pandas 分组知识

简介: pandas 分组知识

一、分组模式及其对象


1. 分组的一般模式


分组操作在日常生活中使用极其广泛,例如:

  • 依据\color{#FF0000}{性别}分组,统计全国人口\color{#00FF00}{寿命}的\color{#0000FF}{平均值}
  • 依据\color{#FF0000}{季节}分组,对每一个季节的\color{#00FF00}{温度}进行\color{#0000FF}{组内标准化}
  • 依据\color{#FF0000}{班级}筛选出组内\color{#00FF00}{数学分数}的\color{#0000FF}{平均值超过80分的班级}

从上述的几个例子中不难看出,想要实现分组操作,必须明确三个要素:\color{#FF0000}{分组依据}、\color{#00FF00}{数据来源}、\color{#0000FF}{操作及其返回结果}。同时从充分性的角度来说,如果明确了这三方面,就能确定一个分组操作,从而分组代码的一般模式即:

df.groupby(分组依据)[数据来源].使用操作

例如第一个例子中的代码就应该如下:

df.groupby('Gender')['Longevity'].mean()

现在返回到学生体测的数据集上,如果想要按照性别统计身高中位数,就可以如下写出:

df = pd.read_csv('../data/learn_pandas.csv')
df.groupby('Gender')['Height'].median()
Gender
Female    159.6
Male      173.4
Name: Height, dtype: float64


2. 分组依据的本质


前面提到的若干例子都是以单一维度进行分组的,比如根据性别,如果现在需要根据多个维度进行分组,该如何做?事实上,只需在groupby中传入相应列名构成的列表即可。例如,现希望根据学校和性别进行分组,统计身高的均值就可以如下写出:

df.groupby(['School', 'Gender'])['Height'].mean()
School                         Gender
Fudan University               Female    158.776923
                               Male      174.212500
Peking University              Female    158.666667
                               Male      172.030000
Shanghai Jiao Tong University  Female    159.122500
                               Male      176.760000
Tsinghua University            Female    159.753333
                               Male      171.638889
Name: Height, dtype: float64

目前为止,groupby的分组依据都是直接可以从列中按照名字获取的,那如果希望通过一定的复杂逻辑来分组,例如根据学生体重是否超过总体均值来分组,同样还是计算身高的均值。

首先应该先写出分组条件:

condition = df.Weight > df.Weight.mean()

然后将其传入groupby中:

df.groupby(condition)['Height'].mean()
Weight
False    159.034646
True     172.705357
Name: Height, dtype: float64


【练一练】


请根据上下四分位数分割,将体重分为high、normal、low三组,统计身高的均值。


【END】


从索引可以看出,其实最后产生的结果就是按照条件列表中元素的值(此处是TrueFalse)来分组,下面用随机传入字母序列来验证这一想法:

item = np.random.choice(list('abc'), df.shape[0])
df.groupby(item)['Height'].mean()
a    163.094828
b    163.874603
c    162.666129
Name: Height, dtype: float64

此处的索引就是原先item中的元素,如果传入多个序列进入groupby,那么最后分组的依据就是这两个序列对应行的唯一组合:

df.groupby([condition, item])['Height'].mean()
Weight   
False   a    159.334146
        b    159.257143
        c    158.543182
True    a    172.164706
        b    173.109524
        c    172.744444
Name: Height, dtype: float64

由此可以看出,之前传入列名只是一种简便的记号,事实上等价于传入的是一个或多个列,最后分组的依据来自于数据来源组合的unique值,通过drop_duplicates就能知道具体的组类别:

df[['School', 'Gender']].drop_duplicates()
School Gender
0 Shanghai Jiao Tong University Female
1 Peking University Male
2 Shanghai Jiao Tong University Male
3 Fudan University Female
4 Fudan University Male
5 Tsinghua University Female
9 Peking University Female
16 Tsinghua University Male
df.groupby([df['School'], df['Gender']])['Height'].mean()
School                         Gender
Fudan University               Female    158.776923
                               Male      174.212500
Peking University              Female    158.666667
                               Male      172.030000
Shanghai Jiao Tong University  Female    159.122500
                               Male      176.760000
Tsinghua University            Female    159.753333
                               Male      171.638889
Name: Height, dtype: float64


3. Groupby对象


能够注意到,最终具体做分组操作时,所调用的方法都来自于pandas中的groupby对象,这个对象上定义了许多方法,也具有一些方便的属性。

gb = df.groupby(['School', 'Grade'])
gb
<pandas.core.groupby.generic.DataFrameGroupBy object at 0x000001C1E7AB1408>

通过ngroups属性,可以得到分组个数:

gb.ngroups
16

通过groups属性,可以返回从\color{#FF0000}{组名}映射到\color{#FF0000}{组索引列表}的字典:

res = gb.groups
res.keys() # 字典的值由于是索引,元素个数过多,此处只展示字典的键
dict_keys([('Fudan University', 'Freshman'), ('Fudan University', 'Junior'), ('Fudan University', 'Senior'), ('Fudan University', 'Sophomore'), ('Peking University', 'Freshman'), ('Peking University', 'Junior'), ('Peking University', 'Senior'), ('Peking University', 'Sophomore'), ('Shanghai Jiao Tong University', 'Freshman'), ('Shanghai Jiao Tong University', 'Junior'), ('Shanghai Jiao Tong University', 'Senior'), ('Shanghai Jiao Tong University', 'Sophomore'), ('Tsinghua University', 'Freshman'), ('Tsinghua University', 'Junior'), ('Tsinghua University', 'Senior'), ('Tsinghua University', 'Sophomore')])


【练一练】


上一小节介绍了可以通过drop_duplicates得到具体的组类别,现请用groups属性完成类似的功能。


【END】


size作为DataFrame的属性时,返回的是表长乘以表宽的大小,但在groupby对象上表示统计每个组的元素个数:

gb.size()
School                         Grade    
Fudan University               Freshman      9
                               Junior       12
                               Senior       11
                               Sophomore     8
Peking University              Freshman     13
                               Junior        8
                               Senior        8
                               Sophomore     5
Shanghai Jiao Tong University  Freshman     13
                               Junior       17
                               Senior       22
                               Sophomore     5
Tsinghua University            Freshman     17
                               Junior       22
                               Senior       14
                               Sophomore    16
dtype: int64

通过get_group方法可以直接获取所在组对应的行,此时必须知道组的具体名字:

gb.get_group(('Fudan University', 'Freshman'))
School Grade Name Gender Height Weight Transfer Test_Number Test_Date Time_Record
15 Fudan University Freshman Changqiang Yang Female 156.0 49.0 N 3 2020/1/1 0:05:25
28 Fudan University Freshman Gaoqiang Qin Female 170.2 63.0 N 2 2020/1/7 0:05:24
63 Fudan University Freshman Gaofeng Zhao Female 152.2 43.0 N 2 2019/10/31 0:04:00
70 Fudan University Freshman Yanquan Wang Female 163.5 55.0 N 1 2019/11/19 0:04:07
73 Fudan University Freshman Feng Wang Male 176.3 74.0 N 1 2019/9/26 0:03:31
105 Fudan University Freshman Qiang Shi Female 164.5 52.0 N 1 2019/12/11 0:04:23
108 Fudan University Freshman Yanqiang Xu Female 152.4 38.0 N 1 2019/12/8 0:05:03
157 Fudan University Freshman Xiaoli Lv Female 152.5 45.0 N 2 2019/9/11 0:04:17
186 Fudan University Freshman Yanjuan Zhao Female NaN 53.0 N 2 2019/10/9 0:04:21

这里列出了2个属性和2个方法,而先前的meanmedian都是groupby对象上的方法,这些函数和许多其他函数的操作具有高度相似性,将在之后的小节进行专门介绍。


4. 分组的三大操作


熟悉了一些分组的基本知识后,重新回到开头举的三个例子,可能会发现一些端倪,即这三种类型分组返回的数据型态并不一样:

  • 第一个例子中,每一个组返回一个标量值,可以是平均值、中位数、组容量size
  • 第二个例子中,做了原序列的标准化处理,也就是说每组返回的是一个Series类型
  • 第三个例子中,既不是标量也不是序列,返回的整个组所在行的本身,即返回了DataFrame类型

由此,引申出分组的三大操作:聚合、变换和过滤,分别对应了三个例子的操作,下面就要分别介绍相应的aggtransformfilter函数及其操作。


二、聚合函数


1. 内置聚合函数


在介绍agg之前,首先要了解一些直接定义在groupby对象的聚合函数,因为它的速度基本都会经过内部的优化,使用功能时应当优先考虑。根据返回标量值的原则,包括如下函数:max/min/mean/median/count/all/any/idxmax/idxmin/mad/nunique/skew/quantile/sum/std/var/sem/size/prod

gb = df.groupby('Gender')['Height']
gb.idxmin()
Gender
Female    143
Male      199
Name: Height, dtype: int64
gb.quantile(0.95)
Gender
Female    166.8
Male      185.9
Name: Height, dtype: float64


【练一练】


请查阅文档,明确all/any/mad/skew/sem/prod函数的含义。


【END】


这些聚合函数当传入的数据来源包含多个列时,将按照列进行迭代计算:

gb = df.groupby('Gender')[['Height', 'Weight']]
gb.max()
Height Weight
Gender
Female 170.2 63.0
Male 193.9 89.0


2. agg方法


虽然在groupby对象上定义了许多方便的函数,但仍然有以下不便之处:

  • 无法同时使用多个函数
  • 无法对特定的列使用特定的聚合函数
  • 无法使用自定义的聚合函数
  • 无法直接对结果的列名在聚合前进行自定义命名

下面说明如何通过agg函数解决这四类问题:

【a】使用多个函数

当使用多个聚合函数时,需要用列表的形式把内置聚合函数对应的字符串传入,先前提到的所有字符串都是合法的。

gb.agg(['sum', 'idxmax', 'skew'])
复制代码
Height Weight
sum idxmax skew sum idxmax skew
Gender
Female 21014.0 28 -0.219253 6469.0 28 -0.268482
Male 8854.9 193 0.437535 3929.0 2 -0.332393

从结果看,此时的列索引为多级索引,第一层为数据源,第二层为使用的聚合方法,分别逐一对列使用聚合,因此结果为6列。

【b】对特定的列使用特定的聚合函数

对于方法和列的特殊对应,可以通过构造字典传入agg中实现,其中字典以列名为键,以聚合字符串或字符串列表为值。

gb.agg({'Height':['mean','max'], 'Weight':'count'})
复制代码
Height Weight
mean max count
Gender
Female 159.19697 170.2 135
Male 173.62549 193.9 54


【练一练】


请使用【b】中的传入字典的方法完成【a】中等价的聚合任务。


【END】


【c】使用自定义函数

agg中可以使用具体的自定义函数,\color{#FF0000}{需要注意传入函数的参数是之前数据源中的列,逐列进行计算}。下面分组计算身高和体重的极差:

gb.agg(lambda x: x.mean()-x.min())
Height Weight
Gender
Female 13.79697 13.918519
Male 17.92549 21.759259


【练一练】


groupby对象中可以使用describe方法进行统计信息汇总,请同时使用多个聚合函数,完成与该方法相同的功能。


【END】


由于传入的是序列,因此序列上的方法和属性都是可以在函数中使用的,只需保证返回值是标量即可。下面的例子是指,如果组的指标均值,超过该指标的总体均值,返回High,否则返回Low。


def my_func(s):
    res = 'High'
    if s.mean() <= df[s.name].mean():
        res = 'Low'
    return res
gb.agg(my_func)
Height Weight
Gender
Female Low Low
Male High High

【d】聚合结果重命名

如果想要对聚合结果的列名进行重命名,只需要将上述函数的位置改写成元组,元组的第一个元素为新的名字,第二个位置为原来的函数,包括聚合字符串和自定义函数,现举若干例子说明:

gb.agg([('range', lambda x: x.max()-x.min()), ('my_sum', 'sum')])
Height Weight
range my_sum range my_sum
Gender
Female 24.8 21014.0 29.0 6469.0
Male 38.2 8854.9 38.0 3929.0
gb.agg({'Height': [('my_func', my_func), 'sum'], 'Weight': lambda x:x.max()})
Height Weight
my_func sum
Gender
Female Low 21014.0 63.0
Male High 8854.9 89.0

另外需要注意,使用对一个或者多个列使用单个聚合的时候,重命名需要加方括号,否则就不知道是新的名字还是手误输错的内置函数字符串:

gb.agg([('my_sum', 'sum')])
Height Weight
my_sum my_sum
Gender
Female 21014.0 6469.0
Male 8854.9 3929.0
gb.agg({'Height': [('my_func', my_func), 'sum'], 'Weight': [('range', lambda x:x.max())]})
Height Weight
my_func sum range
Gender
Female Low 21014.0 63.0
Male High 8854.9 89.0


三、变换和过滤


1. 变换函数与transform方法


变换函数的返回值为同长度的序列,最常用的内置变换函数是累计函数:cumcount/cumsum/cumprod/cummax/cummin,它们的使用方式和聚合函数类似,只不过完成的是组内累计操作。此外在groupby对象上还定义了填充类和滑窗类的变换函数,这些函数的一般形式将会分别在第七章和第十章中讨论,此处略过。

gb.cummax().head()
Height Weight
0 158.9 46.0
1 166.5 70.0
2 188.9 89.0
3 NaN 46.0
4 188.9 89.0


【练一练】


groupby对象中,rank方法也是一个实用的变换函数,请查阅它的功能并给出一个使用的例子。


【END】


当用自定义变换时需要使用transform方法,被调用的自定义函数,\color{#FF0000}{其传入值为数据源的序列},与agg的传入类型是一致的,其最后的返回结果是行列索引与数据源一致的DataFrame

现对身高和体重进行分组标准化,即减去组均值后除以组的标准差:

gb.transform(lambda x: (x-x.mean())/x.std()).head()
复制代码
Height Weight
0 -0.058760 -0.354888
1 -1.010925 -0.355000
2 2.167063 2.089498
3 NaN -1.279789
4 0.053133 0.159631


【练一练】


对于transform方法无法像agg一样,通过传入字典来对指定列使用特定的变换,如果需要在一次transform的调用中实现这种功能,请给出解决方案。


【END】


前面提到了transform只能返回同长度的序列,但事实上还可以返回一个标量,这会使得结果被广播到其所在的整个组,这种\color{#FF0000}{标量广播}的技巧在特征工程中是非常常见的。例如,构造两列新特征来分别表示样本所在性别组的身高均值和体重均值:

gb.transform('mean').head() # 传入返回标量的函数也是可以的
Height Weight
0 159.19697 47.918519
1 173.62549 72.759259
2 173.62549 72.759259
3 159.19697 47.918519
4 173.62549 72.759259


2. 组索引与过滤


在上一章中介绍了索引的用法,那么索引和过滤有什么区别呢?

过滤在分组中是对于组的过滤,而索引是对于行的过滤,在第二章中的返回值,无论是布尔列表还是元素列表或者位置列表,本质上都是对于行的筛选,即如果符合筛选条件的则选入结果表,否则不选入。

组过滤作为行过滤的推广,指的是如果对一个组的全体所在行进行统计的结果返回True则会被保留,False则该组会被过滤,最后把所有未被过滤的组其对应的所在行拼接起来作为DataFrame返回。

groupby对象中,定义了filter方法进行组的筛选,其中自定义函数的输入参数为数据源构成的DataFrame本身,在之前例子中定义的groupby对象中,传入的就是df[['Height', 'Weight']],因此所有表方法和属性都可以在自定义函数中相应地使用,同时只需保证自定义函数的返回为布尔值即可。

例如,在原表中通过过滤得到所有容量大于100的组:

gb.filter(lambda x: x.shape[0] > 100).head()
Height Weight
0 158.9 46.0
3 NaN 41.0
5 158.0 51.0
6 162.5 52.0
7 161.9 50.0


【练一练】


从概念上说,索引功能是组过滤功能的子集,请使用filter函数完成loc[...]的功能,这里假设"..."是元素列表。


【END】


四、跨列分组


1. apply的引入


之前几节介绍了三大分组操作,但事实上还有一种常见的分组场景,无法用前面介绍的任何一种方法处理,例如现在如下定义身体质量指数BMI: BMI=WeightHeight2{\rm BMI} = {\rm\frac{Weight}{Height^2}}BMI=Height2Weight 其中体重和身高的单位分别为千克和米,需要分组计算组BMI的均值。

首先,这显然不是过滤操作,因此filter不符合要求;其次,返回的均值是标量而不是序列,因此transform不符合要求;最后,似乎使用agg函数能够处理,但是之前强调过聚合函数是逐列处理的,而不能够\color{#FF0000}{多列数据同时处理}。由此,引出了apply函数来解决这一问题。


2. apply的使用


在设计上,apply的自定义函数传入参数与filter完全一致,只不过后者只允许返回布尔值。现如下解决上述计算问题:

def BMI(x):
    Height = x['Height']/100
    Weight = x['Weight']
    BMI_value = Weight/Height**2
    return BMI_value.mean()
gb.apply(BMI)
Gender
Female    18.860930
Male      24.318654
dtype: float64

除了返回标量之外,apply方法还可以返回一维Series和二维DataFrame,但它们产生的数据框维数和多级索引的层数应当如何变化?下面举三组例子就非常容易明白结果是如何生成的:

【a】标量情况:结果得到的是 Series ,索引与 agg 的结果一致

gb = df.groupby(['Gender','Test_Number'])[['Height','Weight']]
gb.apply(lambda x: 0)
Gender  Test_Number
Female  1              0
        2              0
        3              0
Male    1              0
        2              0
        3              0
dtype: int64
gb.apply(lambda x: [0, 0]) # 虽然是列表,但是作为返回值仍然看作标量
Gender  Test_Number
Female  1              [0, 0]
        2              [0, 0]
        3              [0, 0]
Male    1              [0, 0]
        2              [0, 0]
        3              [0, 0]
dtype: object

【b】Series情况:得到的是DataFrame,行索引与标量情况一致,列索引为Series的索引

gb.apply(lambda x: pd.Series([0,0],index=['a','b']))
a b
Gender Test_Number
Female 1 0 0
2 0 0
3 0 0
Male 1 0 0
2 0 0
3 0 0

.markdown-body pre,.markdown-body pre>code.hljs{color:#333;background:#f8f8f8}.hljs-comment,.hljs-quote{color:#998;font-style:italic}.hljs-keyword,.hljs-selector-tag,.hljs-subst{color:#333;font-weight:700}.hljs-literal,.hljs-number,.hljs-tag .hljs-attr,.hljs-template-variable,.hljs-variable{color:teal}.hljs-doctag,.hljs-string{color:#d14}.hljs-section,.hljs-selector-id,.hljs-title{color:#900;font-weight:700}.hljs-subst{font-weight:400}.hljs-class .hljs-title,.hljs-type{color:#458;font-weight:700}.hljs-attribute,.hljs-name,.hljs-tag{color:navy;font-weight:400}.hljs-link,.hljs-regexp{color:#009926}.hljs-bullet,.hljs-symbol{color:#990073}.hljs-built_in,.hljs-builtin-name{color:#0086b3}.hljs-meta{color:#999;font-weight:700}.hljs-deletion{background:#fdd}.hljs-addition{background:#dfd}.hljs-emphasis{font-style:italic}.hljs-strong{font-weight:700}


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