使用旋转计算两个分子的均方根偏差（RMSD）
使用Kabsch算法（1976）或Quaternion算法（1991）进行旋转，在两个笛卡尔坐标之间.xyz或者.pdb格式中计算均方根偏差（RMSD），从而得到最小的RMSD。
一、安装Anaconda
Win或者Linux系统下Anaconda安装，不赘述，网上很多教程。
二、通过conda安装rmsd
pip install rmsd 或 python -m pip install rmsd
三、计算RMSD
利用calculate_rmsd --help查看使用方法
实例：
calculate_rmsd ethane.xyz ethane_translate.xyz calculate_rmsd ci2_1.pdb ci2_2.pdb
