PyTorch 2.2 中文官方教程(九)(3)https://developer.aliyun.com/article/1482548
使用分析器进行性能调试
分析器可用于识别模型中的性能瓶颈。在此示例中,我们构建了一个执行两个子任务的自定义模块:
- 对输入进行线性变换,并
- 使用转换结果在掩码张量上获取索引。
我们使用profiler.record_function("label")
将每个子任务的代码包装在单独的带标签的上下文管理器中。在分析器输出中,子任务中所有操作的聚合性能指标将显示在相应的标签下。
请注意,使用分析器会产生一些开销,最好仅用于调查代码。如果您正在进行运行时间基准测试,请记得将其删除。
class MyModule(nn.Module): def __init__(self, in_features: int, out_features: int, bias: bool = True): super(MyModule, self).__init__() self.linear = nn.Linear(in_features, out_features, bias) def forward(self, input, mask): with profiler.record_function("LINEAR PASS"): out = self.linear(input) with profiler.record_function("MASK INDICES"): threshold = out.sum(axis=1).mean().item() hi_idx = np.argwhere(mask.cpu().numpy() > threshold) hi_idx = torch.from_numpy(hi_idx).cuda() return out, hi_idx
分析前向传递
我们初始化随机输入和掩码张量,以及模型。
在运行分析器之前,我们先热身 CUDA 以确保准确的性能基准测试。我们将模块的前向传递包装在profiler.profile
上下文管理器中。with_stack=True
参数会在跟踪中附加操作的文件和行号。
警告
with_stack=True
会产生额外的开销,更适合用于调查代码。如果您正在进行性能基准测试,请记得将其删除。
model = MyModule(500, 10).cuda() input = torch.rand(128, 500).cuda() mask = torch.rand((500, 500, 500), dtype=torch.double).cuda() # warm-up model(input, mask) with profiler.profile(with_stack=True, profile_memory=True) as prof: out, idx = model(input, mask)
打印分析器结果
最后,我们打印分析器结果。profiler.key_averages
按运算符名称聚合结果,并可选择按输入形状和/或堆栈跟踪事件进行分组。按输入形状分组有助于识别模型使用的张量形状。
在这里,我们使用group_by_stack_n=5
,它按操作及其回溯(截断为最近的 5 个事件)对运行时间进行聚合,并按其注册顺序显示事件。表格也可以通过传递sort_by
参数进行排序(请参考文档以获取有效的排序键)。
注意
在笔记本中运行分析器时,您可能会看到类似(13): forward
的条目,而不是堆栈跟踪中的文件名。这些对应于(行号): 调用函数
。
print(prof.key_averages(group_by_stack_n=5).table(sort_by='self_cpu_time_total', row_limit=5)) """ (Some columns are omitted) ------------- ------------ ------------ ------------ --------------------------------- Name Self CPU % Self CPU Self CPU Mem Source Location ------------- ------------ ------------ ------------ --------------------------------- MASK INDICES 87.88% 5.212s -953.67 Mb /mnt/xarfuse/.../torch/au <ipython-input-...>(10): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::copy_ 12.07% 715.848ms 0 b <ipython-input-...>(12): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ LINEAR PASS 0.01% 350.151us -20 b /mnt/xarfuse/.../torch/au <ipython-input-...>(7): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::addmm 0.00% 293.342us 0 b /mnt/xarfuse/.../torch/nn /mnt/xarfuse/.../torch/nn /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(8): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn aten::mean 0.00% 235.095us 0 b <ipython-input-...>(11): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ ----------------------------- ------------ ---------- ---------------------------------- Self CPU time total: 5.931s """
提高内存性能
请注意,从内存和时间方面来看,最昂贵的操作是forward (10)
,代表 MASK INDICES 内的操作。让我们先尝试解决内存消耗问题。我们可以看到第 12 行的.to()
操作消耗了 953.67 Mb。此操作将mask
复制到 CPU。mask
是用torch.double
数据类型初始化的。我们是否可以通过将其转换为torch.float
来减少内存占用?
model = MyModule(500, 10).cuda() input = torch.rand(128, 500).cuda() mask = torch.rand((500, 500, 500), dtype=torch.float).cuda() # warm-up model(input, mask) with profiler.profile(with_stack=True, profile_memory=True) as prof: out, idx = model(input, mask) print(prof.key_averages(group_by_stack_n=5).table(sort_by='self_cpu_time_total', row_limit=5)) """ (Some columns are omitted) ----------------- ------------ ------------ ------------ -------------------------------- Name Self CPU % Self CPU Self CPU Mem Source Location ----------------- ------------ ------------ ------------ -------------------------------- MASK INDICES 93.61% 5.006s -476.84 Mb /mnt/xarfuse/.../torch/au <ipython-input-...>(10): forward /mnt/xarfuse/ /torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::copy_ 6.34% 338.759ms 0 b <ipython-input-...>(12): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::as_strided 0.01% 281.808us 0 b <ipython-input-...>(11): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::addmm 0.01% 275.721us 0 b /mnt/xarfuse/.../torch/nn /mnt/xarfuse/.../torch/nn /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(8): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn aten::_local 0.01% 268.650us 0 b <ipython-input-...>(11): forward _scalar_dense /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(9): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ ----------------- ------------ ------------ ------------ -------------------------------- Self CPU time total: 5.347s """
此操作的 CPU 内存占用减半。
提高时间性能
虽然消耗的时间也有所减少,但仍然太高。原来从 CUDA 到 CPU 复制矩阵是非常昂贵的!forward (12)
中的aten::copy_
操作符将mask
复制到 CPU,以便可以使用 NumPy 的argwhere
函数。forward(13)
中的aten::copy_
将数组复制回 CUDA 作为张量。如果我们在这里使用torch
函数nonzero()
,就可以消除这两个操作。
class MyModule(nn.Module): def __init__(self, in_features: int, out_features: int, bias: bool = True): super(MyModule, self).__init__() self.linear = nn.Linear(in_features, out_features, bias) def forward(self, input, mask): with profiler.record_function("LINEAR PASS"): out = self.linear(input) with profiler.record_function("MASK INDICES"): threshold = out.sum(axis=1).mean() hi_idx = (mask > threshold).nonzero(as_tuple=True) return out, hi_idx model = MyModule(500, 10).cuda() input = torch.rand(128, 500).cuda() mask = torch.rand((500, 500, 500), dtype=torch.float).cuda() # warm-up model(input, mask) with profiler.profile(with_stack=True, profile_memory=True) as prof: out, idx = model(input, mask) print(prof.key_averages(group_by_stack_n=5).table(sort_by='self_cpu_time_total', row_limit=5)) """ (Some columns are omitted) -------------- ------------ ------------ ------------ --------------------------------- Name Self CPU % Self CPU Self CPU Mem Source Location -------------- ------------ ------------ ------------ --------------------------------- aten::gt 57.17% 129.089ms 0 b <ipython-input-...>(12): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(25): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::nonzero 37.38% 84.402ms 0 b <ipython-input-...>(12): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(25): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ INDEX SCORE 3.32% 7.491ms -119.21 Mb /mnt/xarfuse/.../torch/au <ipython-input-...>(10): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(25): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::as_strided 0.20% 441.587us 0 b <ipython-input-...>(12): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(25): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ aten::nonzero _numpy 0.18% 395.602us 0 b <ipython-input-...>(12): forward /mnt/xarfuse/.../torch/nn <ipython-input-...>(25): <module> /mnt/xarfuse/.../IPython/ /mnt/xarfuse/.../IPython/ -------------- ------------ ------------ ------------ --------------------------------- Self CPU time total: 225.801ms """
进一步阅读
我们已经看到了如何使用分析器来调查 PyTorch 模型中的时间和内存瓶颈。在这里阅读更多关于分析器的信息:
脚本的总运行时间: ( 0 分钟 0.000 秒)
下载 Python 源代码: profiler.py
下载 Jupyter 笔记本: profiler.ipynb
全面跟踪分析简介
原文:
pytorch.org/tutorials/beginner/hta_intro_tutorial.html
译者:飞龙
在本教程中,我们演示如何使用全面跟踪分析(HTA)来分析分布式训练作业的跟踪。要开始,请按照以下步骤操作。
安装 HTA
我们建议使用 Conda 环境安装 HTA。要安装 Anaconda,请参阅官方 Anaconda 文档。
- 使用 pip 安装 HTA:
pip install HolisticTraceAnalysis
- (可选但建议)设置一个 Conda 环境:
# create the environment env_name conda create -n env_name # activate the environment conda activate env_name # When you are done, deactivate the environment by running ``conda deactivate``
入门指南
启动 Jupyter 笔记本,并将trace_dir
变量设置为跟踪位置。
from hta.trace_analysis import TraceAnalysis trace_dir = "/path/to/folder/with/traces" analyzer = TraceAnalysis(trace_dir=trace_dir)
时间细分
为了有效利用 GPU,了解它们为特定作业花费时间至关重要。它们主要是在计算、通信、内存事件中还是空闲?时间细分功能提供了这三个类别中所花费时间的详细分析。
- 空闲时间 - GPU 空闲。
- 计算时间 - GPU 用于矩阵乘法或向量操作。
- 非计算时间 - GPU 用于通信或内存事件。
为了实现高效的训练,代码应最大化计算时间,最小化空闲时间和非计算时间。以下函数生成一个数据框,提供每个等级的时间使用情况的详细分解。
analyzer = TraceAnalysis(trace_dir = "/path/to/trace/folder") time_spent_df = analyzer.get_temporal_breakdown()
当在get_temporal_breakdown函数中将visualize
参数设置为True
时,它还会生成一个按等级分解的条形图。
空闲时间细分
深入了解 GPU 空闲时间及其原因可以帮助指导优化策略。当 GPU 上没有运行任何内核时,GPU 被视为空闲。我们开发了一种算法,将空闲时间分类为三个不同的类别:
- **主机等待:**指的是由于 CPU 未能快速排队内核以使 GPU 完全利用而导致的 GPU 上的空闲时间。这些类型的低效率可以通过检查导致减速的 CPU 运算符、增加批量大小和应用运算符融合来解决。
- **内核等待:**指的是在 GPU 上连续启动内核时伴随的短暂开销。归因为此类别的空闲时间可以通过使用 CUDA 图优化来最小化。
- **其他等待:**此类别包括由于信息不足而目前无法归因的空闲时间。可能的原因包括使用 CUDA 事件在 CUDA 流之间同步以及启动内核时的延迟。
主机等待时间可以解释为 GPU 由于 CPU 而停滞的时间。为了将空闲时间归因为内核等待,我们使用以下启发式方法:
连续内核之间的间隔<阈值
默认阈值为 30 纳秒,可以使用consecutive_kernel_delay
参数进行配置。默认情况下,仅为等级 0 计算空闲时间细分。为了计算其他等级的细分,可以在get_idle_time_breakdown函数中使用ranks
参数。空闲时间细分可以按以下方式生成:
analyzer = TraceAnalysis(trace_dir = "/path/to/trace/folder") idle_time_df = analyzer.get_idle_time_breakdown()
该函数返回一个数据框的元组。第一个数据框包含每个流中每个等级的类别空闲时间。
第二个数据框是在将show_idle_interval_stats
设置为True
时生成的。它包含每个流在每个 rank 上的空闲时间的摘要统计信息。
提示
默认情况下,空闲时间分解显示每个空闲时间类别的百分比。将visualize_pctg
参数设置为False
,函数将以 y 轴上的绝对时间呈现。
内核分解
内核分解功能将每种内核类型(如通信(COMM)、计算(COMP)和内存(MEM))花费的时间分解,跨所有 rank,并呈现在每个类别中花费的时间比例。这是每个类别中花费的时间的百分比饼图:
内核分解可以按以下方式计算:
analyzer = TraceAnalysis(trace_dir = "/path/to/trace/folder") kernel_type_metrics_df, kernel_metrics_df = analyzer.get_gpu_kernel_breakdown()
函数返回的第一个数据框包含生成饼图所使用的原始值。
内核持续时间分布
由get_gpu_kernel_breakdown返回的第二个数据框包含每个内核的持续时间摘要统计信息。特别是,这包括每个 rank 上每个内核的计数、最小值、最大值、平均值、标准偏差、总和和内核类型。
使用这些数据,HTA 创建许多可视化来识别性能瓶颈。
- 每个 rank 上每种内核类型的前 5 个内核的饼图。
- 每个顶级内核和每种内核类型的所有 rank 上的平均持续时间的条形图。
提示
所有图像均使用 plotly 生成。在图表上悬停会显示位于右上角的模式栏,允许用户缩放、平移、选择和下载图表。
上面的饼图显示了前 5 个计算、通信和内存内核。为每个 rank 生成类似的饼图。可以使用传递给 get_gpu_kernel_breakdown 函数的num_kernels
参数配置饼图以显示前 k 个内核。此外,可以使用duration_ratio
参数来调整需要分析的时间百分比。如果同时指定了num_kernels
和duration_ratio
,则num_kernels
优先。
上面的条形图显示了所有 rank 上 NCCL AllReduce 内核的平均持续时间。黑线表示每个 rank 上所花费的最短和最长时间。
警告
在使用 jupyter-lab 时,将“image_renderer”参数值设置为“jupyterlab”,否则图形将无法在笔记本中呈现。
有关此功能的详细演练,请参阅存储库的示例文件夹中的gpu_kernel_breakdown notebook。
通信计算重叠
在分布式训练中,大量时间花费在 GPU 之间的通信和同步事件上。为了实现高 GPU 效率(如 TFLOPS/GPU),保持 GPU 过度订阅计算内核是至关重要的。换句话说,GPU 不应因未解决的数据依赖关系而被阻塞。衡量计算受数据依赖关系阻塞程度的一种方法是计算通信计算重叠。如果通信事件与计算事件重叠,就会观察到更高的 GPU 效率。缺乏通信和计算重叠将导致 GPU 空闲,从而导致效率低下。总之,更高的通信计算重叠是可取的。为了计算每个 rank 的重叠百分比,我们测量以下比率:
(在通信时花费的时间) / (在通信中花费的时间)
通信计算重叠可以计算如下:
analyzer = TraceAnalysis(trace_dir = "/path/to/trace/folder") overlap_df = analyzer.get_comm_comp_overlap()
该函数返回一个包含每个 rank 的重叠百分比的数据框。
当visualize
参数设置为 True 时,get_comm_comp_overlap函数还会生成一个柱状图,表示每个 rank 的重叠。
增强计数器
内存带宽和队列长度计数器
内存带宽计数器测量从 H2D、D2H 和 D2D 复制数据时使用的内存复制带宽(memcpy)和内存设置(memset)事件。HTA 还计算每个 CUDA 流中未完成操作的数量。我们将其称为队列长度。当流上的队列长度为 1024 或更大时,新事件无法在该流上调度,CPU 将停止,直到 GPU 流上的事件被处理。
使用generate_trace_with_counters API 输出一个带有内存带宽和队列长度计数器的新跟踪文件。新的跟踪文件包含指示由 memcpy/memset 操作使用的内存带宽的轨道,以及每个流的队列长度的轨道。默认情况下,这些计数器是使用 rank 0 跟踪文件生成的,新文件的名称包含后缀_with_counters
。用户可以通过在generate_trace_with_counters
API 中使用ranks
参数来为多个 rank 生成计数器。
analyzer = TraceAnalysis(trace_dir = "/path/to/trace/folder") analyzer.generate_trace_with_counters()
生成的带有增强计数器的跟踪文件的屏幕截图。
HTA 还提供了内存复制带宽和队列长度计数器的摘要,以及使用以下 API 对代码的 profile 部分的计数器的时间序列:
- get_memory_bw_summary
- get_queue_length_summary
- get_memory_bw_time_series
- get_queue_length_time_series
要查看摘要和时间序列,请使用:
# generate summary mem_bw_summary = analyzer.get_memory_bw_summary() queue_len_summary = analyzer.get_queue_length_summary() # get time series mem_bw_series = analyzer.get_memory_bw_time_series() queue_len_series = analyzer.get_queue_length_series()
摘要包含计数、最小值、最大值、平均值、标准差、25th、50th 和 75th 百分位数。
时间序列仅包含数值更改时的点。一旦观察到一个值,时间序列将保持恒定直到下一次更新。内存带宽和队列长度时间序列函数返回一个字典,其键是等级,值是该等级的时间序列。默认情况下,时间序列仅为等级 0 计算。
CUDA 内核启动统计
对于在 GPU 上启动的每个事件,CPU 上都有相应的调度事件,例如CudaLaunchKernel
,CudaMemcpyAsync
,CudaMemsetAsync
。这些事件通过追踪中的一个共同的相关 ID 相互关联 - 请参见上图。此功能计算 CPU 运行时事件的持续时间,其相应的 GPU 内核和启动延迟,例如,GPU 内核启动和 CPU 操作结束之间的差异。内核启动信息可以按如下方式生成:
analyzer = TraceAnalysis(trace_dir="/path/to/trace/dir") kernel_info_df = analyzer.get_cuda_kernel_launch_stats()
下面给出了生成的数据框的屏幕截图。
CPU 操作持续时间,GPU 内核和启动延迟使我们能够找到以下内容:
- 短 GPU 内核 - GPU 内核持续时间低于相应的 CPU 运行时事件。
- 运行时事件异常值 - CPU 运行时事件持续时间过长。
- 启动延迟异常值 - GPU 内核调度时间过长。
HTA 为上述三个类别生成分布图。
短 GPU 内核
通常,CPU 端的启动时间范围为 5-20 微秒。在某些情况下,GPU 执行时间低于启动时间本身。下面的图表帮助我们找出代码中这种情况发生的频率。
运行时事件异常值
运行时异常值取决于用于分类异常值的截止值,因此get_cuda_kernel_launch_stats API 提供runtime_cutoff
参数来配置该值。
启动延迟异常值
启动延迟异常值取决于用于分类异常值的截止值,因此 get_cuda_kernel_launch_stats API 提供launch_delay_cutoff
参数来配置该值。
结论
在本教程中,您已经学会了如何安装和使用 HTA,这是一种性能工具,可以帮助您分析分布式训练工作流中的瓶颈。要了解如何使用 HTA 工具执行跟踪差异分析,请参阅使用全面跟踪分析进行跟踪差异。