用R分析时间序列(time series)数据

简介: 用R分析时间序列(time series)数据 时间序列(time series)是一系列有序的数据。通常是等时间间隔的采样数据。如果不是等间隔,则一般会标注每个数据点的时间刻度。  下面以time series 普遍使用的数据 airline passenger为例。 这是十一年的每月乘客数量,单位是千人次。 如果想尝试其他的数据集,可以访问这里:  https:

用R分析时间序列(time series)数据

时间序列(time series)是一系列有序的数据。通常是等时间间隔的采样数据。如果不是等间隔,则一般会标注每个数据点的时间刻度。

 下面以time series 普遍使用的数据 airline passenger为例。 这是十一年的每月乘客数量,单位是千人次。

如果想尝试其他的数据集,可以访问这里:  https://datamarket.com/data/list/?q=provider:tsdl

可以很明显的看出,airline passenger的数据是很有规律的。

time series data mining 主要包括decompose(分析数据的各个成分,例如趋势,周期性),prediction(预测未来的值),classification(对有序数据序列的feature提取与分类),clustering(相似数列聚类)等。

这篇文章主要讨论prediction(forecast,预测)问题。 即已知历史的数据,如何准确预测未来的数据。

先从简单的方法说起。给定一个时间序列,要预测下一个的值是多少,最简单的思路是什么呢?

(1)mean(平均值):未来值是历史值的平均。

 

(2)exponential smoothing (指数衰减):当去平均值得时候,每个历史点的权值可以不一样。最自然的就是越近的点赋予越大的权重。

或者,更方便的写法,用变量头上加个尖角表示估计值

(3) snaive : 假设已知数据的周期,那么就用前一个周期对应的时刻作为下一个周期对应时刻的预测值

(4) drift:飘移,即用最后一个点的值加上数据的平均趋势

介绍完最简单的算法,下面开始介绍两个time series里面最火的两个强大的算法: Holt-Winters 和 ARIMA。 上面简答的算法都是这两个算法的某种特例。

(5)Holt-Winters:  三阶指数平滑

 Holt-Winters的思想是把数据分解成三个成分:平均水平(level),趋势(trend),周期性(seasonality)。R里面一个简单的函数stl就可以把原始数据进行分解:

一阶Holt—Winters假设数据是stationary的(静态分布),即是普通的指数平滑。二阶算法假设数据有一个趋势,这个趋势可以是加性的(additive,线性趋势),也可以是乘性的(multiplicative,非线性趋势),只是公式里面一个小小的不同而已。  三阶算法在二阶的假设基础上,多了一个周期性的成分。同样这个周期性成分可以是additive和multiplicative的。 举个例子,如果每个二月的人数都比往年增加1000人,这就是additive;如果每个二月的人数都比往年增加120%,那么就是multiplicative。

 R里面有Holt-Winters的实现,现在就可以用它来试试效果了。我用前十年的数据去预测最后一年的数据。 性能衡量采用的是RMSE。 当然也可以采用别的metrics:

预测结果如下:

结果还是很不错的。

(6) ARIMA: AutoRegressive Integrated Moving Average

ARIMA是两个算法的结合:AR和MA。其公式如下:

是白噪声,均值为0, C是常数。  ARIMA的前半部分就是Autoregressive:, 后半部分是moving average: 。  AR实际上就是一个无限脉冲响应滤波器(infinite impulse resopnse), MA是一个有限脉冲响应(finite impulse resopnse),输入是白噪声。

ARIMA里面的I指Integrated(差分)。 ARIMA(p,d,q)就表示p阶AR,d次差分,q阶MA。  为什么要进行差分呢? ARIMA的前提是数据是stationary的,也就是说统计特性(mean,variance,correlation等)不会随着时间窗口的不同而变化。用数学表示就是联合分布相同:

当然很多时候并不符合这个要求,例如这里的airline passenger数据。有很多方式对原始数据进行变换可以使之stationary:

(1) 差分,即Integrated。 例如一阶差分是把原数列每一项减去前一项的值。二阶差分是一阶差分基础上再来一次差分。这是最推荐的做法

(2)先用某种函数大致拟合原始数据,再用ARIMA处理剩余量。例如,先用一条直线拟合airline passenger的趋势,于是原始数据就变成了每个数据点离这条直线的偏移。再用ARIMA去拟合这些偏移量。

(3)对原始数据取log或者开根号。这对variance不是常数的很有效。

如何看数据是不是stationary呢?这里就要用到两个很常用的量了: ACF(auto correlation function)和PACF(patial auto correlation function)。对于non-stationary的数据,ACF图不会趋向于0,或者趋向0的速度很慢。 下面是三张ACF图,分别对应原始数据,一阶差分原始数据,去除周期性的一阶差分数据:

确保stationary之后,下面就要确定p和q的值了。定这两个值还是要看ACF和PACF:

确定好p和q之后,就可以调用R里面的arime函数了。 值得一提的是,R里面有两个很强大的函数: ets 和 auto.arima。 用户什么都不需要做,这两个函数会自动挑选一个最恰当的算法去分析数据。

在R中各个算法的效果如下:

代码如下:

复制代码
passenger = read.csv('passenger.csv',header=F,sep=' ')
p<-unlist(passenger)
pt<-ts(p,frequency=12,start=2001)
plot(pt)
train<-window(pt,start=2001,end=2011+11/12)
test<-window(pt,start=2012)

library(forecast)
pred_meanf<-meanf(train,h=12)
rmse(test,pred_meanf$mean) #226.2657

pred_naive<-naive(train,h=12)
rmse(pred_naive$mean,test)#102.9765

pred_snaive<-snaive(train,h=12)
rmse(pred_snaive$mean,test)#50.70832

pred_rwf<-rwf(train,h=12, drift=T)
rmse(pred_rwf$mean,test)#92.66636

pred_ses <- ses(train,h=12,initial='simple',alpha=0.2)
rmse(pred_ses$mean,test) #89.77035

pred_holt<-holt(train,h=12,damped=F,initial="simple",beta=0.65)
rmse(pred_holt$mean,test)#76.86677  without beta=0.65 it would be 84.41239

pred_hw<-hw(train,h=12,seasonal='multiplicative')
rmse(pred_hw$mean,test)#16.36156

fit<-ets(train)
accuracy(predict(fit,12),test) #24.390252


pred_stlf<-stlf(train)
rmse(pred_stlf$mean,test)#22.07215

plot(stl(train,s.window="periodic"))  #Seasonal Decomposition of Time Series by Loess

fit<-auto.arima(train)
accuracy(forecast(fit,h=12),test) #23.538735

ma = arima(train, order = c(0, 1, 3),   seasonal=list(order=c(0,1,3), period=12))
p<-predict(ma,12)
accuracy(p$pred,test)  #18.55567
BT = Box.test(ma$residuals, lag=30, type = "Ljung-Box", fitdf=2)
复制代码
目录
相关文章
|
3月前
|
数据挖掘 数据处理 Python
​掌握Pandas中的rolling窗口,轻松处理时间序列数据
​掌握Pandas中的rolling窗口,轻松处理时间序列数据
173 1
|
3月前
|
索引 Python
Pandas中的时间序列利器:set_index用法
Pandas中的时间序列利器:set_index用法
94 0
|
7月前
|
数据可视化 Python
DataFrame 中的时间序列分析:处理日期和时间数据
【5月更文挑战第19天】在数据分析中,时间序列数据的处理至关重要。使用Pandas,我们可以将日期列转换为日期类型,便于进行时间序列操作,如提取年月日、计算时间间隔。通过`resample`处理不规则间隔,用`fillna`或`dropna`填补或删除缺失日期。结合`matplotlib`进行可视化,揭示数据趋势。正确处理日期和时间信息是准确分析的前提,帮助我们从时间序列数据中发现模式,为决策提供依据。
181 2
|
7月前
|
人工智能 算法 数据可视化
R语言DTW(Dynamic Time Warping) 动态时间规整算法分析序列数据和可视化
R语言DTW(Dynamic Time Warping) 动态时间规整算法分析序列数据和可视化
|
缓存 Unix 索引
Pandas中to_datetime()转换时间序列函数一文详解
Pandas中to_datetime()转换时间序列函数一文详解
2870 0
Pandas中to_datetime()转换时间序列函数一文详解
|
存储 机器学习/深度学习 数据可视化
Series(序列)
Series(序列)是数学和统计学中的概念,表示按照一定规律排列的一组数据。在计算机科学和数据分析领域,Series也是指一种数据结构,用于存储一维数据,并具有标签或索引。
177 2
|
机器学习/深度学习 数据采集 数据挖掘
Time Series Data
机器学习中的时间序列数据(Time Series Data)是指按时间顺序排列的数据集,其中每个数据点都包含一个或多个特征值。时间序列数据通常用于预测未来事件、
111 0
|
索引
Data Science | 时间序列的索引与切片
Data Science | 时间序列的索引与切片
|
数据格式 Python
Data Science | Pandas基础(三)-Timestamp
Data Science | Pandas基础(三)-Timestamp
131 0
|
数据挖掘
RNA-seq数据分析二:DESeq2 筛选差异基因
RNA-seq数据分析二:DESeq2 筛选差异基因