实战案例|肿瘤预测模型~

简介: 大家好,我是志斌~今天来跟大家分享一下朴素贝叶斯模型的原理以及通过肿瘤预测模型来看如何用Python实现它。

01原理


朴素贝叶斯法是基于贝叶斯定理与特征条件独立加设的分类方法,它是机器学习中应用最为广泛的分类算法之一。


朴素贝叶斯方法虽然分类效果比贝叶斯算法低,但是简化了其在实际应用场景中的复杂性,相当于是贝叶斯算法的简化版。


它的算法核心为如下的贝叶斯公式:


96.png

其中P(X)为事件X发生的概率,P(Y)为事件Y发生的概率,P(X|Y)为在事件Y发生的概率下事件X发生的概率,P(Y|X)为在事件X发生的概率下事件Y发生的概率。


02搭建模型


对肿瘤性质的判断,传统方法为医生根据肿瘤的几十个指标进行判断,这种方法过于依赖医生个人经验且效率较低,而通过机器学习搭建好模型,则可以快速对肿瘤进行预判。


首先读取数据进行查看。


# 读取数据
import pandas as pd
df = pd.read_excel('肿瘤数据.xlsx')



97.png



开始设置特征变量和目标变量。


# 划分特征变量、目标变量
X = df.drop(columns='肿瘤性质')
Y = df['肿瘤性质']


对数据集进行划分,其中20%的数据为测试集,80%的数据为训练集。


from sklearn.model_selection import train_test_split
X_train,X_test,Y_train,Y_test = train_test_split(X,Y,test_s



微信图片_20220617161539.png


98.png


现在对已经划分好的数据集进行训练。


#  搭建模型进行训练
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
model = GaussianNB()
model.fit(X_train,Y_train)


对模型用测试集进行测试


Y_pred = model.predict(X_test)


查看一下预测的准确度。


from sklearn.metrics import accuracy_score
score = accuracy_score(Y_pred,Y_test)


预测准确度为:


99.png


03模型评估


模型搭建好后,我们还需要对其进行评估,之前我们的文章介绍了ROC曲线和KS曲线两种对模型评估的方式,有兴趣的读者可以看看这篇文章实战案例|ROC曲线与KS曲线评估模型~。


此次我们选取ROC曲线作为评估方法。


# 绘制ROC曲线
from sklearn.metrics import roc_curve
Y_pred_proba = model.predict_proba(X_test)
fpr,tpr,thres = roc_curve(Y_test,Y_pred_proba[:,1])
data = pd.DataFrame()
data['阈值'] = list(thres)
data['假警报率'] = list(fpr)
data['命中率'] = list(tpr)
data.head(10)
import matplotlib.pyplot as plt
plt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei']
plt.plot(fpr,tpr)
plt.title('ROC曲线')
plt.xlabel('FPR')
plt.ylabel('TPR')
plt.show()



100.png


志斌换了一种绘制方式,重新绘制ROC曲线。


# 绘制ROC曲线
from sklearn.metrics import roc_curve
Y_pred_proba = model.predict_proba(X_test)
fpr,tpr,thres = roc_curve(Y_test,Y_pred_proba[:,1])
import matplotlib.pyplot as plt
plt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei']
plt.plot(fpr,tpr)
plt.title('ROC曲线')
plt.xlabel('FPR')
plt.ylabel('TPR')
plt.show()



101.png


计算ROC曲线的AUC值为0.988,看来模型很不错。


# 计算AUC值
from sklearn.metrics import roc_auc_score
score = roc_auc_score(Y_test,Y_pred_proba[:,1])


计算各个变量的影响程度,看看那个特征变量对模型的影响程度更高。


# 计算AUC值
features = X.columns
importances = model.feature_importances_
a = pd.DataFrame()
a['名称'] = features
a['重要性'] = importances
a.sort_values('重要性')



102.png


我们发现最大半径对模型的影响程度最高。


04小结


  1. 本文介绍了朴素贝叶斯方法的原理,并用肿瘤预测模型教大家如何搭建使用该模型。
  2. 本文仅供学习,不做它用。
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