singleCellNet(代码开源)|单细胞层面对细胞分类进行评估,褒贬不一,有胜于无
`singleCellNet`是一款用于单细胞数据分析的R包,主要功能是进行细胞分类评估。它支持多物种和多分组分析,并提供了一个名为`CellNet`的类似工具的示例数据集。用户可以通过安装R包并下载测试数据来运行demo。在demo中,首先加载查询和测试数据,然后训练分类器,接着进行评估,包括查看准确率和召回率的曲线图、分类热图和比例堆积图等。此外,`singleCellNet`还支持跨物种评估,将人类基因映射到小鼠直系同源物进行分析。整体而言,`singleCellNet`是一个用于单细胞分类评估的综合工具,适用于相关领域的研究。