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聚焦「 数据科学 | 深度学习 | 生命科学 | Python | 机器学习 」等前沿交叉学科,定期分享理论教程与应用实践等。
Python 异步: 在非阻塞子进程中运行命令(19)
层次聚类算法
ChIP-seq 分析:Consensus Peaks(14)
Python 异步: 异步推导式(18)
ChIP-seq 分析:TF 结合和表观遗传状态(13)
降维算法: 奇异值分解SVD
Python 异步: 异步上下文管理器(17)
ChIP-seq 分析:GO 功能测试与 Motifs 分析(12)
机器学习算法: Logistic 回归 详解
转录因子或表观遗传标记可能作用于按共同生物学特征(共享生物学功能、RNAseq 实验中的共同调控等)分组的特定基因组。
迭代是 Python 中的基本操作。我们可以迭代列表、字符串和所有其他结构。
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今天,我们将继续回顾我们在上一次中研究的 Myc ChIPseq。这包括用于 MEL 和 Ch12 细胞系的 Myc ChIPseq。
阻塞任务是阻止当前线程继续进行的任务。
转置卷积操作的详细分解
297个机器学习彩图知识点(15)
到目前为止,我们一直在处理对应于转录因子结合的 ChIPseq 峰。顾名思义,转录因子可以影响其靶基因的表达。
Asyncio 任务可以通过调用它们的 cancel() 方法来取消。我们可以通过将任务包装在对 asyncio.shield() 的调用中来保护任务不被取消。
您是否曾经遇到过这样一种情况:您试图分析一个复杂且高度相关的数据集,却对信息量感到不知所措?这就是独立成分分析 (ICA) 的用武之地。ICA 是数据分析领域的一项强大技术,可让您分离和识别多元数据集中的底层独立来源。
ChIP-seq 分析:Call Peak(8)
构建系统发育树简述
1. 什么是系统发育树 2. 如何看系统发育树并确定哪些物种最相关
在 Python 中构建监督机器学习文本分类器的指导指南和流程图
ChIPseq 中的一个潜在噪声源是 ChIPseq 库在 PCR 步骤中的过度放大。这可能会导致大量重复读取,从而混淆峰值调用。
我们可以使用 asyncio.wait_for() 函数等待 asyncio 任务或协程超时完成。如果在任务完成之前超时已过,任务将被取消。
本系列将持续更新20个机器学习的知识点,欢迎关注。
我们可以通过 asyncio.wait() 函数等待异步任务完成。可以等待不同的条件,例如所有任务完成、第一个任务完成以及第一个任务因异常而失败。
集成学习(Ensemble learning)就是将若干个弱分类器通过一定的策略组合之后产生一个强分类器。
ChIP-seq 分析:评估片段长度与处理(6)
本系列将持续更新20个机器学习的知识点,欢迎关注。
asyncio 的一个好处是我们可以同时运行许多协程。这些协同程序可以在一个组中创建并存储,然后同时一起执行。这可以使用 asyncio.gather() 函数来实现。
提高CV模型训练性能的 9 个技巧
决策树(Decision Tree)是有监督学习中的一种算法,并且是一种基本的分类与回归的方法。决策树有两种:分类树和回归树。
之前我们详细研究了混淆矩阵、模型准确性、精确度和召回率。我们也使用 `Scikit-learn` 库来计算这些指标。现在我们将扩展讨论以了解如何使用精度和召回率来计算 `mAP`。
相似性度量是许多数据分析和机器学习任务中的重要工具,使我们能够比较和评估不同数据片段之间的相似性。有许多不同的指标可用,每个指标各有利弊,适用于不同的数据类型和任务。
模型性能分析:ROC 分析和 AUC
类别不平衡是一个常见问题,其中数据集中示例的分布是倾斜的或有偏差的。
装饰器是应用“Python 之禅”哲学的最佳 Python 特性。装饰器可以帮助您编写更少、更简单的代码来实现复杂的逻辑并在任何地方重用它。
机器学习: Label vs. One Hot Encoder
深度学习中的潜在空间
机器学习模型集成管理介绍
机器(深度)学习中的 Dropout
异步编程是一种不会阻塞的编程范式。相反,请求和函数调用会在未来某个时间以某种方式在后台发出和执行。这使调用者有时间执行其他活动,并在结果可用或调用者感兴趣时稍后处理发出的调用的结果。
广义上,asyncio 是指使用协程在 Python 中实现异步编程的能力。
从广义上讲,Asyncio 是新的、流行的、讨论广泛的和令人兴奋的。然而,对于何时应该在项目中采用它存在很多困惑。
Python 提供一流的协程,具有“coroutine”类型和新的表达式,如“async def”和“await”。它提供了用于运行协程和开发异步程序的“asyncio”模块。
我们可以在我们的 Python 程序中定义协程,就像定义新的子例程(函数)一样。一旦定义,协程函数可用于创建协程对象。“asyncio”模块提供了在事件循环中运行协程对象的工具,事件循环是协程的运行时。
asyncio 程序的核心是事件循环。在本节中,我们将花点时间看一下 asyncio 事件循环。
您可以从 asyncio 程序中的协程创建任务对象。任务提供独立调度和运行的协程的句柄,并允许查询、取消任务,以及稍后检索结果和异常。异步事件循环管理任务。因此,所有协程都成为事件循环中的任务并作为任务进行管理。