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云场景实践研究第39期:WeGene

简介: 作为一家主打个人基因测序服务的公司,WeGene(微基因),通过使用阿里云服务,不仅为用户提供健壮的网络服务,而且还为公司提供基因分析需要的海量计算资源。本文将具体分析阿里云在实际中如何帮助WeGene简化数据存储、传输、计算等方面的问题。
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作为一家主打个人基因测序服务的公司,WeGene(微基因),通过使用阿里云服务,不仅为用户提供健壮的网络服务,而且还为公司提供基因分析需要的海量计算资源。本文将具体分析阿里云在实际中如何帮助WeGene简化数据存储、传输、计算等方面的问题。
基因组数据能够为个人提供好处,在国内很多基因组研究做的不够好,最主要的原因是数据不够。所以,WeGene希望通过云计算与大数据技术的发展来推动这方面的研究,比如尼古丁的研究、基因组和睡眠关系的研究等。

采用的阿里云产品
  • 阿里云云服务器 ECS
  • 阿里云对象存储  OSS
  • 阿里云云数据库 RDS
  • 阿里云 API 网关 API Gateway
  • 阿里云批量计算 BatchCompute
  • 阿里云负载均衡 SLB
  • 阿里云弹性伸缩 Auto Scaling

为什么使用阿里云
需要为用户提供健壮的网站服务
需要海量的计算资源支持大量的数据

关于WeGene
WeGene(微基因)是一家主打个人基因测序服务的公司,主要致力于帮助用户解读基因的奥秘,遇见未知的自己。WeGene现在主要的服务内容包括基于基因组数据的祖源分析、个性化的运动和减肥建议、营养基因组学、基因组医学等方面的内容。未来,WeGene会跟合作伙伴一起把基因组数据推向每一个被基因所影响的角落。

挑战即机遇
基因组数据能够为个人提供好处,在国内很多基因组研究做的不够好,最主要的原因是数据不够。所以,WeGene希望通过云计算与大数据技术的发展来推动这方面的研究,比如尼古丁的研究、基因组和睡眠关系的研究等。尽管云计算为基因分析工作提供了诸多便利,未来还将面临基因组数据的二次分析、全基因组数据存储、分析和可视化和全基因组测序的计算问题等巨大挑战。

为什么选择阿里云?

WeGene上云之路
WeGene云端架构用到的阿里云服务,其中包括云服务器ECS、云存储OSS、云数据库RDS、API应用网关、批量计算等。阿里云的“三大件”(ECS、OSS、RDS)结合负载均衡、弹性伸缩以及其他的NoSQL数据库等功能。
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除了最基本的网站服务以外,由于基因分析需要海量的计算资源,WeGene还与阿里云平台上提供生物信息PAAS服务的北京聚道有限公司(GeneDock)进行了合作,在他们提供的计算平台上运行用户基因数据的分析。
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拥抱阿里云带来的成效
阿里云的“四大件”(ECS、OSS、OSS、RDS)结合负载均衡、弹性伸缩以及其他的NoSQL数据库等功能,让WeGene能够为用户提供健壮的网站服务——无论是在访问量低峰期,还是在批量交付检测报告给用户或市场活动推广时流量较高的情况下。

用户的生物样本在实验室进行实验以后,所产生的实验数据会直接被上传进入OSS中,并根据不同的计算任务需求被分配到WeGene在ECS上自建的计算服务器、GeneDock、批量计算等在内的计算环境中去进行分析。分析的结果会通过统一管理的API网关服务录入数据库,并最终在阿里云上呈现给全球的用户。在这一过程中,阿里云实际帮助我们简化了数据存储、传输、计算方面的问题。

原文发布日期:2017-02-23
云栖社区场景研究小组成员:丁匀泰,仲浩。

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