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个人介绍
专注高性能计算、生物信息大数据分析，www.insvast.com
擅长的技术
- 前端开发
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发表了文章 2023-04-15
使用Sentieon BWA-Meth进行WGBS甲基化分析，速度和精度双提升
在甲基化分析中，Sentieon软件可以与其他工具结合使用以提高分析速度和准确性。在这种情况下，Sentieon BWA被用来替换原始的BWA-mem，与MethyDackel结合，建立起Sentieon BWA-Meth流程。 在这个流程中，Sentieon BWA首先负责处理亚硫酸盐转化后的测序数据进行高效的序列比对。由于Sentieon BWA的优化，比对速度和准确性得到了提高，同时减少了计算资源的消耗。
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发表了文章 2023-01-07
NIC DCV远程可视化软件发布2022.2-14126版本更新
NICE DCV能处理OpenGL 和 Direct/X 图形应用，终端用户可通过LAN/WAN/V**跨空间远程访问PC、Linux、HPC数据中心中的可视化应用。 在低带宽条件下，为远程访问提供稳定、安全、流畅的应用操作及视频查看提供服务。
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发表了文章 2023-01-06
X86 vs ARM 架构同台竞技: 生物大数据大规模并行计算（如何将WGS全基因组计算成本降到1美元）
Sentieon DNAseq 实施的全基因组测序 (WGS) 二级分析流程与行业标准的 BWA-GATK 最佳实践流程结果相匹配，且运行速度提高了 5-20 倍。 Sentieon软件安装简单，开箱即用，并且提供了与ARM和x86指令集适配的版本。使30X WGS 数据样本在OCI 实例上的计算成本压缩到每个样本 1 美元以下，处理时间缩短到近一小时。
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发表了文章 2023-01-06
gget: 一款强大的基因组参考数据库的高效查询工具
开源 Python 和命令行程序 gget 可以高效、轻松地以编程方式访问存储在各种大型公共基因组参考数据库中的信息。 gget 与可获取用户生成的测序数据的现有工具一起使用 ，以取代在基因组数据分析过程中效率低下、可能容易出错的手动网络查询。虽然 gget 模块的灵感来自于繁琐的单细胞 RNA-seq 数据分析任务），但我们预计它们可用于广泛的生物信息学任务。
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发表了文章 2022-12-07
基因组大数据计算：CPU和GPU加速方案深度评测
Sentieon软件是通过改进算法模型实现性能加速(纯CPU环境，支持X86/ARM)，不依赖于昂贵高功耗的专用硬件配置（GPU/FPGA），不依赖专有编程语言；同时Sentieon软件针对几乎所有的短读长和长读测序平台进行了优化，是FDA多次公开挑战赛的连续赢家。本次评测展现了Sentieon软件在Intel Xeon平台上的卓越性能，是基因组二级分析的最佳解决方案。
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发表了文章 2022-11-10
Hap-Eval：Sentieon团队开发的开源结构变异SV准确率评估工具
Hap-eval基于单倍型 (haplotype) 对两组SV结果进行比较，首先会将比较区块内的SV拼接成单倍型序列，如果SV的结果中有定相信息，在这一步也可以被利用；然后这些单倍型序列被用来建立一个矩阵，进行结果判断。
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发表了文章 2022-11-10
Sentieon软件发布202112.06版本更新
我们根据用户的需求与反馈，持续迭代改进Sentieon软件包，三代长读长的变异检测工具是我们近期开发的重点
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发表了文章
2023-04-15
使用Sentieon BWA-Meth进行WGBS甲基化分析，速度和精度双提升
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发表了文章
2023-04-15
毅硕科技携手Sentieon独家赞助第21届亚太生物信息学大会（APBC 2023）
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发表了文章
2023-01-07
NIC DCV远程可视化软件发布2022.2-14126版本更新
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发表了文章
2023-01-06
X86 vs ARM 架构同台竞技: 生物大数据大规模并行计算（如何将WGS全基因组计算成本降到1美元）
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发表了文章
2023-01-06
gget: 一款强大的基因组参考数据库的高效查询工具
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发表了文章
2022-12-07
基因组大数据计算：CPU和GPU加速方案深度评测
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发表了文章
2022-11-10
Hap-Eval：Sentieon团队开发的开源结构变异SV准确率评估工具
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发表了文章
2022-11-10
Sentieon软件发布202112.06版本更新
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