简单实例应用(1)

简介: 简单实例应用(1)

##提取文件中的某几列,并取负对数值(P)


#!/usr/bin/perl


use strict;


use warnings;

use Math::Complex;   ##math function


open IN, "$ARGV[0]" or die $!; # Input file

open OUT, ">$ARGV[1]"; # output file


my @line;

my $P_value=0;

while () {

       chomp;

       next if (/^NSNP/);   ##匹配到就跳出循环

       next if (/NA/);

@line=split /\s+/, $_;

$P_value=-logn($line[x],10);   ##log value

print OUT "$line[2]\n";

}


close IN;

close OUT;


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