LBA-ECO CD-02 森林冠层结构,巴西塔帕若斯国家森林:1999-2003

简介: 本数据集记录了1999年10月至2003年6月期间,在巴西塔帕若斯国家森林采集的叶面积指数(LAI)和比叶面积(SLA)数据。研究地点位于圣塔伦市以南80公里,可通过67公里森林入口到达。数据集包含两个ASCII文件和一个配套站点描述文件,涵盖森林与牧场的结构特征。数据可用于分析森林冠层结构及其生态意义,引用来源为Ehleringer等(2011)。相关代码实现涉及数据读取、地图可视化及搜索功能。

​LBA-ECO CD-02 Forest Canopy Structure, Tapajos National Forest, Brazil: 1999-2003

简介

本数据集报告了巴西帕拉州圣塔伦市以南 80 公里的塔帕若斯国家森林(TNF)内或附近的森林和牧场采集的叶面积指数(LAI)和比叶面积(SLA)测量数据。数据采集时间为 1999 年 10 月至 2003 年 6 月,采集地点为可通过 67 公里森林入口进入的塔台站点。本数据集包含 2 个逗号分隔的 ASCII 数据文件,以及 1 个提供站点描述的配套数据文件。

摘要

File #1: CD02_LAI_measurements_TNF.csv

Column Heading Units/format Description
1 Sample_date yyyy/mm/dd Sampling date (yyyy/mm/dd)
2 Site_ID Sampling site (see accompanying Study Site Description file)
3 File_ID LAI 2000 file identification
4 Height m Height at which the measurements were taken, reported in meters (m) above the ground
5 Orientation The direction the sensor was pointing during measurement 1 = north 2 = northwest 3 = west 4 = south 5 = southeast 6 = east
6 LAI m2/m2 Leaf area index measured using a LAI 2000
7 DIFN Diffuse non-interceptance, or visible fraction of the sky
8 MTA degrees Mean foliage tilt angle in degrees

Note: there are no missing values in this data file

File #2: CD02_SLA_measurements_TNF.csv

Column Heading Units/format Description
1 Sample_ID Sample identification number used for linking field measurements to lab analyses; sample IDs in some cases were repeated across sites
2 Sample_date yyyy/mm/dd Sampling date (yyyy/mm/dd)
3 Site_ID Site identification code
4 Latitude degrees Latitide in decimal degrees; negative values indicate south
5 Longitude degrees Longitude in decimal degrees; negative values indicate west
6 Season Season: Wet or Dry
7 Species Scientific name in the format Genus species, where determined, otherwise not provided
8 Common_name Local name, if recorded, otherwise not provided
9 Height m The distance in meters from the ground to the canopy where the leaf was collected
10 Functional_group Vegetation type (Liana, Tree, Sapling or Grass) Note sapling refers to any non-grass life form in the pasture and can include shrubs, young trees and/or young lianas
11 Position Canopy position (for forest sites only): Understory, Mid-canopy, Upper-canopy (top canopy layer), or not provided; for pasture site, canopy position is indicated as not applicable
12 Leaf_area m^2 Leaf area measured by tracing leaf contour on paper sheet while in the field. In the lab, areas were determined using NIH 1.63 software after scanning drawings
13 Leaf_weight g Leaf dry weight (in grams) after leaves were dried in 65C ovens for 48 hours
14 SLA m^2 g-1 Specific leaf area: the ratio of leaf area to its dry weight, reported as m^2 g-1

Missing numeric data values are indicated by -9999; missing character values are indicated as not provided.

Companion file: CD02_LAI_Forest_Site_Descriptions.csv

Column Heading Units/format Description
1 Site_ID Site Identification code
2 Site_description Study site description
3 Tower_height m Tower height in meters, if applicable; pasture site samples were not collected from the tower
4 Latitude degrees Site location latitude in decimal degrees; negative values indicate south
5 Longitude degrees Site location longitude in decimal degrees; negative values indicate west
6 In_LAI Indicates whether LAI was measured at this site
7 In_SLA Indicates whether SLA was measured at this site

Site boundaries: (All latitude and longitude given in decimal degrees)

Site (Region) Westernmost Longitude Easternmost Longitude Northernmost Latitude Southernmost Latitude Geodetic Datum
Para Western (Santarem) - km 67 Primary Forest Tower Site (Para Western (Santarem)) -54.95900 -54.95900 -2.85700 -2.85700 World Geodetic System, 1984 (WGS-84)
Para Western (Santarem) - km 67 Seca-Floresta Tower (Para Western (Santarem)) -55.00000 -55.00000 -2.75000 -2.75000 World Geodetic System, 1984 (WGS-84)
Para Western (Santarem) - km 83 Logged Forest Tower (Para Western (Santarem)) -54.97070 -54.97070 - 3.01700 - 3.01700 World Geodetic System, 1984 (WGS-84)
Para Western (Santarem) - km 77 Pasture Tower Tower (Para Western (Santarem)) -54.88850 -54.88850 -3.02020 -3.02020 World Geodetic System, 1984 (WGS-84)

代码
!pip install leafmap
!pip install pandas
!pip install folium
!pip install matplotlib
!pip install mapclassify

import pandas as pd
import leafmap

url = "https://github.com/opengeos/NASA-Earth-Data"
df = pd.read_csv(url, sep="\t")
df

leafmap.nasa_data_login()

results, gdf = leafmap.nasa_data_search(
short_name="CD02_Forest_Canopy_Structure_1009",
cloud_hosted=True,
bounding_box=(-55.0, -3.02, 54.89, 2.75),
temporal=("1999-10-28", "2003-12-01"),
count=-1, # use -1 to return all datasets
return_gdf=True,
)

gdf.explore()

leafmap.nasa_data_download(results[:5], out_dir="data")

引用

Ehleringer, J., L.A. Martinelli and J.P. Ometto. 2011. LBA-ECO CD-02 Forest Canopy Structure, Tapajos National Forest, Brazil: 1999-2003. Data set. Available on-line [http://daac.ornl.gov] from Oak Ridge National Laboratory Distributed Active Archive Center, Oak Ridge, Tennessee, U.S.A.

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