木舟笔记_社区达人页

2022年06月

• 06.12 21:38:56
  发表了文章 2022-06-12 21:38:56

  ggcor | 相关分析和可视化的扩展工具

  ggcor | 相关分析和可视化的扩展工具

  
• 06.12 21:36:03
  发表了文章 2022-06-12 21:36:03

  (免费教程+代码领取)|跟着Cell学作图系列合集

  (免费教程+代码领取)|跟着Cell学作图系列合集

  
• 06.12 21:33:47
  发表了文章 2022-06-12 21:33:47

  跟着Cell学作图 | 13.随机森林分类及其可视化(R包randomForest)

  跟着Cell学作图 | 13.随机森林分类及其可视化(R包randomForest)

  
• 06.12 21:31:18
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  Nat Commun&JAMA INTERN MED|浅析两篇LASSO+Logistic/Cox 套路文章

  Nat Commun&JAMA INTERN MED|浅析两篇LASSO+Logistic/Cox 套路文章

  
• 06.12 21:16:00
  发表了文章 2022-06-12 21:16:00

  ImportError: DLL load failed while importing qhull: 找不到指定的模块。问题解决！

  ImportError: DLL load failed while importing qhull: 找不到指定的模块。问题解决！
• 06.12 21:14:41
  发表了文章 2022-06-12 21:14:41

  跟着Cell学作图 | 12.韦恩图(Vennerable包)

  跟着Cell学作图 | 12.韦恩图(Vennerable包)

  
• 06.12 21:12:19
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  单组学的多变量分析| 2.稀疏偏最小二乘判别分析（sPLS-DA）

  单组学的多变量分析| 2.稀疏偏最小二乘判别分析（sPLS-DA）

  
• 06.12 21:08:05
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  跟着Cell学作图| 11.Ingenuity Pathway Analysis(IPA)

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中同一个软件(IPA)做的两张图。

  
• 06.12 21:05:48
  发表了文章 2022-06-12 21:05:48

  单组学的多变量分析|1.PCA和PLS-DA

  单组学的多变量分析|1.PCA和PLS-DA

  
• 06.12 21:01:20
  发表了文章 2022-06-12 21:01:20

  R 中的 IF, ELSE, ELSE IF 语句的简单用法

  R 中的 IF, ELSE, ELSE IF 语句的简单用法

  
• 06.12 20:58:35
  发表了文章 2022-06-12 20:58:35

  答疑| ggplot 绘制火山图并添加文字标签

  答疑| ggplot 绘制火山图并添加文字标签

  
• 06.12 20:56:06
  发表了文章 2022-06-12 20:56:06

  R 中几个常见的数据重塑函数

  R 中几个常见的数据重塑函数

  
• 06.10 01:24:44
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  R 中几个常见的合并数据集方法

  R 中几个常见的合并数据集方法

  
• 06.10 00:09:30
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  跟着Cell学作图|10.复杂热图

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Figure：热图。

  
• 06.09 23:45:59
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  主成分分析(PCA)及其可视化的基础指南

  主成分分析(PCA)及其可视化的基础指南

  
• 06.09 22:48:14
  发表了文章 2022-06-09 22:48:14

  跟着Cell学作图|9.PPI分析(GeNets数据库)

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：蛋白质相互作用网络。

  
• 06.09 22:44:51
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  跟着Cell学作图|8.富集分析网络图(Cytoscape/ClueGO)

  跟着Cell学作图|8.富集分析网络图(Cytoscape/ClueGO)

  
• 06.09 22:22:59
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  跟着Cell学作图|7.富集分析(Metascape数据库)

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：富集分析。

  
• 06.09 22:19:14
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  apply | R中函数的简单循环

  R中的apply族函数是一组R向量化函数，允许通过数组执行复杂的任务，避免使用for循环。
• 06.09 22:10:32
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  跟着Cell学作图 | 6.时间序列分析(Mfuzz包)

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：时间序列分析图。

  
• 06.09 22:07:46
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  aggregate | 在R中进行分组统计

  aggregate | 在R中进行分组统计
• 06.09 21:59:48
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  跟着Cell学作图 | 5.UMAP降维分析

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：UMAP降维分析图。

  
• 06.09 21:56:41
  发表了文章 2022-06-09 21:56:41

  跟着 Cell 学作图 | 4.小提琴图

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：小提琴图。

  
• 06.09 21:50:38
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  跟着 Cell 学作图 | 3.箱线图+散点+差异显著性检验

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：带散点的箱线图。

  
• 06.09 21:47:55
  发表了文章 2022-06-09 21:47:55

  跟着Cell学作图 | 2.柱状图+误差棒+散点+差异显著性检验

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：带散点的柱状图。

  
• 06.09 21:42:41
  发表了文章 2022-06-09 21:42:41

  跟着CELL学作图|1.火山图

  这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：火山图。

  
• 06.09 21:39:40
  发表了文章 2022-06-09 21:39:40

  解决R语言出现“二进列运算符中有非数值参数”的错误！

  解决R语言出现“二进列运算符中有非数值参数”的错误！

  
• 06.09 21:37:48
  发表了文章 2022-06-09 21:37:48

  使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(万字超详细教程）（下）

  使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(万字超详细教程）（下）

  
• 06.09 21:17:57
  发表了文章 2022-06-09 21:17:57

  使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(万字超详细教程）（中）

  使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(万字超详细教程）（中）

  
• 06.09 18:09:50
  发表了文章 2022-06-09 18:09:50

  使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(万字超详细教程）（上）

  使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(万字超详细教程）（上）

  
• 06.09 18:01:21
  发表了文章 2022-06-09 18:01:21

  番外 |使用ComplexHeatmap绘制围棋盘

  番外 |使用ComplexHeatmap绘制围棋盘

  
• 06.09 17:57:25
  发表了文章 2022-06-09 17:57:25

  使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note1:简介

  复杂的热图可以有效地可视化不同数据源之间的关联，并揭示潜在的模式。ComplexHeatmap包提供了一种高度灵活的方式来安排多个热图，并支持自定义的注释图形。
• 06.09 17:41:51
  发表了文章 2022-06-09 17:41:51

  零基础"机器学习"自学笔记|Note1:机器学习绪论

  这个系列为我在自学【机器学习】时的个人笔记。因为本人为医学相关专业，故学习过程中可能会有较多的纰漏，希望各位读者不吝赐教。

  
• 06.09 17:36:46
  发表了文章 2022-06-09 17:36:46

  文献解读|2019-nCoV感染后胆管细胞特异性ACE2表达可能导致肝损伤

  文献解读|2019-nCoV感染后胆管细胞特异性ACE2表达可能导致肝损伤

  
• 06.09 00:29:07
  发表了文章 2022-06-09 00:29:07

  ggcorrplot | 简单的相关性热图绘制

  ggcorrplot提供了一种对相关矩阵进行重新排序的解决方案，并在相关图上显示显著性水平。它还包括一个用于计算相关p值矩阵的函数。

  
• 06.09 00:21:22
  发表了文章 2022-06-09 00:21:22

  ggpubr|让数据可视化更加优雅（下）

  ggpubr|让数据可视化更加优雅（下）

  
• 06.09 00:13:03
  发表了文章 2022-06-09 00:13:03

  ggpubr|让数据可视化更加优雅（上）

  ggpubr是由Alboukadel Kassambara创建的，基于ggplot2的可视化包。主要用于绘制符合出版要求的图形。

  
• 06.08 01:53:31
  发表了文章 2022-06-08 01:53:31

  《R数据科学》学习笔记|Note16:使用purrr实现迭代(下)

  《R数据科学》学习笔记|Note16:使用purrr实现迭代(下)

  
• 06.08 01:43:32
  发表了文章 2022-06-08 01:43:32

  ggsci | 让你的配色Nature化（下）

  ggsci | 让你的配色Nature化

  
• 06.08 01:38:33
  发表了文章 2022-06-08 01:38:33

  ggsci | 让你的配色Nature化（上)

  ggsci | 让你的配色Nature化

  
• 06.08 01:30:40
  发表了文章 2022-06-08 01:30:40

  零基础"机器学习"自学笔记|Note8:正则化

  零基础"机器学习"自学笔记|Note8:正则化

  
• 06.08 01:25:34
  发表了文章 2022-06-08 01:25:34

  单细胞转录组|单细胞转录组|Seurat 4.0 使用指南

  10X Genomics免费提供的外周血单核细胞(PBMC)数据集。通过Illumina NextSeq 500测序的2700个单细胞。

  
• 06.07 23:14:27
  发表了文章 2022-06-07 23:14:27

  《R数据科学》学习笔记|Note15:使用purrr实现迭代(上)

  《R数据科学》学习笔记|Note15:使用purrr实现迭代(上)
• 06.07 23:07:31
  发表了文章 2022-06-07 23:07:31

  R绘图实战|GSEA富集分析图

  GSEA（Gene Set EnrichmentAnalysis），即基因集富集分析，它的基本思想是使用预定义的基因，将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序，然后检验预先设定的基因集合是否在这个排序表的顶端或者底端富集。

  
• 06.07 22:44:42
  发表了文章 2022-06-07 22:44:42

  《R数据科学》学习笔记|Note14:向量

  《R数据科学》学习笔记|Note14:向量

  
• 06.07 22:29:52
  发表了文章 2022-06-07 22:29:52

  《R数据科学》学习笔记|Note13:函数

  《R数据科学》学习笔记|Note13:函数
• 06.07 22:18:38
  发表了文章 2022-06-07 22:18:38

  零基础"机器学习"自学笔记|Note7:逻辑回归

  零基础"机器学习"自学笔记|Note7:逻辑回归

  
• 06.07 22:03:30
  发表了文章 2022-06-07 22:03:30

  解决数据上传NCBI时的“multiple BioSamples cannot have identical attributes”错误!

  上传16s/RNAseq/chip_seq时遇到这个问题怎么办？