节省60%费用!巧用阿里云归档存储降低基因测序成本

简介:

“如果有款存储产品能在保证业务正常运行的时候节省60%的成本,我会毫不犹豫选择它”。

我的工作是做生物基因测序的,我们公司很早就在云上搭建了数据分析平台(云的优势不多说了,省心省钱),数据通过采集设备生成后,会立即上传到云端进行预订的测序分析。当然了,考虑到算法更新,这些数据都是保存在云端的,有了新的分析方法就可以进行更多维度的分析,无需重新采集。

存储周期长是基因数据的特点,在采集后的最初几个月内会被频繁访问,对于数据实时的响应性要求极高。但经过开始的几个月后,原始数据访问频率就开始大幅下降,所以我们尽量会寻找不同访问特性的存储,去降低总存储成本。

之前我们用的一直是阿里云的OSS标准存储,虽然速度快、延迟低、吞吐能力强,但对我们业务的不同时期来说有些“性能过剩”。所以当我们看到阿里云新上线的归档存储OSSArchive的价格的时候,说句实话,挺惊讶的:毕竟这款产品比OSS便宜得多。然后又想到阿里云看的挺远,不免有些服气。

归档存储有多便宜呢?相比标准存储低了近60%,适用于长期(几年甚至更长时间)存储的归档数据取回。按照存储容量300TB来计算,如果使用归档类型存储一年是221184元,即使与300TB年存储包相比,也可节省11万元以上。

image


对基因行业,这是个非常大的惊喜,因为每个基因文件的大小在几GB到几十GB不等,随着基因测序的需求增加,存储规模增长非常快,其在总成本中占有的比例也在不断增大。

另一个吸引我的地方是归档存储采用的是OSS标准API,跟我们现有的数据管理与分析平台完全配套,无需进行平台改造。

归档存储的上手非常简单,我们经过了几天的方案验证后,很快完成了全新的业务架构搭建。

下面是一个归档类型Bucket创建、文件上传、查询、解冻与下载的简单流程:

1、创建归档类型的Bucket

首先通过控制台创建一个归档类型Bucket,当前阿里云OSS开放的是华北2(北京)区域,开通归档类型Bucket流程和其他存储类型Bucket是相同的。

image

2、上传数据

OSS提供的ossutil工具可以自动根据文件大小适配上传模式,包括PUT 上传、分片上传。基因文件普遍都是GB级以上,需要通过分片机制,将大文件能够拆分成多个片段独立上传。

image

3、查询文件列表

OSS API和相关工具可以实时查询文件列表。

image

4、文件解冻

归档存储与标准类型在读取Object前,需要有一个Restore操作,按照OSSArchive文档中介绍,上传到归档类型的Object处于冷冻状态,需要先解冻后进入到可读取状态,Restore操作后需要等待1~4个小时的等待时间。

image


在Restore解冻过程中的Object会显示ongoing-request="true"。

解冻完成后,查询Object状态会显示解冻完成可以直接下载,expiry-date为过期时间,过期时间一到,Object会重新进入冷冻状态。

image


解冻操作是需要收取费用的,每解冻 1GB数据需要0.06元,所以不需要立即使用的Object还是让它安安静静的保存吧。解冻完成24小时后Object会重新回到冷冻状态,参考官网文档处于解冻状态下,可以通过多次调用Restore,使Object最长保持七天可读状态。

5、文件下载、读取分析


image


已经解冻的Object可以和标准类型的Object一样的下载方式 。

对于基因数据的管理,我们对每个基因文件的元信息使用了数据库保存,每个基因文件都会记录上传时期和近半年内使用信息,对于上传时间超过一定时期并且长期没有访问的基因文件,会从标准类型的Bucket中迁移到归档类型Bucket。

归档存储类型总体使用下来的体验不错,也给OSS产品提个建议吧,希望后期能支持加入Restore解冻完成的事件通知,现在应用程序实现中都是每隔一小时去获取下Restore的状态。

目录
相关文章
|
存储 监控 数据可视化
日志服务 SLS 全新推出归档存储类型,相比热存储成本降低 86%
日志服务 SLS 全新推出归档存储类型,在现有热存储、低频存储的基础上,为用户提供更低成本且可查询分析的长期数据存储方案。归档存储价格仅为 0.05 元/GB/月,相比价格最高的热存储最高降幅可达 86%。
1165 0
|
存储 API 对象存储
阿里云OSS归档存储类型单价下调 45%
7月21日起,阿里云对象存储OSS归档存储类型存储单价下调45%,归档解冻(Restore)时间优化到1分钟内
5832 0
|
存储 弹性计算 Linux
归档存储OAS下载到本地并上传到OSS中
本文主要介绍,如何从OAS中将数据批量迁移出来,且保存到OSS中
614 0
归档存储OAS下载到本地并上传到OSS中
|
SQL 数据库 索引
SQL中COUNT函数结合条件使用的技巧与方法
在SQL查询中,COUNT函数是一个非常常用的聚合函数,用于计算表中满足特定条件的记录数
3284 5
|
人工智能 BI
R语言分位数回归Quantile Regression分析租房价格
R语言分位数回归Quantile Regression分析租房价格
|
关系型数据库 PostgreSQL RDS
多字段,任意组合条件查询(0建模) - 毫秒级实时圈人 实践
标签 PostgreSQL , 数组 , GIN索引 , 任意字段组合查询 , 圈人 , ToB分析型业务 , 建模 背景 你也许在一家ToB的数据分析公司,你可能设计了一张表(包括用户标识,及若干已经统计好的的属性值),你也许收集了一些用户的数据,你也许要为客户提供报表,你也许需要为客户提供任意属性值的组合查询,并快速的返回结果给用户。
9924 0
|
应用服务中间件 Android开发
mac下eclipse配置tomcat无法启动问题
症状: tomcat在eclipse里面能正常启动,而在浏览器中访问http://localhost:8080/不能访问,且报404错误。同时其他项目页面也不能访问。 关闭eclipse里面的tomcat,在tomcat安装目录下双击startup.bat手动启动tomcat服务器。
6670 0