阿里云MongoDB与EMR的HelloWorld

本文涉及的产品
云原生内存数据库 Tair,内存型 2GB
云数据库 Redis 版,社区版 2GB
推荐场景:
搭建游戏排行榜
云数据库 MongoDB,通用型 2核4GB
简介: 越来越多的应用采用MongoDB作为数据存储层,性能高,扩展性强,通过WriteCocern参数还可以控制写入持久级别,CAP上灵活配置。文档型的存储结构又是特别适合物联网,游戏等领域,这些数据也蕴藏这巨大的价值,就像是金矿一样,需要挖掘。虽然MongoDB提供了MapReduce功能,但功能相对薄

越来越多的应用采用MongoDB作为数据存储层,性能高,扩展性强,通过WriteCocern参数还可以控制写入持久级别,CAP上灵活配置。文档型的存储结构又是特别适合物联网,游戏等领域,这些数据也蕴藏这巨大的价值,就像是金矿一样,需要挖掘。虽然MongoDB提供了MapReduce功能,但功能相对薄弱,如果说MongoDB MapReduce是铁锹,Spark就是一台真正的挖掘机。

阿里云云数据库已经推出了MongoDB云服务,EMR(E-MapReduce)也是公测期,EMR提供了便捷的Spark服务,本篇文章将给大家介绍下如何使用使用阿里云服务,构建基于MongoDB的大数据计算平台。

EMR服务申请和创建

准备工作

  • 钱,服务是要买的,学习为目的可以使用小时付费
  • 提前开通OSS,EMR服务是依赖OSS的,所以建议提前开通OSS

申请EMR公测资格

点击申请地址,开通一般是在1-2个工作日左右,目前公测期间EMR服务的价格与ECS保持一致。长期使用可以按月购买,最小规模大概1000元左右,学习的话可以按小时付费,不过用好后请记得释放。

创建EMR集群

申请通过后就可以创建集群了,注意下运行日志的路径,需要指定一个OSS Bucket存放日志,为了方便追踪状态,建议开启。

MongoDBWithSpark_1

输入好密码后就可以点击下一步了进行软件配置,默认选择Hadoop集群即可,继续下一步。因为EMR实际上是运行在ECS上,所以需要安全组配置,没有的话需要创建一个。另外,测试目的的话需要最小化集群配置,Core减小到一个节点,生产目的的话强烈建议多个Core。

MongoDBWithSpark_2

继续,支付订单,等待集群创建,大概30秒后集群即可创建完毕。在ECS控制台上也可以看到新生产出的两个ECS节点,上面就运行着EMR服务,我们可以像使用普通ECS的方式一样登陆到节点上。

MongoDBWithSpark_3
OK,至此Spark集群已经构建完成。

购买阿里云云数据库MongoDB

因为MongoDB已经是商业化的服务,所以正常购买即可,但需要注意的是,一定要购买与EMR服务在同一个可用区的实例,否则网络是不通的。

EMR可用区查看

MongoDBWithSpark_4

MongoDB可用区选择
MongoDBWithSpark_5

等待30S后查看控制台,MongoDB实例创建成功。

创建好后,先写上几条数据,为后面的DEMO做准备,如图:
MongoDBWithSpark_6

检查网络连通性

开始之前还需要检查下EMR与MongoDB云服务的网络连通性,看看是否是畅通的。登陆到EMR创建好的ECS上,通过telnet命令来探测:

telnet dds-xxxxxxx.mongodb.rds.aliyuncs.com 3717

如果发现无法连接有几个可能性逐一排查:

  • EMR服务与MongoDB云服务不在同一个可用区,阿里云的网络规则下是不通的,需要重新购买
  • 安全组限制了内网进出口,可以登陆ECS控制台修改安全组规则,让其可以访问MongoDB服务端口
  • 由于欠费等原因,生长出来的实例被回收了,也可以通过控制台查看实例状态是否正常

至此,资源都已经Ready,接下来我们一起构建Spark 计算用的Jar包吧。

Spark任务编写

Jar包依赖

要想Spark访问MongoDB,必须找到相对应的Hadoop Connector和相关的Jar包,可以参考如下Maven POM配置。具体的版本,根据自己的实际需要去更新。

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<project xmlns="http://maven.apache.org/POM/4.0.0"
         xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
         xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 http://maven.apache.org/xsd/maven-4.0.0.xsd">
    <modelVersion>4.0.0</modelVersion>

    <groupId>com.aliyun.mongodb</groupId>
    <artifactId>spark-test</artifactId>
    <version>1.0-SNAPSHOT</version>

    <build>
       <plugins>
           <plugin>
        <artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId>
        <configuration>
            <archive>
                <manifest>
                    <mainClass>fully.qualified.MainClass</mainClass>
                </manifest>
            </archive>
            <descriptorRefs>
                <descriptorRef>jar-with-dependencies</descriptorRef>
            </descriptorRefs>
        </configuration>
    </plugin>
       </plugins>
    </build>


    <dependencies>
        <dependency>
            <groupId>org.mongodb</groupId>
            <artifactId>mongodb-driver</artifactId>
            <version>3.2.2</version>
        </dependency>
        <dependency>
            <groupId>org.mongodb.mongo-hadoop</groupId>
            <artifactId>mongo-hadoop-core</artifactId>
            <version>1.5.2</version>
        </dependency>
        <dependency>
            <groupId>org.apache.spark</groupId>
            <artifactId>spark-core_2.10</artifactId>
            <version>1.6.0</version>
        </dependency>
    </dependencies>
</project>

Job编写

通过MongoDB控制台准备好MongoDB的几个属性:

  • 两个访问地址,注意,是两个
  • 用户名,密码,从MongoDB上拉取需要读权限,如果还希望数据写回MongoDB,那写权限也需要准备好
  • MongoDB集群名,以mgset开头
   private static String DEFAULT_AUTH_DB = "admin";

   private static String seed1         = "dds-xxxxx1.mongodb.rds.aliyuncs.com:3717";
   private static String seed2         = "dds-xxxxx2.mongodb.rds.aliyuncs.com:3717";
   private static String username      = "root";
   private static String password      = "123456";
   private static String replSetName   = "mgset-1234567";

接下来构建MongoDB ConnectionURI,具体的规则参考如下代码,参考github文档,或者跟着下面的代码抄写。最终要有三个URI:

  • mongoURI 用来鉴权
  • inputURI 数据输入地址
  • ouputURI 数据输出地址

   private static String authURIPrefix = "mongodb://" +
                                          username + ":" + password + "@" +
                                          seed1 + "," + seed2 + "/";
   private static String authURISuffix = "?replicaSet=" + replSetName;
   private static String inputColl     = "testdb.input";
   private static String outputColl    = "testdb.output";

   private static String mongoURI      = authURIPrefix + DEFAULT_AUTH_DB + authURISuffix;
   private static String inputURI      = authURIPrefix + inputColl + authURISuffix;
   private static String outputURI     = authURIPrefix + outputColl + authURISuffix;

至此,访问环境相关的变量都已经初始化完成,正式进入到Job内容,这里的Demo很简单,不能免俗的Hello World风格,但麻雀虽小五脏俱全,从配置到输入到计算再到输出,完整的一套流程。

首先撞见SparkContext,Spark作业的生命周期都会伴随着这个Context,并且配置Configuration对象,Configuration对象维护着上面提到的访问地址参数,更详细参数说明可以参考github

JavaSparkContext sc = new JavaSparkContext(new SparkConf());

Configuration config = new Configuration();
config.set("mongo.job.input.format", "com.mongodb.hadoop.MongoInputFormat");
config.set("mongo.job.output.format", "com.mongodb.hadoop.MongoOutputFormat");
config.set("mongo.auth.uri", mongoURI);
config.set("mongo.input.uri", inputURI);
config.set("mongo.output.uri", outputURI);

接下来轮到获取数据RDD了,RDD是Spark中的数据表达形式。这里要注意RDD Value类型,是BSONObject,BSON是MongoDB文档数据的表现形式。通过这样一条语句做了BSON到RDD的映射。

JavaPairRDD<Object, BSONObject> documents = sc.newAPIHadoopRDD(
              config,                        // Configuration
              MongoInputFormat.class,   // InputFormat: read from a live cluster.
              Object.class,             // Key class
              BSONObject.class          // Value class
      );

有了数据,就可以开始计算了,简单的做个mapValues动作,可以注意看,返回的仍然是个RDD,不过这个RDD是经过map动作处理后的。

JavaPairRDD<Object, BSONObject> updates = documents.mapValues(new MongoDBMapFunction());

mapFunction很简单,替换所有的name值为Spark,当然也可以做些统计的DEMO,后面的文章会再介绍更复杂的DEMO,敬请关注。

public class MongoDBMapFunction implements Function<BSONObject, BSONObject> {

    public BSONObject call(BSONObject bsonObject) throws Exception {
        bsonObject.put("name", "spark");
        return bsonObject;
    }
}

最后一步,数据的输出,MongoDB即是输入源又是输出源,所以第一个hdfs路径参数实际是无效的,但不可以是null,后面的类型描述了RDD的key,value类型,要跟updates一致,最后的config内容已经在程序最开始设置过了。

updates.saveAsNewAPIHadoopFile(
      "file://this-is-completely-unused",
      Object.class,
      BSONObject.class,
      MongoOutputFormat.class,
      config
);

额外说说明一下,Spark在动作是lazy的,整个代码流程下来,只有当程序执行到saveAsNewAPIHadoopFile时,才会触发数据拉取和计算等动作。

最后一步,构建Jar包,使用assembly的方式去构建,避免ClassNotFound的尴尬:

mvn assembly:assembly

上传JAR包并执行

剩下的操作都不需要写代码了,只需要操作控制台即可。几个步骤:上传JAR包->创建作业->创建执行计划->执行,我们来实际操作下。

再次登陆到OSS控制台,把刚才Jar包上传到OSS上,后面会用到。再回到EMR控制台上的作业栏里创建一个作业,需要指定一些参数,只名Job Class,然后点击下面的按钮添加OSS路径,内容是就是刚才上传的Jar包地址。值得注意的是,这里用的是ossref前缀,遇到这样的前缀EMR服务会自动的从OSS拉取Jar下来,否则原生的Spark是不识别的。最后应用参数应该是如下样子:

--master yarn-client --class com.aliyun.apsaradb.mongodb.Main ossref://sparkbucket/jar/spark-test-1.0-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar

接下来是创建执行计划了,根据提示,在执行计划栏里进行创建,会提示采用的集群,作业集合,调度方式,这个DEMO采用的手动方式调度。

最后激动的时刻来临了,在执行计划栏里点击立即执行,运行过程和结束后都可以通过浏览器在网页上查看运行日志,非常方便。等待几十秒后,任务成功。

我们在回到DMS上查看数据集合,会发现已经多出了ouput集合,并且内容都为

{ "name": "spark"}

至此,Spark与MongoDB的Hello World风格教程结束,各位可以发挥无限的想象力,玩的开心!

参考连接:

相关实践学习
快速掌握 MongoDB 数据库
本课程主要讲解MongoDB数据库的基本知识,包括MongoDB数据库的安装、配置、服务的启动、数据的CRUD操作函数使用、MongoDB索引的使用(唯一索引、地理索引、过期索引、全文索引等)、MapReduce操作实现、用户管理、Java对MongoDB的操作支持(基于2.x驱动与3.x驱动的完全讲解)。 通过学习此课程,读者将具备MongoDB数据库的开发能力,并且能够使用MongoDB进行项目开发。 &nbsp; 相关的阿里云产品:云数据库 MongoDB版 云数据库MongoDB版支持ReplicaSet和Sharding两种部署架构,具备安全审计,时间点备份等多项企业能力。在互联网、物联网、游戏、金融等领域被广泛采用。 云数据库MongoDB版(ApsaraDB for MongoDB)完全兼容MongoDB协议,基于飞天分布式系统和高可靠存储引擎,提供多节点高可用架构、弹性扩容、容灾、备份回滚、性能优化等解决方案。 产品详情: https://www.aliyun.com/product/mongodb
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