脑研究、脑网络分析、可视化的工具箱有哪些?
复杂网络分析是一种研究复杂系统的新的多学科方法,旨在通过少量具有神经生物学意义且易于计算的测量来表征这些大脑网络。Brain Connectivity Toolbox工具箱中的功能包含了从连接数据构建大脑网络,并描述最常用的结构和功能连接的网络测量。实现了各种检测功能整合和分离的措施,量化各个大脑区域或通路的中心性,表征局部解剖电路的模式,并测试网络的弹性。工具箱的详细介绍参考:https://sites.google.com/site/bctnet/
(1)bctpy:Python 的大脑连接工具箱。
- brainconn : brainconn (brain connectivity) library,在bctpy的基础上做了一些改进。
(2)bct-cpp:C++ 中的大脑连接工具箱。
(3)人类连接组项目:NIH 联盟,用于绘制大脑白质通路。
(4)虚拟大脑项目:一个模拟灵长类大脑网络动力学的联盟。
(5)FieldTrip:MEG、EEG 和侵入性电生理数据的高级分析工具箱。
(6)CONN:用于计算、显示和分析 fcMRI 数据的跨平台软件。
(7)DSI-Studio:用于扩散 MRI 分析的纤维束成像软件工具箱。
(8)GraphVar:一个用户友好的基于 GUI 的工具箱,用于大脑连接的图形分析。
(9)基于网络的统计工具箱:用于测试有关连接组的假设的工具箱。
(10)WFU_MMNET:用于脑网络多元建模的工具箱
(11)神经影像分析套件:用于 fMRI 处理的模块和管道库。
(12)图论 GLM 工具箱:脑网络图分析属性的 GLM 工具箱。
(13)Brainnetome Toolkit:复杂网络测量的 MATLAB GUI 工具包。
(14)BioNeCT:一个用于分析脑电图记录中的大脑网络连接性的有凝聚力的平台。
(15)GRETNA:用于全面分析大脑连接组拓扑的工具箱。
(16)MIBCA:具有批处理功能的自动化一体式连接工具箱。
(17)GAT/bnets:功能和结构大脑网络的图形分析工具箱。
(18)BASCO:事件相关功能磁共振成像数据中的区域间功能连接分析。
(19)MNET:一款用于 fMRI 和 DTI 的全自动一体化网络分析工具箱。
(20)EEGNET:用于分析和可视化 M/EEG 连接的工具箱。
(21)BRAPH:使用图论进行大脑分析。
(22)FastFC:功能性大脑网络的高效计算。
(23)BrainFlow:是一个库,旨在获取,解析和分析脑电图(EEG),肌电图(EMG),心电(ECG)和其他类型的数据从生物传感器。
(24)communityalg:Matlab 中用于脑网络中社区检测的算法和函数。扩展 BrainConnectivity 工具箱。