掌握Python的常用模块pandas(一)

简介: 掌握Python的常用模块pandas(一)

Pandas 简介

Pandas 是 Python 的核心数据分析支持库,提供了快速、灵活、明确的数据结构,旨在简单、直观地处理关系型、标记型数据。Pandas 的目标是成为 Python 数据分析实践与实战的必备高级工具,其长远目标是成为最强大、最灵活、可以支持任何语言的开源数据分析工具。经过多年不懈的努力,Pandas 离这个目标已经越来越近了。

Pandas 适用于处理以下类型的数据:

与 SQL 或 Excel 表类似的,含异构列的表格数据;

有序和无序(非固定频率)的时间序列数据;

带行列标签的矩阵数据,包括同构或异构型数据;

任意其它形式的观测、统计数据集, 数据转入 Pandas 数据结构时不必事先标记。

Pandas 的主要数据结构是 Series(一维数据)与 DataFrame(二维数据),这两种数据结构足以处理金融、统计、社会科学、工程等领域里的大多数典型用例。对于 R 用户,DataFrame 提供了比 R 语言 data.frame 更丰富的功能。Pandas 基于 NumPy 开发,可以与其它第三方科学计算支持库完美集成。

Pandas 就像一把万能瑞士军刀,下面仅列出了它的部分优势 :

处理浮点与非浮点数据里的缺失数据,表示为 NaN;

大小可变:插入或删除 DataFrame 等多维对象的列;

自动、显式数据对齐:显式地将对象与一组标签对齐,也可以忽略标签,在 Series、DataFrame 计算时自动与数据对齐;

强大、灵活的分组(group by)功能:拆分-应用-组合数据集,聚合、转换数据;

把 Python 和 NumPy 数据结构里不规则、不同索引的数据轻松地转换为 DataFrame 对象;

基于智能标签,对大型数据集进行切片、花式索引、子集分解等操作;

直观地合并(merge)、**连接(join)**数据集;

灵活地重塑(reshape)、**透视(pivot)**数据集;

轴支持结构化标签:一个刻度支持多个标签;

成熟的 IO 工具:读取文本文件(CSV 等支持分隔符的文件)、Excel 文件、数据库等来源的数据,利用超快的 HDF5 格式保存 / 加载数据;

时间序列:支持日期范围生成、频率转换、移动窗口统计、移动窗口线性回归、日期位移等时间序列功能。

这些功能主要是为了解决其它编程语言、科研环境的痛点。处理数据一般分为几个阶段:数据整理与清洗、数据分析与建模、数据可视化与制表,Pandas 是处理数据的理想工具。

其它说明:

Pandas 速度很快。Pandas 的很多底层算法都用 Cython 优化过。然而,为了保持通用性,必然要牺牲一些性能,如果专注某一功能,完全可以开发出比 Pandas 更快的专用工具。

Pandas 是 statsmodels 的依赖项,因此,Pandas 也是 Python 中统计计算生态系统的重要组成部分。

Pandas 已广泛应用于金融领域。

Pandas 数据结构

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为什么有多个数据结构?

Pandas 数据结构就像是低维数据的容器。比如,DataFrame 是 Series 的容器,Series 则是标量的容器。使用这种方式,可以在容器中以字典的形式插入或删除对象。

此外,通用 API 函数的默认操作要顾及时间序列与截面数据集的方向。多维数组存储二维或三维数据时,编写函数要注意数据集的方向,这对用户来说是一种负担;如果不考虑 C 或 Fortran 中连续性对性能的影响,一般情况下,不同的轴在程序里其实没有什么区别。Pandas 里,轴的概念主要是为了给数据赋予更直观的语义,即用“更恰当”的方式表示数据集的方向。这样做可以让用户编写数据转换函数时,少费点脑子。

处理 DataFrame 等表格数据时,index(行)或 columns(列)比 axis 0 和 axis 1 更直观。用这种方式迭代 DataFrame 的列,代码更易读易懂:

for col in df.columns:
    series = df[col]
    # do something with series

大小可变与数据复制

Pandas 所有数据结构的值都是可变的,但数据结构的大小并非都是可变的,比如,Series 的长度不可改变,但 DataFrame 里就可以插入列。

Pandas 里,绝大多数方法都不改变原始的输入数据,而是复制数据,生成新的对象。 一般来说,原始输入数据不变更稳妥。

Pandas 入门

本节是帮助 Pandas 新手快速上手的简介。实例里介绍了更多实用案例。

本节以下列方式导入 Pandas 与 NumPy:

import pandas as pd
import numpy as np

生成对象

详见数据结构简介文档。

用值列表生成 Series 时,Pandas 默认自动生成整数索引:

import pandas as pd
import numpy as np
s = pd.Series([1, 3, 5, np.nan, 6, 8])
print(s)

用含日期时间索引与标签的 NumPy 数组生成 DataFrame:

生成日期索引

import pandas as pd
import numpy as np
dates = pd.date_range('20130101', periods=6)
print(dates)

生成DateFrame(合并之前的代码):

import pandas as pd
import numpy as np
dates = pd.date_range('20130101', periods=6)
df = pd.DataFrame(np.random.randn(6, 4), index=dates, columns=list('ABCD'))
print(df)

用 Series 字典对象生成 DataFrame:

import pandas as pd
import numpy as np
df2 = pd.DataFrame({'A': 1.,
    'B': pd.Timestamp('20130102'),
    'C': pd.Series(1, index=list(range(4)), dtype='float32'),
    'D': np.array([3] * 4, dtype='int32'),
    'E': pd.Categorical(["test", "train", "test", "train"]),
    'F': 'foo'})
print(df2)

DataFrame 的列有不同数据类型(合并上面的代码)。

import pandas as pd
import numpy as np
df2 = pd.DataFrame({'A': 1.,
    'B': pd.Timestamp('20130102'),
    'C': pd.Series(1, index=list(range(4)), dtype='float32'),
    'D': np.array([3] * 4, dtype='int32'),
    'E': pd.Categorical(["test", "train", "test", "train"]),
    'F': 'foo'})
print(df2.dtypes)

Pandas 基础用法

本节介绍 Pandas 数据结构的基础用法。下列代码创建上一节(Pandas 数据结构)用过的示例数据对象:

Head 与 Tail

head() 与 tail() 用于快速预览 Series 与 DataFrame,默认显示 5 条数据,也可以指定显示数据的数量

In [4]: long_series = pd.Series(np.random.randn(1000))
In [5]: long_series.head()
Out[5]: 
0   -1.157892
1   -1.344312
2    0.844885
3    1.075770
4   -0.109050
dtype: float64
In [6]: long_series.tail(3)
Out[6]: 
997   -0.289388
998   -1.020544
999    0.589993
dtype: float64

属性与底层数据

Pandas 可以通过多个属性访问元数据:

  • shape:输出对象的轴维度,与 ndarray 一致
  • 轴标签Series: Index (仅有此轴)DataFrame: Index (行) 与列

注意: 为属性赋值是安全的!

In [7]: df[:2]
Out[7]: 
                   A         B         C
2000-01-01 -0.173215  0.119209 -1.044236
2000-01-02 -0.861849 -2.104569 -0.494929
In [8]: df.columns = [x.lower() for x in df.columns]
In [9]: df
Out[9]: 
                   a         b         c
2000-01-01 -0.173215  0.119209 -1.044236
2000-01-02 -0.861849 -2.104569 -0.494929
2000-01-03  1.071804  0.721555 -0.706771
2000-01-04 -1.039575  0.271860 -0.424972
2000-01-05  0.567020  0.276232 -1.087401
2000-01-06 -0.673690  0.113648 -1.478427
2000-01-07  0.524988  0.404705  0.577046
2000-01-08 -1.715002 -1.039268 -0.370647

Pandas 对象(Index, Series, DataFrame)相当于数组的容器,用于存储数据、执行计算。大部分类型的底层数组都是 numpy.ndarray。不过,Pandas 与第三方支持库一般都会扩展 NumPy 类型系统,添加自定义数组(见数据类型)。

.array 属性用于提取 Index 或 Series 里的数据。

In [10]: s.array
Out[10]: 
<PandasArray>
[ 0.4691122999071863, -0.2828633443286633, -1.5090585031735124,
 -1.1356323710171934,  1.2121120250208506]
Length: 5, dtype: float64
In [11]: s.index.array
Out[11]: 
<PandasArray>
['a', 'b', 'c', 'd', 'e']
Length: 5, dtype: object

array 一般指 ExtensionArray。至于什么是 ExtensionArray 及 Pandas 为什么要用 ExtensionArray 不是本节要说明的内容。更多信息请参阅数据类型。

提取 NumPy 数组,用 to_numpy() 或 numpy.asarray()。

In [12]: s.to_numpy()
Out[12]: array([ 0.4691, -0.2829, -1.5091, -1.1356,  1.2121])
In [13]: np.asarray(s)
Out[13]: array([ 0.4691, -0.2829, -1.5091, -1.1356,  1.2121])

Series 与 Index 的类型是 ExtensionArray 时, to_numpy() 会复制数据,并强制转换值。详情见数据类型。

to_numpy() 可以控制 numpy.ndarray 生成的数据类型。以带时区的 datetime 为例,NumPy 未提供时区信息的 datetime 数据类型,Pandas 则提供了两种表现形式:

  1. 一种是带 Timestamp 的 numpy.ndarray,提供了正确的 tz 信息。
  2. 另一种是 datetime64[ns],这也是一种 numpy.ndarray,值被转换为 UTC,但去掉了时区信息。

时区信息可以用 dtype=object 保存。

In [14]: ser = pd.Series(pd.date_range('2000', periods=2, tz="CET"))
In [15]: ser.to_numpy(dtype=object)
Out[15]: 
array([Timestamp('2000-01-01 00:00:00+0100', tz='CET', freq='D'),
       Timestamp('2000-01-02 00:00:00+0100', tz='CET', freq='D')],
      dtype=object)

或用 dtype='datetime64[ns]' 去除。

In [16]: ser.to_numpy(dtype="datetime64[ns]")
Out[16]: 
array(['1999-12-31T23:00:00.000000000', '2000-01-01T23:00:00.000000000'],
      dtype='datetime64[ns]')

提取 DataFrame 里的原数据稍微有点复杂。DataFrame 里所有列的数据类型都一样时,DataFrame.to_numpy() 返回底层数据:

In [17]: df.to_numpy()
Out[17]: 
array([[-0.1732,  0.1192, -1.0442],
       [-0.8618, -2.1046, -0.4949],
       [ 1.0718,  0.7216, -0.7068],
       [-1.0396,  0.2719, -0.425 ],
       [ 0.567 ,  0.2762, -1.0874],
       [-0.6737,  0.1136, -1.4784],
       [ 0.525 ,  0.4047,  0.577 ],
       [-1.715 , -1.0393, -0.3706]])

DataFrame 为同构型数据时,Pandas 直接修改原始 ndarray,所做修改会直接反应在数据结构里。对于异质型数据,即 DataFrame 列的数据类型不一样时,就不是这种操作模式了。与轴标签不同,不能为值的属性赋值。

注意

处理异质型数据时,输出结果 ndarray 的数据类型适用于涉及的各类数据。若 DataFrame 里包含字符串,输出结果的数据类型就是 object。要是只有浮点数或整数,则输出结果的数据类型是浮点数。

以前,Pandas 推荐用 Series.values 或 DataFrame.values 从 Series 或 DataFrame 里提取数据。旧有代码库或在线教程里仍在用这种操作,但 Pandas 已改进了此功能,现在,推荐用 .array 或 to_numpy 提取数据,别再用 .values 了。.values 有以下几个缺点:

  1. Series 含扩展类型时,Series.values 无法判断到底是该返回 NumPy array,还是返回 ExtensionArray。而 Series.array 则只返回 ExtensionArray,且不会复制数据。Series.to_numpy() 则返回 NumPy 数组,其代价是需要复制、并强制转换数据的值。
  2. DataFrame 含多种数据类型时,DataFrame.values 会复制数据,并将数据的值强制转换同一种数据类型,这是一种代价较高的操作。DataFrame.to_numpy() 则返回 NumPy 数组,这种方式更清晰,也不会把 DataFrame 里的数据都当作一种类型。

加速操作

借助 numexpr 与 bottleneck 支持库,Pandas 可以加速特定类型的二进制数值与布尔操作。

处理大型数据集时,这两个支持库特别有用,加速效果也非常明显。 numexpr 使用智能分块、缓存与多核技术。bottleneck 是一组专属 cython 例程,处理含 nans 值的数组时,特别快。

请看下面这个例子(DataFrame 包含 100 列 X 10 万行数据):

2c9dbaed75fe4b38b3bf55583905545d.png强烈建议安装这两个支持库,更多信息,请参阅推荐支持库。

这两个支持库默认为启用状态,可用以下选项设置:

0.20.0 版新增。

pd.set_option('compute.use_bottleneck', False)
pd.set_option('compute.use_numexpr', False)

Pandas 数据结构简介

本节介绍 Pandas 基础数据结构,包括各类对象的数据类型、索引、轴标记、对齐等基础操作。首先,导入 NumPy 和 Pandas:

In [1]: import numpy as np
In [2]: import pandas as pd

“数据对齐是内在的”,这一原则是根本。除非显式指定,Pandas 不会断开标签和数据之间的连接。

下文先简单介绍数据结构,然后再分门别类介绍每种功能与方法。

#Series

Series 是带标签的一维数组,可存储整数、浮点数、字符串、Python 对象等类型的数据。轴标签统称为索引。调用 pd.Series 函数即可创建 Series:

>>> s = pd.Series(data, index=index)

上述代码中,data 支持以下数据类型:

Python 字典

多维数组

标量值(如,5)

index 是轴标签列表。不同数据可分为以下几种情况:

多维数组

data 是多维数组时,index 长度必须与 data 长度一致。没有指定 index 参数时,创建数值型索引,即 [0, ..., len(data) - 1]。

In [3]: s = pd.Series(np.random.randn(5), index=['a', 'b', 'c', 'd', 'e'])
In [4]: s
Out[4]: 
a    0.469112
b   -0.282863
c   -1.509059
d   -1.135632
e    1.212112
dtype: float64
In [5]: s.index
Out[5]: Index(['a', 'b', 'c', 'd', 'e'], dtype='object')
In [6]: pd.Series(np.random.randn(5))
Out[6]: 
0   -0.173215
1    0.119209
2   -1.044236
3   -0.861849
4   -2.104569
dtype: float64

注意

Pandas 的索引值可以重复。不支持重复索引值的操作会触发异常。其原因主要与性能有关,有很多计算实例,比如 GroupBy 操作就不用索引。

字典

Series 可以用字典实例化:

In [7]: d = {'b': 1, 'a': 0, 'c': 2}
In [8]: pd.Series(d)
Out[8]: 
b    1
a    0
c    2
dtype: int64

注意

data 为字典,且未设置 index 参数时,如果 Python 版本 >= 3.6 且 Pandas 版本 >= 0.23,Series 按字典的插入顺序排序索引。

Python < 3.6 或 Pandas < 0.23,且未设置 index 参数时,Series 按字母顺序排序字典的键(key)列表。

上例中,如果 Python < 3.6 或 Pandas < 0.23,Series 按字母排序字典的键。输出结果不是 ['b', 'a', 'c'],而是 ['a', 'b', 'c']。

如果设置了 index 参数,则按索引标签提取 data 里对应的值。

In [9]: d = {'a': 0., 'b': 1., 'c': 2.}
In [10]: pd.Series(d)
Out[10]: 
a    0.0
b    1.0
c    2.0
dtype: float64
In [11]: pd.Series(d, index=['b', 'c', 'd', 'a'])
Out[11]: 
b    1.0
c    2.0
d    NaN
a    0.0
dtype: float64

注意

Pandas 用 NaN(Not a Number)表示缺失数据。

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