手动安装
1 通过Rstudio菜单安装
1.1 Tools--Install Pacakges...
1.2 Pacakges--Install
ggplot2
通过install.pacakges命令安装
install.packages('readxl') install.packages('writexl')
通过BiocManager安装
手动选择镜像源
install.packages('BiocManager') # 安装一次 options(BioC_mirror='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor') # 每次打开Rstudio均需要设置 BiocManager::install('DESeq2') # Update all/some/none? [a/s/n]: n
设置Rprofile.site
local({ r = getOption('repos') options(repos = r, BioC_mirror='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor') })
软件调用
library(ggplot2) library(readxl) library(DESeq2)