1IPA
IPA（Ingenuity Pathway Analysis，通路分析软件）是一款基于云计算的图形化界面生物信息学软件，能够从生物学通路角度将组学数据进行分析、整合和理解，适用于转录组学、蛋白质组学、代谢组学等大数据分析，也适用于一些产生基因、化学物质列表的小规模实验。组学数据分析结果主要有经典通路、上游转录调控、下游调控子效应、疾病与功能以及分子间相互作用网络这5个结果。
经典通路分析
最大的优势是能根据上传数据中的分子上下调来预测通路的激活/抑制，然后还能预测整个通路被激活后的变化趋势，如上图C.蓝色的柱子表示对应的通路被抑制，橙色的为激活.
分子间相互作用网络
不同于string的network分析，IPA的network分析按照功能能分析的，并且还会对network网络进行打分。在上图B中红色和绿色节点分别表示上调和下调的分子，白色节点表示在我们的数据集中没有检测到的分子。
2绘制
数据格式
导入数据并做图
挑选并导出结果
