【阿旭机器学习实战】【26】逻辑斯蒂回归----糖尿病预测实战

简介: 【阿旭机器学习实战】【26】逻辑斯蒂回归----糖尿病预测实战

1. 导入并查看数据信息


import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
# 载入数据
data = pd.read_csv('./diabetes.csv')
data.head()

image.png


数据说明:

Pregnancies:怀孕次数

Glucose:葡萄糖测试值

BloodPressure:血压

SkinThickness:皮肤厚度

Insulin:胰岛素

BMI:身体质量指数

DiabetesPedigreeFunction:糖尿病遗传函数

Age:年龄

Outcome:糖尿病标签


# 查看数据类型
data.info()
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 768 entries, 0 to 767
Data columns (total 7 columns):
Pregnancies                 768 non-null int64
Glucose                     768 non-null float64
BloodPressure               768 non-null float64
BMI                         768 non-null float64
DiabetesPedigreeFunction    768 non-null float64
Age                         768 non-null int64
Outcome                     768 non-null int64
dtypes: float64(4), int64(3)
memory usage: 42.1 KB
# 查看数据基本信息
data.describe()

image.png


# 查看数据形状
data.shape
• 1
• 2
(768, 9)
# 查看标签分布
print(data.Outcome.value_counts())
# 使用柱状图的方式画出标签个数统计
data.Outcome.value_counts().plot(kind="bar")
plt.show()
0    500
1    268
Name: Outcome, dtype: int64

610ac5247b6e446786edb48ef2c25dc3.png

# 查看两个目标分类下,各个特征的数据分布
sns.pairplot(data, hue = 'Outcome')
plt.show()

a23097f596a14d1181f66df76a23dd9b.png


上图表明的是两种目标分类下,不用类型特征属性之间的关系,包含直方图和散点图。


其中同一特征对比时用的是直方图,不同特征对比的时候用的是散点图。


2. 特征工程


2.1 处理异常值


通过观察上图数据分布可以发现一些异常值,比如Glucose葡萄糖,BloodPressure血压,SkinThickness皮肤厚度,Insulin胰岛素,BMI身体质量指数存在0数值,但是这些数值应该是不可能出现0值的,因此我们需要将这些异常的0值进行处理。


# 将葡萄糖,血压,皮肤厚度,胰岛素,身体质量指数中的0替换为nan
colume = ['Glucose', 'BloodPressure', 'SkinThickness', 'Insulin', 'BMI']
data[colume] = data[colume].replace(0,np.nan)
# 查看数据类型
data.info()
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 768 entries, 0 to 767
Data columns (total 9 columns):
Pregnancies                 768 non-null int64
Glucose                     763 non-null float64
BloodPressure               733 non-null float64
SkinThickness               541 non-null float64
Insulin                     394 non-null float64
BMI                         757 non-null float64
DiabetesPedigreeFunction    768 non-null float64
Age                         768 non-null int64
Outcome                     768 non-null int64
dtypes: float64(6), int64(3)
memory usage: 54.1 KB
# 画出各特征非空的数值个数
data.notnull().sum().plot(kind="bar")
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x192abc4ac50>

37771a5da7ee4c3488e7a58e4ca32707.png

# 设定阀值,非空值需要超过总数量的80%以上
thresh_count = data.shape[0]*0.8
# 若某一列数据缺失的数量超过20%就会被删除
data = data.dropna(thresh=thresh_count, axis=1) 
# 画出各特征非空的数值个数
data.notnull().sum().plot(kind="bar")
• 1
• 2
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x192a79c8b38>

fd442affd7e141c09f5ea5a6125fe04c.png


2.2 填充缺失值


# 导入插补库
from sklearn.preprocessing import Imputer 
# 此处采用均值插补的方法来填充缺失值
imr = Imputer(missing_values='NaN', strategy='mean', axis=0) 
colume =  ['Glucose', 'BloodPressure', 'BMI']
# 进行插补
data[colume] = imr.fit_transform(data[colume]) 
D:\anaconda3\lib\site-packages\ipykernel_launcher.py:7: SettingWithCopyWarning: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead
See the caveats in the documentation: http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy
  import sys
D:\anaconda3\lib\site-packages\pandas\core\indexing.py:543: SettingWithCopyWarning: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead
See the caveats in the documentation: http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy
  self.obj[item] = s
# 画出各特征非空的数值个数
data.notnull().sum().plot(kind="bar")
• 1
• 2
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x192af6bde80>

95fe7a6c4f9341f886ffe6d6f1f56452.png

plt.figure(figsize=(12,10))  
# 画热力图,数值为两个变量之间的相关系数
p=sns.heatmap(data.corr(), annot=True) 
plt.show()

22fba6484f9445b0ba7a361c6436e8e4.png

3. 切分数据集并构建模型


# 把数据切分为特征x和标签y
x = data.drop("Outcome",axis = 1)
y = data.Outcome
from sklearn.model_selection import train_test_split
# 切分数据集,stratify=y表示切分后训练集和测试集中的数据类型的比例跟切分前y中的比例一致
# 比如切分前y中0和1的比例为1:2,切分后y_train和y_test中0和1的比例也都是1:2
x_train,x_test,y_train,y_test = train_test_split(x,y,test_size=0.3, stratify=y)
# 此处使用逻辑回归进行建模
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.metrics import classification_report
LR = LogisticRegression()
LR.fit(x_train,y_train)
pre_result= LR.predict(x_test)
print(classification_report(y_test, pre_result))
             precision    recall  f1-score   support
          0       0.78      0.91      0.84       150
          1       0.76      0.52      0.62        81
avg / total       0.77      0.77      0.76       231

由上述结果,可以看出该模型的准确率约为76%,不是很高,模型还需进一步优化。

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