        # 创建一个临时的信息熵
        newEntropy = 0.0
        # 遍历某一列的value集合,计算该列的信息熵 
        # 遍历当前特征中的所有唯一属性值,对每个唯一属性值划分一次数据集,计算数据集的新熵值,并对所有唯一特征值得到的熵求和。
        for value in uniqueVals:
            subDataSet = splitDataSet(dataSet, i, value)
            # 计算概率
            prob = len(subDataSet)/float(len(dataSet))
            # 计算信息熵
            newEntropy += prob * calcShannonEnt(subDataSet)
        # gain[信息增益]: 划分数据集前后的信息变化, 获取信息熵最大的值
        # 信息增益是熵的减少或者是数据无序度的减少。最后,比较所有特征中的信息增益,返回最好特征划分的索引值。
        infoGain = baseEntropy - newEntropy
        print ('infoGain=', infoGain, 'bestFeature=', i, baseEntropy, newEntropy)
        if (infoGain > bestInfoGain):
            bestInfoGain = infoGain
            bestFeature = i
    return bestFeature

问:上面的 newEntropy 为什么是根据子集计算的呢?
答:因为我们在根据一个特征计算香农熵的时候,该特征的分类值是相同,这个特征这个分类的香农熵为 0; 这就是为什么计算新的香农熵的时候使用的是子集。

4 训练算法:构造树的数据结构

创建树的函数代码如下:

def createTree(dataSet, labels):
    """
    Desc:
        创建决策树
    Args:
        dataSet -- 要创建决策树的训练数据集
        labels -- 训练数据集中特征对应的含义的labels,不是目标变量
    Returns:
        myTree -- 创建完成的决策树
    """
    classList = [example[-1] for example in dataSet]
    # 如果数据集的最后一列的第一个值出现的次数=整个集合的数量,也就说只有一个类别,就只直接返回结果就行
    # 第一个停止条件:所有的类标签完全相同,则直接返回该类标签。
    # count() 函数是统计括号中的值在list中出现的次数
    if classList.count(classList[0]) == len(classList):
        return classList[0]
    # 如果数据集只有1列,那么最初出现label次数最多的一类,作为结果
    # 第二个停止条件:使用完了所有特征,仍然不能将数据集划分成仅包含唯一类别的分组。
    if len(dataSet[0]) == 1:
        return majorityCnt(classList)

    # 选择最优的列,得到最优列对应的label含义
    bestFeat = chooseBestFeatureToSplit(dataSet)
    # 获取label的名称
    bestFeatLabel = labels[bestFeat]
    # 初始化myTree
    myTree = {bestFeatLabel: {}}
    # 注:labels列表是可变对象,在PYTHON函数中作为参数时传址引用,能够被全局修改
    # 所以这行代码导致函数外的同名变量被删除了元素,造成例句无法执行,提示'no surfacing' is not in list
    del(labels[bestFeat])
    # 取出最优列,然后它的branch做分类
    featValues = [example[bestFeat] for example in dataSet]
    uniqueVals = set(featValues)
    for value in uniqueVals:
        # 求出剩余的标签label
        subLabels = labels[:]
        # 遍历当前选择特征包含的所有属性值,在每个数据集划分上递归调用函数createTree()
        myTree[bestFeatLabel][value] = createTree(splitDataSet(dataSet, bestFeat, value), subLabels)
        # print('myTree', value, myTree)
    return myTree

5 测试算法:使用决策树执行分类

def classify(inputTree, featLabels, testVec):
    """
    Desc:
        对新数据进行分类
    Args:
        inputTree  -- 已经训练好的决策树模型
        featLabels -- Feature标签对应的名称,不是目标变量
        testVec    -- 测试输入的数据
    Returns:
        classLabel -- 分类的结果值,需要映射label才能知道名称
    """
    # 获取tree的根节点对于的key值
    firstStr = list(inputTree.keys())[0]
    # 通过key得到根节点对应的value
    secondDict = inputTree[firstStr]
    # 判断根节点名称获取根节点在label中的先后顺序,这样就知道输入的testVec怎么开始对照树来做分类
    featIndex = featLabels.index(firstStr)
    # 测试数据,找到根节点对应的label位置,也就知道从输入的数据的第几位来开始分类
    key = testVec[featIndex]
    valueOfFeat = secondDict[key]
    print('+++', firstStr, 'xxx', secondDict, '---', key, '>>>', valueOfFeat)
    # 判断分枝是否结束: 判断valueOfFeat是否是dict类型
    if isinstance(valueOfFeat, dict):
        classLabel = classify(valueOfFeat, featLabels, testVec)
    else:
        classLabel = valueOfFeat
    return classLabel

6 使用算法:此步骤可以适用于任何监督学习算法,而使用决策树可以更好地理解数据的内在含义。

#项目一:判定鱼类和非鱼类
#decisionTreePlot.py
#!/usr/bin/python
# -*- coding: UTF-8 -*-

'''
Created on Oct 14, 2010
Update on 2017-02-27
Decision Tree Source Code for Machine Learning in Action Ch. 3
@author: Peter Harrington/jiangzhonglian
'''
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline

# 定义文本框 和 箭头格式 【 sawtooth 波浪方框, round4 矩形方框 , fc表示字体颜色的深浅 0.1~0.9 依次变浅,没错是变浅】
decisionNode = dict(boxstyle="sawtooth", fc="0.8")
leafNode = dict(boxstyle="round4", fc="0.8")
arrow_args = dict(arrowstyle="<-")


def getNumLeafs(myTree):
    numLeafs = 0
    firstStr = list(myTree.keys())[0]
    secondDict = myTree[firstStr]
    # 根节点开始遍历
    for key in secondDict.keys():
        # 判断子节点是否为dict, 不是+1
        if type(secondDict[key]) is dict:
            numLeafs += getNumLeafs(secondDict[key])
        else:
            numLeafs += 1
    return numLeafs


def getTreeDepth(myTree):
    maxDepth = 0
    firstStr = list(myTree.keys())[0]
    secondDict = myTree[firstStr]
    # 根节点开始遍历
    for key in secondDict.keys():
        # 判断子节点是不是dict, 求分枝的深度
        # ----------写法1 start ---------------
        if type(secondDict[key]) is dict:
            thisDepth = 1 + getTreeDepth(secondDict[key])
        else:
            thisDepth = 1
        # ----------写法1 end ---------------

        # ----------写法2 start --------------
        # thisDepth = 1 + getTreeDepth(secondDict[key]) if type(secondDict[key]) is dict else 1
        # ----------写法2 end --------------
        # 记录最大的分支深度
        maxDepth = max(maxDepth, thisDepth)
    return maxDepth


def plotNode(nodeTxt, centerPt, parentPt, nodeType):
    createPlot.ax1.annotate(nodeTxt, xy=parentPt,  xycoords='axes fraction', xytext=centerPt, textcoords='axes fraction', va="center", ha="center", bbox=nodeType, arrowprops=arrow_args)


def plotMidText(cntrPt, parentPt, txtString):
    xMid = (parentPt[0] - cntrPt[0]) / 2 + cntrPt[0]
    yMid = (parentPt[1] - cntrPt[1]) / 2 + cntrPt[1]
    createPlot.ax1.text(xMid, yMid, txtString, va="center", ha="center", rotation=30)


def plotTree(myTree, parentPt, nodeTxt):
    # 获取叶子节点的数量
    numLeafs = getNumLeafs(myTree)
    # 获取树的深度
    # depth = getTreeDepth(myTree)

    # 找出第1个中心点的位置,然后与 parentPt定点进行划线
    cntrPt = (plotTree.xOff + (1 + numLeafs) / 2 / plotTree.totalW, plotTree.yOff)
    # print(cntrPt)
    # 并打印输入对应的文字
    plotMidText(cntrPt, parentPt, nodeTxt)

    firstStr = list(myTree.keys())[0]
    # 可视化Node分支点
    plotNode(firstStr, cntrPt, parentPt, decisionNode)
    # 根节点的值
    secondDict = myTree[firstStr]
    # y值 = 最高点-层数的高度[第二个节点位置]
    plotTree.yOff = plotTree.yOff - 1 / plotTree.totalD
    for key in secondDict.keys():
        # 判断该节点是否是Node节点
        if type(secondDict[key]) is dict:
            # 如果是就递归调用[recursion]
            plotTree(secondDict[key], cntrPt, str(key))
        else:
            # 如果不是,就在原来节点一半的地方找到节点的坐标
            plotTree.xOff = plotTree.xOff + 1 / plotTree.totalW
            # 可视化该节点位置
            plotNode(secondDict[key], (plotTree.xOff, plotTree.yOff), cntrPt, leafNode)
            # 并打印输入对应的文字
            plotMidText((plotTree.xOff, plotTree.yOff), cntrPt, str(key))
    plotTree.yOff = plotTree.yOff + 1 / plotTree.totalD


def createPlot(inTree):
    # 创建一个figure的模版
    fig = plt.figure(1, facecolor='green')
    fig.clf()

    axprops = dict(xticks=[], yticks=[])
    # 表示创建一个1行,1列的图,createPlot.ax1 为第 1 个子图,
    createPlot.ax1 = plt.subplot(111, frameon=False, **axprops)

    plotTree.totalW = float(getNumLeafs(inTree))
    plotTree.totalD = float(getTreeDepth(inTree))
    # 半个节点的长度
    plotTree.xOff = -0.5 / plotTree.totalW
    plotTree.yOff = 1.0
    plotTree(inTree, (0.5, 1.0), '')
    plt.show()


# # 测试画图
# def createPlot():
#     fig = plt.figure(1, facecolor='white')
#     fig.clf()
#     # ticks for demo puropses
#     createPlot.ax1 = plt.subplot(111, frameon=False)
#     plotNode('a decision node', (0.5, 0.1), (0.1, 0.5), decisionNode)
#     plotNode('a leaf node', (0.8, 0.1), (0.3, 0.8), leafNode)
#     plt.show()


# 测试数据集
def retrieveTree(i):
    listOfTrees = [
        {'no surfacing': {0: 'no', 1: {'flippers': {0: 'no', 1: 'yes'}}}},
        {'no surfacing': {0: 'no', 1: {'flippers': {0: {'head': {0: 'no', 1: 'yes'}}, 1: 'no'}}}}
    ]
    return listOfTrees[i]


# myTree = retrieveTree(1)
# createPlot(myTree)
#项目一:判定鱼类和非鱼类
#DecisionTree.py
#!/usr/bin/python
# -*- coding: UTF-8 -*-

'''
Created on Oct 12, 2010
Update on 2017-05-18
Decision Tree Source Code for Machine Learning in Action Ch. 3
@author: Peter Harrington/片刻
《机器学习实战》更新地址:https://github.com/apachecn/MachineLearning
'''
print(__doc__)
import operator
from math import log
#import decisionTreePlot as dtPlot
from collections import Counter


def createDataSet():
    """
    Desc:
        创建数据集
    Args:
        无需传入参数
    Returns:
        返回数据集和对应的label标签
    """
    # dataSet 前两列是特征,最后一列对应的是每条数据对应的分类标签
    dataSet = [[1, 1, 'yes'],
               [1, 1, 'yes'],
               [1, 0, 'no'],
               [0, 1, 'no'],
               [0, 1, 'no']]
    # dataSet = [['yes'],
    #         ['yes'],
    #         ['no'],
    #         ['no'],
    #         ['no']]
    # labels  露出水面   脚蹼,注意:这里的labels是写的 dataSet 中特征的含义,并不是对应的分类标签或者说目标变量
    labels = ['no surfacing', 'flippers']
    # 返回
    return dataSet, labels


def calcShannonEnt(dataSet):
    """
    Desc:
        calculate Shannon entropy -- 计算给定数据集的香农熵
    Args:
        dataSet -- 数据集
    Returns:
        shannonEnt -- 返回 每一组 feature 下的某个分类下,香农熵的信息期望
    """
    # -----------计算香农熵的第一种实现方式start----------------------------------------------
    # 求list的长度,表示计算参与训练的数据量
    numEntries = len(dataSet)
    # 下面输出我们测试的数据集的一些信息
    # 例如:<type 'list'> numEntries:  5 是下面的代码的输出
    # print(type(dataSet), 'numEntries: ', numEntries)

    # 计算分类标签label出现的次数
    labelCounts = {}
    # the the number of unique elements and their occurance
    for featVec in dataSet:
        # 将当前实例的标签存储,即每一行数据的最后一个数据代表的是标签
        currentLabel = featVec[-1]
        # 为所有可能的分类创建字典,如果当前的键值不存在,则扩展字典并将当前键值加入字典。每个键值都记录了当前类别出现的次数。
        if currentLabel not in labelCounts.keys():
            labelCounts[currentLabel] = 0
        labelCounts[currentLabel] += 1
        # print('-----', featVec, labelCounts)

    # 对于label标签的占比,求出label标签的香农熵
    shannonEnt = 0.0
    for key in labelCounts:
        # 使用所有类标签的发生频率计算类别出现的概率。
        prob = float(labelCounts[key])/numEntries
        # log base 2
        # 计算香农熵,以 2 为底求对数
        shannonEnt -= prob * log(prob, 2)
        # print('---', prob, prob * log(prob, 2), shannonEnt)
    # -----------计算香农熵的第一种实现方式end------------------------------------------------

    # # -----------计算香农熵的第二种实现方式start--------------------------------------------
    # # 统计标签出现的次数
    # label_count = Counter(data[-1] for data in dataSet)
    # # 计算概率
    # probs = [p[1] / len(dataSet) for p in label_count.items()]
    # # 计算香农熵
    # shannonEnt = sum([-p * log(p, 2) for p in probs])
    # # -----------计算香农熵的第二种实现方式end----------------------------------------------
    return shannonEnt


def splitDataSet(dataSet, index, value):
    """
    Desc:
        划分数据集
        splitDataSet(通过遍历dataSet数据集,求出index对应的colnum列的值为value的行)
        就是依据index列进行分类,如果index列的数据等于 value的时候,就要将 index 划分到我们创建的新的数据集中
    Args:
        dataSet  -- 数据集                 待划分的数据集
        index -- 表示每一行的index列        划分数据集的特征
        value -- 表示index列对应的value值   需要返回的特征的值。
    Returns:
        index 列为 value 的数据集【该数据集需要排除index列】
    """
    # -----------切分数据集的第一种方式 start------------------------------------
    retDataSet = []
    for featVec in dataSet: 
        # index列为value的数据集【该数据集需要排除index列】
        # 判断index列的值是否为value
        if featVec[index] == value:
            # chop out index used for splitting
            # [:index]表示前index行,即若 index 为2,就是取 featVec 的前 index 行
            reducedFeatVec = featVec[:index]
            '''
            请百度查询一下: extend和append的区别
            list.append(object) 向列表中添加一个对象object
            list.extend(sequence) 把一个序列seq的内容添加到列表中
            1、使用append的时候,是将new_media看作一个对象,整体打包添加到music_media对象中。
            2、使用extend的时候,是将new_media看作一个序列,将这个序列和music_media序列合并,并放在其后面。
            result = []
            result.extend([1,2,3])
            print(result)
            result.append([4,5,6])
            print(result)
            result.extend([7,8,9])
            print(result)
            结果:
            [1, 2, 3]
            [1, 2, 3, [4, 5, 6]]
            [1, 2, 3, [4, 5, 6], 7, 8, 9]
            '''
            reducedFeatVec.extend(featVec[index+1:])
            # [index+1:]表示从跳过 index 的 index+1行,取接下来的数据
            # 收集结果值 index列为value的行【该行需要排除index列】
            retDataSet.append(reducedFeatVec)
    # -----------切分数据集的第一种方式 end------------------------------------

    # # -----------切分数据集的第二种方式 start------------------------------------
    # retDataSet = [data[:index] + data[index + 1:] for data in dataSet for i, v in enumerate(data) if i == index and v == value]
    # # -----------切分数据集的第二种方式 end------------------------------------
    return retDataSet


def chooseBestFeatureToSplit(dataSet):
    """
    Desc:
        选择切分数据集的最佳特征
    Args:
        dataSet -- 需要切分的数据集
    Returns:
        bestFeature -- 切分数据集的最优的特征列
    """

    # -----------选择最优特征的第一种方式 start------------------------------------
    # 求第一行有多少列的 Feature, 最后一列是label列嘛
    numFeatures = len(dataSet[0]) - 1
    # label的信息熵
    baseEntropy = calcShannonEnt(dataSet)
    # 最优的信息增益值, 和最优的Featurn编号
    bestInfoGain, bestFeature = 0.0, -1
    # iterate over all the features
    for i in range(numFeatures):
        # create a list of all the examples of this feature
        # 获取每一个实例的第i+1个feature,组成list集合
        featList = [example[i] for example in dataSet]
        # get a set of unique values
        # 获取剔重后的集合,使用set对list数据进行去重
        uniqueVals = set(featList)
        # 创建一个临时的信息熵
        newEntropy = 0.0
        # 遍历某一列的value集合,计算该列的信息熵 
        # 遍历当前特征中的所有唯一属性值,对每个唯一属性值划分一次数据集,计算数据集的新熵值,并对所有唯一特征值得到的熵求和。
        for value in uniqueVals:
            subDataSet = splitDataSet(dataSet, i, value)
            prob = len(subDataSet)/float(len(dataSet))
            newEntropy += prob * calcShannonEnt(subDataSet)
        # gain[信息增益]: 划分数据集前后的信息变化, 获取信息熵最大的值
        # 信息增益是熵的减少或者是数据无序度的减少。最后,比较所有特征中的信息增益,返回最好特征划分的索引值。
        infoGain = baseEntropy - newEntropy
        print('infoGain=', infoGain, 'bestFeature=', i, baseEntropy, newEntropy)
        if (infoGain > bestInfoGain):
            bestInfoGain = infoGain
            bestFeature = i
    return bestFeature
    # -----------选择最优特征的第一种方式 end------------------------------------

    # # -----------选择最优特征的第二种方式 start------------------------------------
    # # 计算初始香农熵
    # base_entropy = calcShannonEnt(dataSet)
    # best_info_gain = 0
    # best_feature = -1
    # # 遍历每一个特征
    # for i in range(len(dataSet[0]) - 1):
    #     # 对当前特征进行统计
    #     feature_count = Counter([data[i] for data in dataSet])
    #     # 计算分割后的香农熵
    #     new_entropy = sum(feature[1] / float(len(dataSet)) * calcShannonEnt(splitDataSet(dataSet, i, feature[0])) \
    #                    for feature in feature_count.items())
    #     # 更新值
    #     info_gain = base_entropy - new_entropy
    #     print('No. {0} feature info gain is {1:.3f}'.format(i, info_gain))
    #     if info_gain > best_info_gain:
    #         best_info_gain = info_gain
    #         best_feature = i
    # return best_feature
    # # -----------选择最优特征的第二种方式 end------------------------------------


def majorityCnt(classList):
    """
    Desc:
        选择出现次数最多的一个结果
    Args:
        classList label列的集合
    Returns:
        bestFeature 最优的特征列
    """
    # -----------majorityCnt的第一种方式 start------------------------------------
    classCount = {}
    for vote in classList:
        if vote not in classCount.keys():
            classCount[vote] = 0
        classCount[vote] += 1
    # 倒叙排列classCount得到一个字典集合,然后取出第一个就是结果(yes/no),即出现次数最多的结果
    sortedClassCount = sorted(classCount.items(), key=operator.itemgetter(1), reverse=True)
    # print('sortedClassCount:', sortedClassCount)
    return sortedClassCount[0][0]
    # -----------majorityCnt的第一种方式 end------------------------------------

    # # -----------majorityCnt的第二种方式 start------------------------------------
    # major_label = Counter(classList).most_common(1)[0]
    # return major_label
    # # -----------majorityCnt的第二种方式 end------------------------------------


def createTree(dataSet, labels):
    """
    Desc:
        创建决策树
    Args:
        dataSet -- 要创建决策树的训练数据集
        labels -- 训练数据集中特征对应的含义的labels,不是目标变量
    Returns:
        myTree -- 创建完成的决策树
    """
    classList = [example[-1] for example in dataSet]
    # 如果数据集的最后一列的第一个值出现的次数=整个集合的数量,也就说只有一个类别,就只直接返回结果就行
    # 第一个停止条件:所有的类标签完全相同,则直接返回该类标签。
    # count() 函数是统计括号中的值在list中出现的次数
    if classList.count(classList[0]) == len(classList):
        return classList[0]
    # 如果数据集只有1列,那么最初出现label次数最多的一类,作为结果
    # 第二个停止条件:使用完了所有特征,仍然不能将数据集划分成仅包含唯一类别的分组。
    if len(dataSet[0]) == 1:
        return majorityCnt(classList)

    # 选择最优的列,得到最优列对应的label含义
    bestFeat = chooseBestFeatureToSplit(dataSet)
    # 获取label的名称
    bestFeatLabel = labels[bestFeat]
    # 初始化myTree
    myTree = {bestFeatLabel: {}}
    # 注:labels列表是可变对象,在PYTHON函数中作为参数时传址引用,能够被全局修改
    # 所以这行代码导致函数外的同名变量被删除了元素,造成例句无法执行,提示'no surfacing' is not in list
    del(labels[bestFeat])
    # 取出最优列,然后它的branch做分类
    featValues = [example[bestFeat] for example in dataSet]
    uniqueVals = set(featValues)
    for value in uniqueVals:
        # 求出剩余的标签label
        subLabels = labels[:]
        # 遍历当前选择特征包含的所有属性值,在每个数据集划分上递归调用函数createTree()
        myTree[bestFeatLabel][value] = createTree(splitDataSet(dataSet, bestFeat, value), subLabels)
        # print('myTree', value, myTree)
    return myTree


def classify(inputTree, featLabels, testVec):
    """
    Desc:
        对新数据进行分类
    Args:
        inputTree  -- 已经训练好的决策树模型
        featLabels -- Feature标签对应的名称,不是目标变量
        testVec    -- 测试输入的数据
    Returns:
        classLabel -- 分类的结果值,需要映射label才能知道名称
    """
    # 获取tree的根节点对于的key值
    firstStr = list(inputTree.keys())[0]
    # 通过key得到根节点对应的value
    secondDict = inputTree[firstStr]
    # 判断根节点名称获取根节点在label中的先后顺序,这样就知道输入的testVec怎么开始对照树来做分类
    featIndex = featLabels.index(firstStr)
    # 测试数据,找到根节点对应的label位置,也就知道从输入的数据的第几位来开始分类
    key = testVec[featIndex]
    valueOfFeat = secondDict[key]
    print('+++', firstStr, 'xxx', secondDict, '---', key, '>>>', valueOfFeat)
    # 判断分枝是否结束: 判断valueOfFeat是否是dict类型
    if isinstance(valueOfFeat, dict):
        classLabel = classify(valueOfFeat, featLabels, testVec)
    else:
        classLabel = valueOfFeat
    return classLabel


def storeTree(inputTree, filename):
    """
    Desc:
        将之前训练好的决策树模型存储起来,使用 pickle 模块
    Args:
        inputTree -- 以前训练好的决策树模型
        filename -- 要存储的名称
    Returns:
        None
    """
    import pickle
    # -------------- 第一种方法 start --------------
    fw = open(filename, 'wb')
    pickle.dump(inputTree, fw)
    fw.close()
    # -------------- 第一种方法 end --------------

    # -------------- 第二种方法 start --------------
    with open(filename, 'wb') as fw:
        pickle.dump(inputTree, fw)
    # -------------- 第二种方法 start --------------


def grabTree(filename):
    """
    Desc:
        将之前存储的决策树模型使用 pickle 模块 还原出来
    Args:
        filename -- 之前存储决策树模型的文件名
    Returns:
        pickle.load(fr) -- 将之前存储的决策树模型还原出来
    """
    import pickle
    fr = open(filename, 'rb')
    return pickle.load(fr)


def fishTest():
    """
    Desc:
        对动物是否是鱼类分类的测试函数,并将结果使用 matplotlib 画出来
    Args:
        None
    Returns:
        None
    """
    # 1.创建数据和结果标签
    myDat, labels = createDataSet()
    # print(myDat, labels)

    # 计算label分类标签的香农熵
    # calcShannonEnt(myDat)

    # # 求第0列 为 1/0的列的数据集【排除第0列】
    # print('1---', splitDataSet(myDat, 0, 1))
    # print('0---', splitDataSet(myDat, 0, 0))

    # # 计算最好的信息增益的列
    # print(chooseBestFeatureToSplit(myDat))

    import copy
    myTree = createTree(myDat, copy.deepcopy(labels))
    print(myTree)
    # [1, 1]表示要取的分支上的节点位置,对应的结果值
    print(classify(myTree, labels, [1, 1]))

    # 画图可视化展现
    #dtPlot.createPlot(myTree)
    createPlot(myTree)


if __name__ == "__main__":
     fishTest()
    #ContactLensesTest()

image.png

image.png

项目案例2: 使用决策树预测隐形眼镜类型

1、项目概述:

隐形眼镜类型包括硬材质、软材质以及不适合佩戴隐形眼镜。我们需要使用决策树预测患者需要佩戴的隐形眼镜类型。

2、开发流程

收集数据: 提供的文本文件。

解析数据: 解析 tab 键分隔的数据行

分析数据: 快速检查数据,确保正确地解析数据内容,使用 createPlot() 函数绘制最终的树形图。

训练算法: 使用 createTree() 函数。

测试算法: 编写测试函数验证决策树可以正确分类给定的数据实例。

使用算法: 存储树的数据结构,以便下次使用时无需重新构造树。

1 收集数据:提供的文本文件

文本文件数据格式如下:
image.png

2 解析数据:解析 tab 键分隔的数据行

lecses = [inst.strip().split('\t') for inst in fr.readlines()]
lensesLabels = ['age', 'prescript', 'astigmatic', 'tearRate']

3 分析数据:快速检查数据,确保正确地解析数据内容,使用 createPlot() 函数绘制最终的树形图。

>>> treePlotter.createPlot(lensesTree)

4 训练算法:使用 createTree() 函数

>>> lensesTree = trees.createTree(lenses, lensesLabels)
>>> lensesTree
{'tearRate': {'reduced': 'no lenses', 'normal': {'astigmatic':{'yes':
{'prescript':{'hyper':{'age':{'pre':'no lenses', 'presbyopic':
'no lenses', 'young':'hard'}}, 'myope':'hard'}}, 'no':{'age':{'pre':
'soft', 'presbyopic':{'prescript': {'hyper':'soft', 'myope':
'no lenses'}}, 'young':'soft'}}}}}

5 测试算法: 编写测试函数验证决策树可以正确分类给定的数据实例。

6 使用算法: 存储树的数据结构,以便下次使用时无需重新构造树。

使用 pickle 模块存储决策树

def storeTree(inputTree, filename):
    impory pickle
    fw = open(filename, 'w')
    pickle.dump(inputTree, fw)
    fw.close()

def grabTree(filename):
    import pickle
    fr = open(filename)
    return pickle.load(fr)
!ls datalab/2535/

data.txt lenses.txt

#项目案例2: 使用决策树预测隐形眼镜类型

def ContactLensesTest():
    """
    Desc:
        预测隐形眼镜的测试代码,并将结果画出来
    Args:
        none
    Returns:
        none
    """

    # 加载隐形眼镜相关的 文本文件 数据
    fr = open('datalab/2535/lenses.txt')
    # 解析数据,获得 features 数据
    lenses = [inst.strip().split('\t') for inst in fr.readlines()]
    # 得到数据的对应的 Labels
    lensesLabels = ['age', 'prescript', 'astigmatic', 'tearRate']
    # 使用上面的创建决策树的代码,构造预测隐形眼镜的决策树
    lensesTree = createTree(lenses, lensesLabels)
    print(lensesTree)
    # 画图可视化展现
    #dtPlot.createPlot(lensesTree)
    createPlot(lensesTree)


if __name__ == "__main__":
    #fishTest()
    ContactLensesTest()

image.png

image.png

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