R语言Apriori算法关联规则对中药用药复方配伍规律药方挖掘可视化(上)

简介: R语言Apriori算法关联规则对中药用药复方配伍规律药方挖掘可视化

全文链接:http://tecdat.cn/?p=32316


我们常说的中药挖掘,一般是用药挖掘,还有穴位的挖掘,主要是想找出一些用药的规律点击文末“阅读原文”获取完整代码数据


在中医挖掘中,数据的来源比较广泛,有的是通过临床收集用药处方,比如,一个著名老中医针对某一疾病的用药情况;有的是通过古籍,古代流传下来的药方;还有一种情况是在论文数据框里查找专门治疗某一疾病的文献,从中找到处方,用来分析。

Apriori算法是一种最有影响的挖掘关联规则频繁项集的算法。其核心是基于两阶段频集思想的递推算法。该关联规则在分类上属于单维、单层、布尔关联规则,Apriori 算法采用了逐层搜索的迭代的方法,算法简单明了,没有复杂的理论推导,也易于实现。

由于Apriori算法的特性,十分适合中药处方、膏方、方剂的挖掘,甚至于穴位的挖掘。

本文帮助客户得出不同处方的药物组合和频率,挖掘出药方内在的规律。


中药处方数据



读取数据


a_df3=read.xlsx("挖掘用.xlsx",startRow=0, colNames = F)


转换数据结构


a_list=list(0)  
for(i in 1:nrow(a_df3)){  
   
   
##删除事务中的重复项目
 a_list[[i]]= unique(strsplit(a_df3[i,],",")[[1]])


将数据转换成事务类型


trans2 <- as(a_list, "tran


查看每个商品的出现频率


可以看到每个物品出现的频率,从而判断哪些物品的支持度较高。


关联规则挖掘


药对挖掘

at(dat1,parameter=list(support=0.3,minlen=2,maxle


得到频繁规则挖掘


inspect(frequent


查看求得的频繁项集


spect(sort(frequentsets,by="suppo

根据支持度对求得的频繁项集排序并查看(等价于inspect(sort(frequentsets)[1:10])。


建立模型


apriori(dat1,parame

设置支持度为0.01,置信度为0.3


summary(rules)#查看规则

查看部分规则


查看置信度 支持度和提升度


可视化


绘制不同规则图形来表示支持度,置信度和提升度。

通过该图可以看到规则前项和规则后项分别有哪些物品 以及每个物品的支持度大小,支持度越大则圆圈越大。


点击标题查阅往期内容


R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类分析中药专利复方治疗用药规律网络可视化


01

02

03

04


ules, method = NULL,  
     measure = "support", shading = "lift", int

从该图可以看到支持度和置信度的关系,置信度越高提升度也越高。

从该图可以看到支持度和置信度的关系,提升度越高置信度也越高。

ules, method="matrix3D", measure="lift

从上图可以看到不同物品之间的关联关系,图中的点越大说明该物品的支持度越高,颜色越深说明该物品的提升度越高。

plot(rules, method="doubledecker" )


R语言Apriori算法关联规则对中药用药复方配伍规律药方挖掘可视化(下):https://developer.aliyun.com/article/1496507

相关文章
|
4天前
|
算法 数据库
Apriori算法实现
Apriori算法实现
11 0
|
4天前
|
数据采集 机器学习/深度学习 算法
数据分享|WEKA关联规则挖掘Apriori算法在学生就业数据中的应用
数据分享|WEKA关联规则挖掘Apriori算法在学生就业数据中的应用
|
4天前
|
算法 数据安全/隐私保护 计算机视觉
基于二维CS-SCHT变换和LABS方法的水印嵌入和提取算法matlab仿真
该内容包括一个算法的运行展示和详细步骤,使用了MATLAB2022a。算法涉及水印嵌入和提取,利用LAB色彩空间可能用于隐藏水印。水印通过二维CS-SCHT变换、低频系数处理和特定解码策略来提取。代码段展示了水印置乱、图像处理(如噪声、旋转、剪切等攻击)以及水印的逆置乱和提取过程。最后,计算并保存了比特率,用于评估水印的稳健性。
|
1天前
|
算法
m基于BP译码算法的LDPC编译码matlab误码率仿真,对比不同的码长
MATLAB 2022a仿真实现了LDPC码的性能分析,展示了不同码长对纠错能力的影响。短码长LDPC码收敛快但纠错能力有限,长码长则提供更强纠错能力但易陷入局部最优。核心代码通过循环进行误码率仿真,根据EsN0计算误比特率,并保存不同码长(12-768)的结果数据。
19 9
m基于BP译码算法的LDPC编译码matlab误码率仿真,对比不同的码长
|
2天前
|
算法
MATLAB|【免费】融合正余弦和柯西变异的麻雀优化算法SCSSA-CNN-BiLSTM双向长短期记忆网络预测模型
这段内容介绍了一个使用改进的麻雀搜索算法优化CNN-BiLSTM模型进行多输入单输出预测的程序。程序通过融合正余弦和柯西变异提升算法性能,主要优化学习率、正则化参数及BiLSTM的隐层神经元数量。它利用一段简单的风速数据进行演示,对比了改进算法与粒子群、灰狼算法的优化效果。代码包括数据导入、预处理和模型构建部分,并展示了优化前后的效果。建议使用高版本MATLAB运行。
|
4天前
|
算法 计算机视觉
基于高斯混合模型的视频背景提取和人员跟踪算法matlab仿真
该内容是关于使用MATLAB2013B实现基于高斯混合模型(GMM)的视频背景提取和人员跟踪算法。算法通过GMM建立背景模型,新帧与模型比较,提取前景并进行人员跟踪。文章附有程序代码示例,展示从读取视频到结果显示的流程。最后,结果保存在Result.mat文件中。
|
4天前
|
资源调度 算法 块存储
m基于遗传优化的LDPC码OMS译码算法最优偏移参数计算和误码率matlab仿真
MATLAB2022a仿真实现了遗传优化的LDPC码OSD译码算法,通过自动搜索最佳偏移参数ΔΔ以提升纠错性能。该算法结合了低密度奇偶校验码和有序统计译码理论,利用遗传算法进行全局优化,避免手动调整,提高译码效率。核心程序包括编码、调制、AWGN信道模拟及软输入软输出译码等步骤,通过仿真曲线展示了不同SNR下的误码率性能。
9 1
|
4天前
|
存储 算法 数据可视化
基于harris角点和RANSAC算法的图像拼接matlab仿真
本文介绍了使用MATLAB2022a进行图像拼接的流程,涉及Harris角点检测和RANSAC算法。Harris角点检测寻找图像中局部曲率变化显著的点,RANSAC则用于排除噪声和异常点,找到最佳匹配。核心程序包括自定义的Harris角点计算函数,RANSAC参数设置,以及匹配点的可视化和仿射变换矩阵计算,最终生成全景图像。
|
4天前
|
算法 Serverless
m基于遗传优化的LDPC码NMS译码算法最优归一化参数计算和误码率matlab仿真
MATLAB 2022a仿真实现了遗传优化的归一化最小和(NMS)译码算法,应用于低密度奇偶校验(LDPC)码。结果显示了遗传优化的迭代过程和误码率对比。遗传算法通过选择、交叉和变异操作寻找最佳归一化因子,以提升NMS译码性能。核心程序包括迭代优化、目标函数计算及性能绘图。最终,展示了SNR与误码率的关系,并保存了关键数据。
16 1
|
4天前
|
算法 调度
考虑需求响应的微网优化调度模型【粒子群算法】【matlab】
考虑需求响应的微网优化调度模型【粒子群算法】【matlab】

热门文章

最新文章