apache可以限制项目中某几个目录的PHP文件被访问，其它PHP文件都不能被访问吗？

你据说的【可以被访问】是什么意思，浏览器端可以通过http访问吗？

例如，www/html, www/pub, www/private三个目录，只有http://test.com/html, http://test.com/pub 可以访问，访问http://test.com/private时报403 Forbidden错误。

如果是这个需求，apache是可以做到的：

<Directory /docroot/www/private>
    Order Deny,Allow
    Deny from all
</Directory>

Apache安装好之后，自带的httpd.conf里也有这样的示例配置。

如果你说的访问是指【PHP include】，比如www/index.php，可以include www/html, www/pub两个目录的文件，但include www/private下的文件时，报permission denied，那你只要把www/private的权限设成766，并让apache进程的owner不是www/private目录的owner即可