R语言最优聚类数目k改进kmean聚类算法

简介: R语言最优聚类数目k改进kmean聚类算法

在本文中,我们将探讨应用聚类算法(例如k均值和期望最大化)来确定集群的最佳数量时所遇到的问题之一。从数据集本身来看,确定集群数量的最佳值的问题通常不是很清楚。在本文中,我们将介绍几种技术,可用于帮助确定给定数据集的最佳k值。

我们将在当前的R Studio环境中下载数据集:

 StudentKnowledgeData <-read_csv(“ StudentKnowledgeData.csv”)

预处理

由于此数据集的特征向量较低,因此我们将不关注特征选择方面,而是将使用所有可用特征。

summary(myDataClean)
[1] 402   5
      STG              SCG              STR              LPR
 Min.   :0.0000   Min.   :0.0000   Min.   :0.0100   Min.   :0.0000
 1st Qu.:0.2000   1st Qu.:0.2000   1st Qu.:0.2700   1st Qu.:0.2500
 Median :0.3025   Median :0.3000   Median :0.4450   Median :0.3300
 Mean   :0.3540   Mean   :0.3568   Mean   :0.4588   Mean   :0.4324
 3rd Qu.:0.4800   3rd Qu.:0.5100   3rd Qu.:0.6800   3rd Qu.:0.6500
 Max.   :0.9900   Max.   :0.9000   Max.   :0.9500   Max.   :0.9900

一旦完成预处理,以确保数据已准备就绪,可用于进一步的应用。

scaled_data = as.matrix(scale(myDataClean))

聚类算法– k表示在其中找到最佳聚类数的示例

让我们尝试为该数据创建聚类。

让我们从k = 3开始并检查结果。

kmm
K-means clustering with 3 clusters of sizes 93, 167, 142

Cluster means:
           STG        SCG        STR        LPR        PEG
1  0.573053974  0.3863411  0.2689915  1.3028712  0.1560779
2 -0.315847301 -0.4009366 -0.3931942 -0.1794893 -0.8332218
3 -0.003855777  0.2184978  0.2862481 -0.6421993  0.8776957

Clustering vector:
  1   2   3   4   5   6   7   8   9  10  11  12  13  14  15  16  17  18  19  20  21
...................................................................................

Within cluster sum of squares by cluster:
[1] 394.5076 524.4177 497.7787
 (between_SS / total_SS =  29.3 %)

Available components:
[1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
[6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

当我们检查(between_SS / total_SS)时,发现它很低。该比率实际上说明了群集之间数据点的平方总和。我们想要增加此值,并且随着群集数量的增加,我们看到它增加,但是我们不想过度拟合数据。因此,我们看到在k = 401的情况下,我们将拥有402个完全适合数据的簇。因此,我们的想法是找到一个k值,对于该值,模型不会过拟合,并且同时根据实际分布对数据进行聚类。现在让我们探讨如何解决找到最佳数目的群集的问题。


肘法

如果将集群解释的方差百分比相对于集群数量作图,则第一个集群会添加很多信息(说明很多方差),但在某个点上边际增益会下降,从而在图形。此时选择簇的数量,因此选择“肘部标准”。

wss
plot(1:k.max, wss,
     type="b", pch = 19, frame = FALSE,
     xlab="Number of clusters K",
     ylab="Total within-clusters sum of squares")
 [1] 2005.0000 1635.8573 1416.7041 1253.9959 1115.4657 1026.0506  952.4835  887.7202
 [9]  830.8277  780.2121  735.6714  693.7745  657.0939  631.5901  608.3576

该图可以在下面看到:

因此,对于k = 4,与其他k相比,between_ss / total_ss比率趋于缓慢变化且变化较小。因此对于该数据,k = 4应该是群集数量的一个不错的选择,


k均值的贝叶斯推断标准

k均值模型“几乎”是高斯混合模型,因此可以构造高斯混合模型的似然性,从而确定信息标准值。

d_clust$BIC
plot(d_clust)
Bayesian Information Criterion (BIC):
         EII       VII       EEI       VEI       EVI       VVI       EEE       EVE
1  -5735.105 -5735.105 -5759.091 -5759.091 -5759.091 -5759.091 -5758.712 -5758.712
2  -5731.019 -5719.188 -5702.988 -5635.324 -5725.379 -5729.256 -5698.095 -5707.733
3  -5726.577 -5707.840 -5648.033 -5618.274 -5580.305 -5620.816 -5693.977 -5632.555
..................................................................................
         VEE       VVE       EEV       VEV       EVV       VVV
1  -5758.712 -5758.712 -5758.712 -5758.712 -5758.712 -5758.712
2  -5704.051 -5735.383 -5742.110 -5743.216 -5752.709 -5753.597
3  -5682.312 -5642.217 -5736.306 -5703.742 -5717.796 -5760.915
..............................................................

Top 3 models based on the BIC criterion:
    EVI,3     EVI,4     EEI,5
-5580.305 -5607.980 -5613.077
> plot(d_clust)
Model-based clustering plots:

1: BIC
2: classification
3: uncertainty
4: density

Selection: 1

可以在下面看到该图,其中k = 3和k = 4是可用的最佳选择。

从这两种方法可以看出,我们可以在一定程度上确定对于聚类问题而言,聚类数的最佳值是多少。几乎没有其他技术可以使用。

hist(nb$Best.nc[1,], breaks = max(na.omit(nb$Best.nc[1,])))

在此有一个重要的要点,即对于每个群集大小,此方法始终考虑大多数索引。因此,重要的是要了解哪些索引与数据相关,并根据该索引确定最佳选择是建议的最大值还是任何其他值。
正如我们在下面查看“第二差分D-index”图所看到的,很明显,最佳聚类数是k = 4。

相关文章
|
11月前
|
机器学习/深度学习 算法 数据可视化
基于MVO多元宇宙优化的DBSCAN聚类算法matlab仿真
本程序基于MATLAB实现MVO优化的DBSCAN聚类算法,通过多元宇宙优化自动搜索最优参数Eps与MinPts,提升聚类精度。对比传统DBSCAN,MVO-DBSCAN有效克服参数依赖问题,适应复杂数据分布,增强鲁棒性,适用于非均匀密度数据集的高效聚类分析。
|
机器学习/深度学习 算法 数据挖掘
K-means聚类算法是机器学习中常用的一种聚类方法,通过将数据集划分为K个簇来简化数据结构
K-means聚类算法是机器学习中常用的一种聚类方法,通过将数据集划分为K个簇来简化数据结构。本文介绍了K-means算法的基本原理,包括初始化、数据点分配与簇中心更新等步骤,以及如何在Python中实现该算法,最后讨论了其优缺点及应用场景。
1904 6
|
算法 数据挖掘 定位技术
基于密度的聚类算法能够在含有噪声的数据集中识别出任意形状和大小的簇(Matlab代码实现)
基于密度的聚类算法能够在含有噪声的数据集中识别出任意形状和大小的簇(Matlab代码实现)
281 1
|
12月前
|
机器学习/深度学习 分布式计算 算法
【风场景生成与削减】【m-ISODATA、kmean、HAC】无监督聚类算法,用于捕获电力系统中风场景生成与削减研究(Matlab代码实现)
【风场景生成与削减】【m-ISODATA、kmean、HAC】无监督聚类算法,用于捕获电力系统中风场景生成与削减研究(Matlab代码实现)
362 0
|
机器学习/深度学习 算法 安全
深度长文I 深度合成服务类-算法备案该怎么做?
本文详解“深度合成服务类”算法及其备案要求,涵盖定义、类型、备案流程等内容,助你全面理解合规要点。
|
12月前
|
机器学习/深度学习 数据采集 算法
【风光场景生成】基于改进ISODATA的负荷曲线聚类算法(Matlab代码实现)
【风光场景生成】基于改进ISODATA的负荷曲线聚类算法(Matlab代码实现)
245 0
|
人工智能 算法 安全
【博士论文】基于局部中心量度的聚类算法研究(Matlab代码实现)
【博士论文】基于局部中心量度的聚类算法研究(Matlab代码实现)
326 0
|
算法 数据可视化 数据挖掘
基于AOA算术优化的KNN数据聚类算法matlab仿真
本程序基于AOA算术优化算法优化KNN聚类,使用Matlab 2022A编写。通过AOA搜索最优特征子集,提升KNN聚类精度,并对比不同特征数量下的聚类效果。包含完整仿真流程与可视化结果展示。
|
机器学习/深度学习 人工智能 算法
AP聚类算法实现三维数据点分类
AP聚类算法实现三维数据点分类
425 0
|
算法 数据挖掘 数据安全/隐私保护
基于FCM模糊聚类算法的图像分割matlab仿真
本项目展示了基于模糊C均值(FCM)算法的图像分割技术。算法运行效果良好,无水印。使用MATLAB 2022a开发,提供完整代码及中文注释,附带操作步骤视频。FCM算法通过隶属度矩阵和聚类中心矩阵实现图像分割,适用于灰度和彩色图像,广泛应用于医学影像、遥感图像等领域。