一次 group by + order by 性能优化分析

本文涉及的产品
云数据库 RDS MySQL,集群系列 2核4GB
推荐场景:
搭建个人博客
RDS MySQL Serverless 基础系列,0.5-2RCU 50GB
RDS MySQL Serverless 高可用系列,价值2615元额度,1个月
简介: 我的个人博客 https://mengkang.net/1302.html 最近通过一个日志表做排行的时候发现特别卡,最后问题得到了解决,梳理一些索引和MySQL执行过程的经验,但是最后还是有5个谜题没解开,希望大家帮忙解答下 主要包含如下知识点 用数据说话证明慢日志的扫描行数到底是如何统计出来的 从 group by 执行原理找出优化方案 排序的实现细节 gdb 源码调试 背景 需要分别统计本月、本周被访问的文章的 TOP10。

我的个人博客 https://mengkang.net/1302.html

最近通过一个日志表做排行的时候发现特别卡,最后问题得到了解决,梳理一些索引和MySQL执行过程的经验,但是最后还是有5个谜题没解开,希望大家帮忙解答下

主要包含如下知识点

  • 用数据说话证明慢日志的扫描行数到底是如何统计出来的
  • 从 group by 执行原理找出优化方案
  • 排序的实现细节
  • gdb 源码调试

背景

需要分别统计本月、本周被访问的文章的 TOP10。日志表如下

CREATE TABLE `article_rank` (
  `id` int(11) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `aid` int(11) unsigned NOT NULL,
  `pv` int(11) unsigned NOT NULL DEFAULT '1',
  `day` int(11) NOT NULL COMMENT '日期 例如 20171016',
  PRIMARY KEY (`id`),
  KEY `idx_day_aid_pv` (`day`,`aid`,`pv`),
  KEY `idx_aid_day_pv` (`aid`,`day`,`pv`)
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8

准备工作

为了能够清晰的验证自己的一些猜想,在虚拟机里安装了一个 debug 版的 mysql,然后开启了慢日志收集,用于统计扫描行数

安装

  • 下载源码
  • 编译安装
  • 创建 mysql 用户
  • 初始化数据库
  • 初始化 mysql 配置文件
  • 修改密码

如果你兴趣,具体可以参考我的博客,一步步安装 https://mengkang.net/1335.html

开启慢日志

编辑配置文件,在[mysqld]块下添加

slow_query_log=1
slow_query_log_file=xxx
long_query_time=0
log_queries_not_using_indexes=1

性能分析

发现问题

假如我需要查询2018-12-20 ~ 2018-12-24这5天浏览量最大的10篇文章的 sql 如下,首先使用explain看下分析结果

mysql> explain select aid,sum(pv) as num from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+--------+----------+-----------------------------------------------------------+
| id | select_type | table        | partitions | type  | possible_keys                 | key            | key_len | ref  | rows   | filtered | Extra                                                     |
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+--------+----------+-----------------------------------------------------------+
|  1 | SIMPLE      | article_rank | NULL       | range | idx_day_aid_pv,idx_aid_day_pv | idx_day_aid_pv | 4       | NULL | 404607 |   100.00 | Using where; Using index; Using temporary; Using filesort |
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+--------+----------+-----------------------------------------------------------+

系统默认会走的索引是idx_day_aid_pv,根据Extra信息我们可以看到,使用idx_day_aid_pv索引的时候,会走覆盖索引,但是会使用临时表,会有排序。

我们查看下慢日志里的记录信息

# Time: 2019-03-17T03:02:27.984091Z
# User@Host: root[root] @ localhost []  Id:     6
# Query_time: 56.959484  Lock_time: 0.000195 Rows_sent: 10  Rows_examined: 1337315
SET timestamp=1552791747;
select aid,sum(pv) as num from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;

为什么扫描行数是 1337315

我们查询两个数据,一个是满足条件的行数,一个是group by统计之后的行数。

mysql> select count(*) from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224;
+----------+
| count(*) |
+----------+
|   785102 |
+----------+

mysql> select count(distinct aid) from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224;
+---------------------+
| count(distinct aid) |
+---------------------+
|              552203 |
+---------------------+

发现满足条件的总行数(785102)+group by 之后的总行数(552203)+limit 的值 = 慢日志里统计的 Rows_examined

要解答这个问题,就必须搞清楚上面这个 sql 到底分别都是如何运行的。

执行流程分析

索引示例

为了便于理解,我按照索引的规则先模拟idx_day_aid_pv索引的一小部分数据

day aid pv id
20181220 1 23 1234
20181220 3 2 1231
20181220 4 1 1212
20181220 7 2 1221
20181221 1 5 1257
20181221 10 1 1251
20181221 11 8 1258

因为索引idx_day_aid_pv最左列是day,所以当我们需要查找20181220~20181224之间的文章的pv总和的时候,我们需要遍历20181220~20181224这段数据的索引。

查看 optimizer trace 信息

# 开启 optimizer_trace
set optimizer_trace='enabled=on';
# 执行 sql 
select aid,sum(pv) as num from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;
# 查看 trace 信息
select trace from `information_schema`.`optimizer_trace`\G;

摘取里面最后的执行结果如下

{
  "join_execution": {
    "select#": 1,
    "steps": [
      {
        "creating_tmp_table": {
          "tmp_table_info": {
            "table": "intermediate_tmp_table",
            "row_length": 20,
            "key_length": 4,
            "unique_constraint": false,
            "location": "memory (heap)",
            "row_limit_estimate": 838860
          }
        }
      },
      {
        "converting_tmp_table_to_ondisk": {
          "cause": "memory_table_size_exceeded",
          "tmp_table_info": {
            "table": "intermediate_tmp_table",
            "row_length": 20,
            "key_length": 4,
            "unique_constraint": false,
            "location": "disk (InnoDB)",
            "record_format": "fixed"
          }
        }
      },
      {
        "filesort_information": [
          {
            "direction": "desc",
            "table": "intermediate_tmp_table",
            "field": "num"
          }
        ],
        "filesort_priority_queue_optimization": {
          "limit": 10,
          "rows_estimate": 1057,
          "row_size": 36,
          "memory_available": 262144,
          "chosen": true
        },
        "filesort_execution": [
        ],
        "filesort_summary": {
          "rows": 11,
          "examined_rows": 552203,
          "number_of_tmp_files": 0,
          "sort_buffer_size": 488,
          "sort_mode": "<sort_key, additional_fields>"
        }
      }
    ]
  }
}

分析临时表字段

mysql gdb 调试更多细节 https://mengkang.net/1336.html

通过gdb调试确认临时表上的字段是aidnum

Breakpoint 1, trace_tmp_table (trace=0x7eff94003088, table=0x7eff94937200) at /root/newdb/mysql-server/sql/sql_tmp_table.cc:2306
warning: Source file is more recent than executable.
2306      trace_tmp.add("row_length",table->s->reclength).
(gdb) p table->s->reclength
$1 = 20
(gdb) p table->s->fields
$2 = 2
(gdb) p (*(table->field+0))->field_name
$3 = 0x7eff94010b0c "aid"
(gdb) p (*(table->field+1))->field_name
$4 = 0x7eff94007518 "num"
(gdb) p (*(table->field+0))->row_pack_length()
$5 = 4
(gdb) p (*(table->field+1))->row_pack_length()
$6 = 15
(gdb) p (*(table->field+0))->type()
$7 = MYSQL_TYPE_LONG
(gdb) p (*(table->field+1))->type()
$8 = MYSQL_TYPE_NEWDECIMAL
(gdb)

通过上面的打印,确认了字段类型,一个aidMYSQL_TYPE_LONG,占4字节,numMYSQL_TYPE_NEWDECIMAL,占15字节。

The SUM() and AVG() functions return a DECIMAL value for exact-value arguments (integer or DECIMAL), and a DOUBLE value for approximate-value arguments (FLOAT or DOUBLE). (Before MySQL 5.0.3, SUM() and AVG() return DOUBLE for all numeric arguments.)

但是通过我们上面打印信息可以看到两个字段的长度加起来是19,而optimizer_trace里的tmp_table_info.reclength20。通过其他实验也发现table->s->reclength的长度就是table->field数组里面所有字段的字段长度和再加1。

总结执行流程

  1. 尝试在堆上使用memory的内存临时表来存放group by的数据,发现内存不够;
  2. 创建一张临时表,临时表上有两个字段,aidnum字段(sum(pv) as num);
  3. 从索引idx_day_aid_pv中取出1行,插入临时表。插入规则是如果aid不存在则直接插入,如果存在,则把pv的值累加在num上;
  4. 循环遍历索引idx_day_aid_pv20181220~20181224之间的所有行,执行步骤3;
  5. 对临时表根据num的值做优先队列排序;
  6. 取出最后留在堆(优先队列的堆)里面的10行数据,作为结果集直接返回,不需要再回表;

补充说明优先队列排序执行步骤分析:

  1. 在临时表(未排序)中取出前 10 行,把其中的numaid作为10个元素构成一个小顶堆,也就是最小的 num 在堆顶。
  2. 取下一行,根据 num 的值和堆顶值作比较,如果该字大于堆顶的值,则替换掉。然后将新的堆做堆排序。
  3. 重复步骤2直到第 552203 行比较完成。

优化

方案1 使用 idx_aid_day_pv 索引

# Query_time: 4.406927  Lock_time: 0.000200 Rows_sent: 10  Rows_examined: 1337315
SET timestamp=1552791804;
select aid,sum(pv) as num from article_rank force index(idx_aid_day_pv) where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;

扫描行数都是1337315,为什么执行消耗的时间上快了12倍呢?

索引示例

为了便于理解,同样我也按照索引的规则先模拟idx_aid_day_pv索引的一小部分数据

aid day pv id
1 20181220 23 1234
1 20181221 5 1257
3 20181220 2 1231
3 20181222 22 1331
3 20181224 13 1431
4 20181220 1 1212
7 20181220 2 1221
10 20181221 1 1251
11 20181221 8 1258

group by 不需要临时表的情况

为什么性能上比 SQL1 高了,很多呢,原因之一是idx_aid_day_pv索引上aid是确定有序的,那么执行group by的时候,则不会创建临时表,排序的时候才需要临时表。如果印证这一点呢,我们通过下面的执行计划就能看到

使用idx_day_aid_pv索引的效果:

mysql> explain select aid,sum(pv) as num from article_rank force index(idx_day_aid_pv) where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by null limit 10;
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+--------+----------+-------------------------------------------+
| id | select_type | table        | partitions | type  | possible_keys                 | key            | key_len | ref  | rows   | filtered | Extra                                     |
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+--------+----------+-------------------------------------------+
|  1 | SIMPLE      | article_rank | NULL       | range | idx_day_aid_pv,idx_aid_day_pv | idx_day_aid_pv | 4       | NULL | 404607 |   100.00 | Using where; Using index; Using temporary |
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+--------+----------+-------------------------------------------+

注意我上面使用了order by null表示强制对group by的结果不做排序。如果不加order by null,上面的 sql 则会出现Using filesort

使用idx_aid_day_pv索引的效果:

mysql> explain select aid,sum(pv) as num from article_rank force index(idx_aid_day_pv) where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by null limit 10;
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+------+----------+--------------------------+
| id | select_type | table        | partitions | type  | possible_keys                 | key            | key_len | ref  | rows | filtered | Extra                    |
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+------+----------+--------------------------+
|  1 | SIMPLE      | article_rank | NULL       | index | idx_day_aid_pv,idx_aid_day_pv | idx_aid_day_pv | 12      | NULL |   10 |    11.11 | Using where; Using index |
+----+-------------+--------------+------------+-------+-------------------------------+----------------+---------+------+------+----------+--------------------------+

查看 optimizer trace 信息

# 开启optimizer_trace
set optimizer_trace='enabled=on';
# 执行 sql 
select aid,sum(pv) as num from article_rank force index(idx_aid_day_pv) where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;
# 查看 trace 信息
select trace from `information_schema`.`optimizer_trace`\G;

摘取里面最后的执行结果如下

{
  "join_execution": {
    "select#": 1,
    "steps": [
      {
        "creating_tmp_table": {
          "tmp_table_info": {
            "table": "intermediate_tmp_table",
            "row_length": 20,
            "key_length": 0,
            "unique_constraint": false,
            "location": "memory (heap)",
            "row_limit_estimate": 838860
          }
        }
      },
      {
        "filesort_information": [
          {
            "direction": "desc",
            "table": "intermediate_tmp_table",
            "field": "num"
          }
        ],
        "filesort_priority_queue_optimization": {
          "limit": 10,
          "rows_estimate": 552213,
          "row_size": 24,
          "memory_available": 262144,
          "chosen": true
        },
        "filesort_execution": [
        ],
        "filesort_summary": {
          "rows": 11,
          "examined_rows": 552203,
          "number_of_tmp_files": 0,
          "sort_buffer_size": 352,
          "sort_mode": "<sort_key, rowid>"
        }
      }
    ]
  }
}

执行流程如下

  1. 创建一张临时表,临时表上有两个字段,aidnum字段(sum(pv) as num);
  2. 读取索引idx_aid_day_pv中的一行,然后查看是否满足条件,如果day字段不在条件范围内(20181220~20181224之间),则读取下一行;如果day字段在条件范围内,则把pv值累加(不是在临时表中操作);
  3. 读取索引idx_aid_day_pv中的下一行,如果aid与步骤1中一致且满足条件,则pv值累加(不是在临时表中操作)。如果aid与步骤1中不一致,则把之前的结果集写入临时表;
  4. 循环执行步骤2、3,直到扫描完整个idx_aid_day_pv索引;
  5. 对临时表根据num的值做优先队列排序;
  6. 根据查询到的前10条的rowid回表(临时表)返回结果集。

补充说明优先队列排序执行步骤分析:

  1. 在临时表(未排序)中取出前 10 行,把其中的numrowid作为10个元素构成一个小顶堆,也就是最小的 num 在堆顶。
  2. 取下一行,根据 num 的值和堆顶值作比较,如果该字大于堆顶的值,则替换掉。然后将新的堆做堆排序。
  3. 重复步骤2直到第 552203 行比较完成。

该方案可行性

实验发现,当我增加一行20181219的数据时,虽然这行记录不满足我们的需求,但是扫描索引的也会读取这行。因为我做这个实验,只弄了20181220~201812245天的数据,所以需要扫描的行数正好是全表数据行数。

那么如果该表的数据存储的不是5天的数据,而是10天的数据呢,更或者是365天的数据呢?这个方案是否还可行呢?先模拟10天的数据,在现有时间基础上往后加5天,行数与现在一样785102行。

drop procedure if exists idata;
delimiter ;;
create procedure idata()
begin
  declare i int;
  declare aid int;
  declare pv int;
  declare post_day int;
  set i=1;
  while(i<=785102)do
    set aid = round(rand()*500000);
    set pv = round(rand()*100);
    set post_day = 20181225 + i%5;
    insert into article_rank (`aid`,`pv`,`day`) values(aid, pv, post_day);
    set i=i+1;
  end while;
end;;
delimiter ;
call idata();
# Query_time: 9.151270  Lock_time: 0.000508 Rows_sent: 10  Rows_examined: 2122417
SET timestamp=1552889936;
select aid,sum(pv) as num from article_rank force index(idx_aid_day_pv) where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;

这里扫描行数2122417是因为扫描索引的时候需要遍历整个索引,整个索引的行数就是全表行数,因为我刚刚又插入了785102行。

当我数据量翻倍之后,这里查询时间明显已经翻倍。所以这个优化方式不稳定。

方案2 扩充临时表空间上限大小

默认的临时表空间大小是16MB

mysql> show global variables like '%table_size';
+---------------------+----------+
| Variable_name       | Value    |
+---------------------+----------+
| max_heap_table_size | 16777216 |
| tmp_table_size      | 16777216 |
+---------------------+----------+

https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/server-system-variables.html#sysvar_max_heap_table_size
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/server-system-variables.html#sysvar_tmp_table_size

max_heap_table_size
This variable sets the maximum size to which user-created MEMORY tables are permitted to grow. The value of the variable is used to calculate MEMORY table MAX_ROWS values. Setting this variable has no effect on any existing MEMORY table, unless the table is re-created with a statement such as CREATE TABLE or altered with ALTER TABLE or TRUNCATE TABLE. A server restart also sets the maximum size of existing MEMORY tables to the global max_heap_table_size value.

tmp_table_size
The maximum size of internal in-memory temporary tables. This variable does not apply to user-created MEMORY tables.
The actual limit is determined from whichever of the values of tmp_table_size and max_heap_table_size is smaller. If an in-memory temporary table exceeds the limit, MySQL automatically converts it to an on-disk temporary table. The internal_tmp_disk_storage_engine option defines the storage engine used for on-disk temporary tables.

也就是说这里临时表的限制是16Mmax_heap_table_size大小也受tmp_table_size大小的限制。

所以我们这里调整为32MB,然后执行原始的SQL

set tmp_table_size=33554432;
set max_heap_table_size=33554432;
# Query_time: 5.910553  Lock_time: 0.000210 Rows_sent: 10  Rows_examined: 1337315
SET timestamp=1552803869;
select aid,sum(pv) as num from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;

方案3 使用 SQL_BIG_RESULT 优化

告诉优化器,查询结果比较多,临时表直接走磁盘存储。

# Query_time: 6.144315  Lock_time: 0.000183 Rows_sent: 10  Rows_examined: 2122417
SET timestamp=1552802804;
select SQL_BIG_RESULT aid,sum(pv) as num from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;

扫描行数是 2x满足条件的总行数(785102)+group by 之后的总行数(552203)+limit 的值

顺便值得一提的是: 当我把数据量翻倍之后,使用该方式,查询时间基本没变。因为扫描的行数还是不变的。实际测试耗时6.197484

总结

方案1优化效果不稳定,当总表数据量与查询范围的总数相同时,且不超出内存临时表大小限制时,性能达到最佳。当查询数据量占据总表数据量越大,优化效果越不明显;
方案2需要调整临时表内存的大小,可行;不过当数据库超过32MB时,如果使用该方式,还需要继续提升临时表大小;
方案3直接声明使用磁盘来放临时表,虽然扫描行数多了一次符合条件的总行数的扫描。但是整体响应时间比方案2就慢了0.1秒。因为我们这里数据量比较,我觉得这个时间差还能接受。

所以最后对比,选择方案3比较合适。

问题与困惑

# SQL1
select aid,sum(pv) as num from article_rank where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;
# SQL2
select aid,sum(pv) as num from article_rank force index(idx_aid_day_pv) where day>=20181220 and day<=20181224 group by aid order by num desc limit 10;
  1. SQL1 执行过程中,使用的是全字段排序最后不需要回表为什么总扫描行数还要加上10才对得上?
  2. SQL1 与 SQL2 group by之后得到的行数都是552203,为什么会出现 SQL1 内存不够,里面还有哪些细节呢?
  3. trace 信息里的creating_tmp_table.tmp_table_info.row_limit_estimate都是838860;计算由来是临时表的内存限制大小16MB,而一行需要占的空间是20字节,那么最多只能容纳floor(16777216/20) = 838860行,而实际我们需要放入临时表的行数是785102。为什么呢?
  4. SQL1 使用SQL_BIG_RESULT优化之后,原始表需要扫描的行数会乘以2,背后逻辑是什么呢?为什么仅仅是不再尝试往内存临时表里写入这一步会相差10多倍的性能?
  5. 通过源码看到 trace 信息里面很多扫描行数都不是实际的行数,既然是实际执行,为什么 trace 信息里不输出真实的扫描行数和容量等呢,比如filesort_priority_queue_optimization.rows_estimate在SQL1中的扫描行数我通过gdb看到计算规则如附录图 1
  6. 有没有工具能够统计 SQL 执行过程中的 I/O 次数?

附录

图1

相关实践学习
阿里云图数据库GDB入门与应用
图数据库(Graph Database,简称GDB)是一种支持Property Graph图模型、用于处理高度连接数据查询与存储的实时、可靠的在线数据库服务。它支持Apache TinkerPop Gremlin查询语言,可以帮您快速构建基于高度连接的数据集的应用程序。GDB非常适合社交网络、欺诈检测、推荐引擎、实时图谱、网络/IT运营这类高度互连数据集的场景。 GDB由阿里云自主研发,具备如下优势: 标准图查询语言:支持属性图,高度兼容Gremlin图查询语言。 高度优化的自研引擎:高度优化的自研图计算层和存储层,云盘多副本保障数据超高可靠,支持ACID事务。 服务高可用:支持高可用实例,节点故障迅速转移,保障业务连续性。 易运维:提供备份恢复、自动升级、监控告警、故障切换等丰富的运维功能,大幅降低运维成本。 产品主页:https://www.aliyun.com/product/gdb
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