当我尝试在ubuntu 18中安装bedtools时,它显示以下错误:
cc1plus: error: unrecognized command line option "-std=c++11"
make[1]: * [../../../obj//FileRecordMgr.o] Error 1
Ubuntu 18.04.2:默认的gcc / g ++版本为7.4.0。将其设置为4.4.7是非常不寻常的。如果无法更改为g ++-7.4,则可以使用“ bedtools2-bin程序包”。
$ git clone https://github.com/arq5x/bedtools2.git
$ cd bedtools2/
$ make
### the folder bin/{bedtools + 38 scripts} is created
软件包:bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz https://drive.google.com/drive/folders/1OjAsgpzqx-sK_3PF8FUGuinYqW_jVEWg?usp=sharing
打开bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz的包装:
$ cd bedtools2/
$ tar xvf bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz
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