跟着 Nature Communication 学作图 | 热图+格子注释(通路富集相关)

简介: 跟着 Nature Communication 学作图 | 热图+格子注释(通路富集相关)

heatmap_anotate

今天我们复现一幅2021年6月发表在nature communications上的热图

Title:Molecular determinants of response to PD-L1 blockade across tumor types

DOI:https://doi.org/10.1038/s41467-021-24112-w

之前复现过的热图

  1. 跟着 Cell 学作图 | 复杂热图(ComplexHeatmap)
  2. 跟着 Nature 学作图 | 复杂热图2.0(连续+分类变量)

本期图片

heatmap_enrich_NC

通路富集分析结果的一种展示形式。

难点为在热图上用圆点对p值的大小进行分组注释,即校正p<0.05为红色圆圈,普通p<0.05则为黑色圆圈。

结果展示

纯R实现,放心食用。

复现结果

以上是在R中复现的图片,剩下的细节可以在AI中修改,本文不再赘述。

示例数据和代码领取

详见:跟着 Nature Communication 学作图 | 热图+格子注释(通路富集相关)


绘制

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