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发表了文章 2021-09-04

实例：查看Docker容器内文件系统

目的：下载 docker images 之后，了解 images 内部目录、文件结构，以及容器内部程序运行情况方法：1. 使用docker exec (最简单)和nsenter命令类似，docker exec 命令可以在已经运行的容器运行新的进程（容器必须已经运行才可以，否则会报错），可以运行/bin/bash进入容器：[arthur@localhost Downloads]$ sudo docker ps [sudo] password for arthur: CONTAINER ID IMAGE COMMAND CREATED STATUS PORTS NAMES 09b6673f175a hicstuff:v1.0 "/bin/bash" 2 hours ago Up 2 hours quizzical_chatelet c67a7e98646a koszullab/hicstuff "/bin/bash" 4 hours ago Up 4 hours sleepy_bhabha [arthur@localhost Downloads]$ sudo docker exec -it quizzical_chatelet /bin/bash (base) root@09b6673f175a:/app# pwd /app (base) root@09b6673f175a:/app# ls LICENSE __init__.py distance_law.py io.py pipeline.py test_commands.py test_filter.py tests MANIFEST.in commands.py filter.py iteralign.py requirements.txt test_digest.py test_hicstuff.py version.py Makefile cutsite.py hicstuff log.py setup.cfg test_distance_law.py test_io.py view.py README.md digest.py hicstuff.py main.py setup.py test_doctests.py test_pipeline.py2. 使用快照（snapshotting）#查看已经运行的容器,记录要查看容器的 ID $ docker ps #创建新的 images $ docker commit ID NewImagesName #通过 `bash` 进入新镜像 $ docker run -it NewImagesName /bin/bash #删除新的镜像 NewImagesName $ docker rmi NewIamgesName3. 使用 ssh如果需要持续性连接到容器，可以在容器内安装sshd，并运行sshd#查看容器 port $ docker ps # $ docker run -d -p PortNumber ContainerName /usr/sbin/sshd -D4. 使用nsenter5. 覆盖默认的 ENTRYPOINT$ docker run --rm -it --entrypoint=/bin/bash NameofImage ######################################################################### --entrypoint string Overwrite the default ENTRYPOINT of the image #覆盖默认 entrypoint [arthur@localhost Downloads]$ sudo docker run --rm -it --entrypoint=/bin/bash koszullab/hicstuff [sudo] password for arthur: (base) root@1f60e1415681:/app# pwd /app (base) root@1f60e1415681:/app# ls LICENSE __init__.py distance_law.py io.py pipeline.py test_commands.py test_filter.py tests MANIFEST.in commands.py filter.py iteralign.py requirements.txt test_digest.py test_hicstuff.py version.py Makefile cutsite.py hicstuff log.py setup.cfg test_distance_law.py test_io.py view.py README.md digest.py hicstuff.py main.py setup.py test_doctests.py test_pipeline.py (base) root@1f60e1415681:/app# #未覆盖 [arthur@localhost Downloads]$ sudo docker run -it koszullab/hicstuff [sudo] password for arthur: INFO :: generated new fontManager usage: hicstuff [-hv] <command> [<args>...] [arthur@localhost Downloads]$ sudo docker run -it koszullab/hicstuff /bin/bash INFO :: generated new fontManager Unknown command. usage: hicstuff [-hv] <command> [<args>...] [arthur@localhost Downloads]$ #运行其他 images [arthur@localhost Downloads]$ sudo docker run -it hicpro:homo.v1 root@5bf6508e2b7c:/# exit exit [arthur@localhost Downloads]$ sudo docker run -it nservant/hicpro:v3.01 root@fb00a89cb150:/# exit exit #原镜像运行 commit 之后的 [arthur@localhost Downloads]$ [arthur@localhost Downloads]$ sudo docker run -it hicstuff:v1.0 [sudo] password for arthur: (base) root@4de5fd7f7bae:/app# pwd /app (base) root@4de5fd7f7bae:/app# ls LICENSE __init__.py distance_law.py io.py pipeline.py test_commands.py test_filter.py tests MANIFEST.in commands.py filter.py iteralign.py requirements.txt test_digest.py test_hicstuff.py version.py Makefile cutsite.py hicstuff log.py setup.cfg test_distance_law.py test_io.py view.py README.md digest.py hicstuff.py main.py setup.py test_doctests.py test_pipeline.py 拓展：镜像构建 dockfile 存在差别： koszullab/hicstuff 镜像为 from conda ， nservant/hicpro from ubuntu原镜像 koszullab/hicstuff commit 之后与原镜像的差别：登陆方式出现差别Reference : [1] exploring Docker container's file system.stack overflow.

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2021年12月

12.28 21:26:19

发表了文章 2021-12-28 21:26:19

conda channels

conda channels
12.28 21:25:10

发表了文章 2021-12-28 21:25:10

The `conda` or `conda-like` package and environment manager usage and practical

The `conda` or `conda-like` package and environment manager usage and practical
12.28 21:23:48

发表了文章 2021-12-28 21:23:48

`conda` environments management

`conda` environments management
12.25 23:06:28

发表了文章 2021-12-25 23:06:28

check sha256sum value consistent with the reference value

check sha256sum value consistent with the reference value
12.22 23:01:20

发表了文章 2021-12-22 23:01:20

install docker on centos7 manually

install docker on centos7 manually
12.20 22:50:37

发表了文章 2021-12-20 22:50:37

能否以普通用户身份或者不使用 sudo 运行Docker ?

能否以普通用户身份或者不使用 sudo 运行Docker ?

2021年11月

11.11 23:15:21

发表了文章 2021-11-11 23:15:21

Linux awk 命令语法与运算符

Linux awk 命令语法与运算符
11.11 14:27:16

发表了文章 2021-11-11 14:27:16

怎样从`MacOSX` 上完全卸载`Nodejs` ?

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11.02 10:30:46

发表了文章 2021-11-02 10:30:46

数组应用：找出一组数据中比均值大的数据并输出

数组应用：找出一组数据中比均值大的数据并输出
11.01 23:10:07

发表了文章 2021-11-01 23:10:07

数组应用（C）：数据求均值

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2021年10月

10.24 22:06:44

发表了文章 2021-10-24 22:06:44

如何撤销命令`make install`的安装结果，或者如何卸载`Linux` 库`library` ?

如何撤销命令`make install`的安装结果，或者如何卸载`Linux` 库`library` ?
10.24 19:34:52

发表了文章 2021-10-24 19:34:52

Bug : Error : loading shared libraries: cannot open shared object file: No such file or directory

Bug : Error : loading shared libraries: cannot open shared object file: No such file or directory

2021年09月

09.16 16:15:13

发表了文章 2021-09-16 16:15:13

构建Docker images 是否需要 OS 作为 base image ？

构建Docker images 是否需要 OS 作为 base image ？
09.16 01:07:47

发表了文章 2021-09-16 01:07:47

Linux CentOS8 目录结构与功能

Linux CentOS8 目录结构与功能
09.16 00:32:14

发表了文章 2021-09-16 00:32:14

Linux CentOS 8 查看系统进程信息

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09.13 22:20:35

发表了文章 2021-09-13 22:20:35

linux CentOS8 查看包（package）信息

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09.04 19:39:17

发表了文章 2021-09-04 19:39:17

实例：查看Docker容器内文件系统

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09.03 23:08:13

发表了文章 2021-09-03 23:08:13

实例：如何在命令行中检查操作系统（OS）类型以及版本号

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09.03 23:03:30

发表了文章 2021-09-03 23:03:30

实例： Linux系统 centos8 文件打包、解包、压缩、解压缩

实例： Linux系统 centos8 文件打包、解包、压缩、解压缩
09.02 18:16:04

发表了文章 2021-09-02 18:16:04

Linux系统CentOS8 检测USB、创建挂载点、挂载、存取USB数据、取消挂载

Linux系统CentOS8 检测USB、创建挂载点、挂载、存取USB数据、取消挂载

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发表了文章 2021-12-28

conda channels
发表了文章 2021-12-28

The `conda` or `conda-like` package and environment manager usage and practical
发表了文章 2021-12-28

`conda` environments management
发表了文章 2021-12-25

check sha256sum value consistent with the reference value
发表了文章 2021-12-22

install docker on centos7 manually
发表了文章 2021-12-20

能否以普通用户身份或者不使用 sudo 运行Docker ?
发表了文章 2021-11-11

Linux awk 命令语法与运算符
发表了文章 2021-11-11

怎样从`MacOSX` 上完全卸载`Nodejs` ?
发表了文章 2021-11-02

数组应用：找出一组数据中比均值大的数据并输出
发表了文章 2021-11-01

数组应用（C）：数据求均值
发表了文章 2021-10-24

如何撤销命令`make install`的安装结果，或者如何卸载`Linux` 库`library` ?
发表了文章 2021-10-24

Bug : Error : loading shared libraries: cannot open shared object file: No such file or directory
发表了文章 2021-09-16

构建Docker images 是否需要 OS 作为 base image ？
发表了文章 2021-09-16

Linux CentOS8 目录结构与功能
发表了文章 2021-09-16

Linux CentOS 8 查看系统进程信息
发表了文章 2021-09-13

linux CentOS8 查看包（package）信息
发表了文章 2021-09-04

实例：查看Docker容器内文件系统
发表了文章 2021-09-03

实例：如何在命令行中检查操作系统（OS）类型以及版本号
发表了文章 2021-09-03

实例： Linux系统 centos8 文件打包、解包、压缩、解压缩
发表了文章 2021-09-02

Linux系统CentOS8 检测USB、创建挂载点、挂载、存取USB数据、取消挂载

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如何撤销命令`make install`的安装结果，或者如何卸载`Linux` 库`library` ?

Bug : Error : loading shared libraries: cannot open shared object file: No such file or directory

构建Docker images 是否需要 OS 作为 base image ？

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实例 ： Linux系统 centos8 文件打包、解包、压缩、解压缩

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