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首先，我们要清楚的便是每个系统之间的差别，以及在阿里云上的差别：
1. Windows
1.1) 系统内含正版激活。
1.2) 适合于运行Windows下开发的程序，如.net等。
1.3) 支持SQL Server等数据库(需自行安装)。
1.4) 可以使用远程桌面方式登录进行管理。
注：512内存不支持选择Windows系统，1G以上内存才能很好支持该系统。
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2. Linux
2.1.1) 最流行的服务器端操作系统，强大的安全性和稳定性。
2.1.2) 免费且开源，轻松建立和编译源代码。
2.1.3) 通过SSH方式远程访问您的云服务器。
2.1.4) 一般用于高性能web等服务器应用，支持常见的PHP/Python等编程语言，支持MySQL等数据库(需自行安装)。
2.2 CentOS (推荐)请使用yum方式在线安装软件。
2.3 Ubuntu请使用aptitude方式在线安装软件。
2.4 Debian请使用apt-get方式在线安装软件。
2.5 Aliyun Linux(兼容 Red Hat)请使用yum方式在线安装软件，yum源需要自行购买redhat的商业支持。
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操作系统更换规则：
1.更换操作系统
更换系统之前请先停止云服务器，云服务器更换操作系统会直接重置系统盘【IP不变】，系统盘数据将会丢失!
请您注意：
1.1. 更换操作系统会使云服务器的系统盘更换为新的镜像，原有系统盘的数据都会丢失。
1.2. 云服务器数据盘的数据不会受到影响。
1.3. 建议您将系统盘的个人数据备份到数据盘中，或采用其他方式进行备份。
1.4. 因您没有备份系统盘相关个人数据而造成的数据丢失，阿里云不承担责任。
1.5. 内存为512M云服务器不支持更换Windows操作系统。
2. CPU/内存与操作系统的选择
2.1)如需选择/变更4G以上内存请您选择64位操作系统(32位操作系统存在寻址限制)。
2.2) 如您选择32位操作系统，4G以上内存页面暂不展示，只有云服务器更换为64位操作系统才可展示。
2.3)Windows 32位操作系统支持最高CPU为4核。
2.4)配置：[CPU：1核;内存：512M] 的云服务器不支持选择/更换Windows操作系统。
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Windows篇
阿里云提供了6种window系统，涵盖了Server 2003 sp2以及Server 2008 R2这两大类操作系统。
其中又分为了32位和64位
(1)如何选择32位还是64位
32位系统相比64位系统，最主要的限制体现在内存的大小上。因为32位本身的限制，其最大只可支持到4GB内存，如果您的网站要使用高于4GB的内存或者以后有扩充内存寻到4GB以上的打算，请使用64位操作系统。
(2)选择2003还是选择2008
对于windows来说，我个人建议是选择版本越高的越好。相对来说新版本漏洞相对来说更少，而且IIS 7.5相对于IIS6提供了更多的功能以及更方便的控制台。但是考虑到大家的机器配置不同，在此给出一下几种选择：
A：配置低于双核 2GB内存：选择server2003 不装数据库配置双核4GB： server 2003 mssql 或者 server 2008 R2 不带数据库
B：配置高于双核 8GB：serever 2008 R2 mssql 建议如果大家要在云服务器上跑数据库，尽量选择大内存配置，或者降低配置去选用RDS
(3)中英文、安全加固版如何选择
这个就依据大家各自的喜好来了，在此不多说了至于Windows服务器配置教程，因为网上教程很多而且相对于Linux来说Windows配置难度更低，所以Windows的配置教程会比较晚的放出。
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Linux篇
(1)这些linux大类有什么区别
Debian：用的deb包，使用APT包管理系统。
同时Debian提供了大多数软件比较新的版本，并且提供了更多的软件包(相对于原版Red Hat)。Debian的优点在于更新迅速，软件包完善(Ubuntu尤其)，操作便利。缺点是部分时候稳定性欠佳，跟进最新软件有可能存在Bug。
Centos：用rpm包，使用yum包管理系统。
相对于Debian来说，Centost的一大特点就是慢。大部分软件停留在稳定版本，而且相距最新版版本也差较多。而且某些新版软件的一些新特性支持也比较慢，比如php-fpm。
因为Centos是面向企业用户提供的操作系统，所以在稳定性上十分突出，一般在新功能或稳定性的选择上更倾向于后者。只有当某个功能完全确定稳定了，才会加入到系统里。优点是系统稳定，技术文档完善，如果付费的话能得到企业级别的技术支持。缺点是软件包比较老旧，而且一些较新功能会欠缺。
总结一下：如果你喜欢尝鲜，喜欢用最新的功能或喜欢折腾系统，那么Debian是个更好的选择。
上手难度 Ubunt<Debian<Redhat=Centos
(2)Debian与Ubuntu的选择
Ubuntu是基于Debian所开发，可以简单地认为Ubuntu是Debian的功能加强版。
与Debian相比，Ubuntu提供了更人性化系统配置，更强大的系统操作以及比Debian更激进的软件更新。
Ubuntu与Debian比较，可以认为Debian更趋向于保守一些，Ubuntu对新手友好度更高，上手更容易。
用过Ubuntu的都会体会到它的易用，反之如果用过Ubuntu再换到别的系统，都会觉得不适应，Ubuntu真的很方便。
个人建议，如果你打算选择Debian类的，建议选择Ubuntu。
Ubuntu提供了更好的操作，更激进的软件更新，更方便管理软件以及相差无几的稳定性。
如果你不想放弃稳定，那么请选择Debian。
关于Ubuntu版本选择：
在此解释下Ubuntu的版本支持时间。Ubuntu普通版本只提供18个月的技术支持，过期则不管。
服务器版本提供长达五年的技术支持。所以建议大家选择12.04 版，提供长达5年的技术支持，可以确保在静候相当长的一段时间内你的服务器可以继续收到系统升级补丁以及可用的软件源。
(3) Centos 的选择
对于阿里云Centos的选择，建议选择Centos 6.5版本，带来了更多的新特性以及更多的新功能。
除非你的软件需要php 5.1的环境，那么就选择Centos6.5。如果网站需要支持php5.1，只能选用Centos 5.8。
至于具体版本选择，建议php 5.1用户选择Centos 5.8，其他的用户则为Centos 6.5。
