带你读《生命科学行业云上解决方案及最佳实践》——GHDDI,阿里云高性能计算助力 药物研发实现高通量分子筛选

简介: 带你读《生命科学行业云上解决方案及最佳实践》——GHDDI,阿里云高性能计算助力 药物研发实现高通量分子筛选

1 客户介绍

GHDDI,全称全球健康药物研发中心(Global Health Drug Discovery Institute),由比尔

及梅琳达·盖茨基金会、清华大学和北京市政府联合发起成立于中国北京。清华大学药学院院长、拜耳特聘教授丁胜教授担任中心主任。通过汇聚全球顶尖资源、发挥中国特色优势,GHDDI 致力于建设引领性的生物医药研发能力和创新药物转化平台,攻克人类面临的重大疾病挑战,改善全球健康。


2 业务痛点

1. GHDDI 的计算化学和人工智能研发系统需要大量的、弹性的计算,日后还有对外开放平台的计划,已有的 4 台 GPU 服务器和 12 台 CPU 服务器,不能满足日常的科研和对外服务的需求。


2. 当新冠肺炎爆发,GHDDI 也加入到了研发新药和疫苗的队列中,急需大量计算资源加快研究进度。


3 解决方案和价值

阿里云高性能计算在短时间内提供了大量 GPU 和超算产品,以及全天候的技术支持。1 月 29 日,阿里云宣布对全球公共科研机构免费开放一切 AI 算力,以支持抗疫。在此之前,阿里云弹性高性能计算平台 E-HPC 就开始免费支持 GHDDI 研究新冠病毒。


新冠疫情期间,GHDDI 使用 E-HPC 搭建云上高性能计算集群在阿里云上实现了开放共享平台,用于药物研发的分子对接、分子动力学模拟、深度学习模型训练、大规模并行计算,把需要几天的计算工作缩短到几小时,速度提升 8 到 20 倍。同时为合作伙伴创建不同的云上 HPC 子账户,实现计算资源共享和数据共享。

image.png

随后,数以百计的海内外科研机构和研究团队基于 GHDDI 的开放资源进行针对新冠病毒的药物、疫苗开发。

相关文章
|
26天前
|
存储 人工智能 调度
阿里云吴结生:高性能计算持续创新,响应数据+AI时代的多元化负载需求
在数字化转型的大潮中,每家公司都在积极探索如何利用数据驱动业务增长,而AI技术的快速发展更是加速了这一进程。
|
21天前
|
存储 人工智能 大数据
阿里云吴结生:高性能计算持续创新,响应数据+AI时代的多元化负载需求
在数字化转型的大潮中,每家公司都在积极探索如何利用数据驱动业务增长,而AI技术的快速发展更是加速了这一进程。
|
28天前
|
存储 人工智能 弹性计算
对话阿里云吴结生:AI时代,云上高性能计算的创新发展
在阿里云智能集团副总裁,弹性计算产品线负责人、存储产品线负责人 吴结生看来,如今已经有很多行业应用了高性能计算,且高性能计算的负载正呈现出多样化发展的趋势,“当下,很多基础模型的预训练、自动驾驶、生命科学,以及工业制造、半导体芯片等行业和领域都应用了高性能计算。”吴结生指出。
|
26天前
|
机器学习/深度学习 人工智能 弹性计算
阿里云AI服务器价格表_GPU服务器租赁费用_AI人工智能高性能计算推理
阿里云AI服务器提供多种配置选项,包括CPU+GPU、CPU+FPGA等组合,支持高性能计算需求。本文汇总了阿里云GPU服务器的价格信息,涵盖NVIDIA A10、V100、T4、P4、P100等多款GPU卡,适用于人工智能、机器学习和深度学习等场景。详细价格表和实例规格见文内图表。
|
2月前
|
资源调度 监控 调度
HPC高性能计算场景中如何实现“运行时调度”
在HPC高性能计算中,使用LSF或Slurm提交作业虽方便,但过程往往不可控,作业运行如同黑盒,失败后才能排查问题。为此,MMCloud提出“运行时调度”理念,实现在任务运行过程中进行智能资源调度,最大化资源利用并优化成本效益。与传统工具不同,MMCloud能够实时监控任务状态,并根据算力需求动态调整资源分配。
61 0
|
4月前
|
机器学习/深度学习 人工智能 弹性计算
阿里云AI服务器价格表_GPU服务器租赁费用_AI人工智能高性能计算推理
阿里云AI服务器提供多样化的选择,包括CPU+GPU、CPU+FPGA等多种配置,适用于人工智能、机器学习和深度学习等计算密集型任务。其中,GPU服务器整合高性能CPU平台,单实例可实现最高5PFLOPS的混合精度计算能力。根据不同GPU类型(如NVIDIA A10、V100、T4等)和应用场景(如AI训练、推理、科学计算等),价格从数百到数千元不等。详情及更多实例规格可见阿里云官方页面。
265 1
|
6月前
|
存储 弹性计算 网络协议
阿里云hpc8ae服务器ECS高性能计算优化型实例性能详解
阿里云ECS的HPC优化型hpc8ae实例搭载3.75 GHz AMD第四代EPYC处理器,配备64 Gbps eRDMA网络,专为工业仿真、EDA、地质勘探等HPC工作负载设计。实例提供1:4的CPU内存配比,支持ESSD存储和IPv4/IPv6,操作系统限于特定版本的CentOS和Alibaba Cloud Linux。ecs.hpc8ae.32xlarge实例拥有64核和256 GiB内存,网络带宽和eRDMA带宽均为64 Gbit/s。适用于CFD、FEA、气象预报等场景。
|
6月前
|
存储 弹性计算 网络协议
阿里云高性能计算HPC优化实例商业化发布详解
基于云的高性能计算(Cloud HPC),与传统HPC相比更加灵活、高效。
|
7月前
|
存储 机器学习/深度学习 网络协议
阿里云高性能计算实例规格族有哪些?各自特点、适用场景介绍
阿里云高性能计算是的阿里云服务器ECS的架构之一,高性能计算实例规格族主要应用于各种需要超高性能、网络和存储能力的应用场景,例如人工智能、机器学习、科学计算、地质勘探、气象预报等场景。高性能计算实例规格族有高性能计算优化型实例规格族hpc8ae、高性能计算优化型实例规格族hpc7ip、计算型超级计算集群实例规格族sccc7等。下面是阿里云高性能计算实例规格族特点、适用场景介绍。
阿里云高性能计算实例规格族有哪些?各自特点、适用场景介绍
|
6月前
|
存储 数据可视化 大数据
高性能计算HPC优化实例在摩托车外流场仿真场景的最佳实践
本文整理自阿里云高性能计算研发工程师曹杭在【HPC优化实例商业化发布会】中的动手实验分享,集中讲解HPC优化实例动手实验Demo细节。

热门文章

最新文章