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如何理解HPC在生命科学药物研发中的应用?

如何理解HPC在生命科学药物研发中的应用?

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阿阿里云 2022-04-06 22:09:26 1108 0
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  • 云上高性能计算为药物研发提供 HPC+AI 计算平台,实现云上计算药物研发 (CDDD, Computational- Driven-Drug-Design )和人工智能药物研发平台(AIDDD, AI-driven-Drug-Design), 支 撑 传 统 高 性 能 计 算 软 件, 如 Dock6、AutoDock Vina、 Gromacs、NAMD 等,以及 AI 方案所需的计算需求。在药物筛选阶段,需要在海量 的分子库中,筛选有效的先导化合物进行优化和制药,云上高性能计算提供了高通量 虚拟筛选计算产品,实现分子筛选任务,在节点间、节点内高并发执行,加速药物研 发进程。

    此外,云上高性能计算发挥云的优势,第三方药物研究机构可以将自己的研究方 案与云超算集成,然后对外直接提供计算服务。例如,在针对 COVID-19 的药物研发 期间,全球健康药物研发中心(Global Health Drug Discovery Institute, GHDDI)将自 己的 HPC+AI 解决方案部署到云上超算,对合作伙伴开放,能够让其他研发人员加速 药物研发工作。通过全球加速方案,将海外的生物数据直接下载到超算共享目录,让 合作伙伴共享使用。同时,GHDDI 将自己的研发结果直接放到对象存储产品 OSS 上, 并使用 ECS 计算服务器搭建 Web 服务器,将 OSS 访问链接放在 Web 服务器上,供 全球科研人员进行浏览、下载。GHDDI 药物研发解决方案如图 3-55 所示。 3-55.png

    《弹性计算:无处不在的算力》电子书可以通过以下链接下载:https://developer.aliyun.com/topic/download?id=7996"

    2022-04-07 09:37:06
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