嗨,我想在Python中生成一个热图,类似于所示,其中圆圈的大小表示该单元格中样本的大小。我在seaborn的画廊里找了找,什么也没找到,我想我不能用matplotlib来做这件事。
问题来源StackOverflow 地址:/questions/59381273/heatmap-with-circles-indicating-size-of-population
这是逆。虽然matplotlib可以做几乎所有的事情,但是seaborn只提供了一小部分选项。 因此,使用matplotlib,您可以绘制如下所示的圆形补丁集合。 注意:你也可以使用散点图,但是由于散点的大小是绝对单位,所以很难将它们缩放到网格中。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.collections import PatchCollection
N = 10
M = 11
ylabels = ["".join(np.random.choice(list("PQRSTUVXYZ"), size=7)) for _ in range(N)]
xlabels = ["".join(np.random.choice(list("ABCDE"), size=3)) for _ in range(M)]
x, y = np.meshgrid(np.arange(M), np.arange(N))
s = np.random.randint(0, 180, size=(N,M))
c = np.random.rand(N, M)-0.5
fig, ax = plt.subplots()
R = s/s.max()/2
circles = [plt.Circle((j,i), radius=r) for r, j, i in zip(R.flat, x.flat, y.flat)]
col = PatchCollection(circles, array=c.flatten(), cmap="RdYlGn")
ax.add_collection(col)
ax.set(xticks=np.arange(M), yticks=np.arange(N),
xticklabels=xlabels, yticklabels=ylabels)
ax.set_xticks(np.arange(M+1)-0.5, minor=True)
ax.set_yticks(np.arange(N+1)-0.5, minor=True)
ax.grid(which='minor')
fig.colorbar(col)
plt.show()
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