跟着Cell学作图 | 双曲线火山图

简介: 跟着Cell学作图 | 双曲线火山图

读图

image.png

原图


火山图很常见了,详细的绘制方法我前面的文章也讲过了(答疑| ggplot 绘制火山图并添加文字标签)。今天主要讲的是当阈值线为双曲线时,如何实现?我们画个辅助线便于理解。

image.png


直角阈值

如图,分别以原来的的阈值线为基准,画两个原始函数为y=1/x的的曲线。这样对基因进行分类,有利于筛选差异更显著的基因。

相关文章
|
人工智能 数据可视化 Go
R绘图实战|GSEA富集分析图
GSEA(Gene Set EnrichmentAnalysis),即基因集富集分析,它的基本思想是使用预定义的基因,将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序,然后检验预先设定的基因集合是否在这个排序表的顶端或者底端富集。
2776 0
R绘图实战|GSEA富集分析图
|
数据挖掘 数据格式
跟着Cell学作图 | 6.时间序列分析(Mfuzz包)
这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure:时间序列分析图。
914 0
跟着Cell学作图 | 6.时间序列分析(Mfuzz包)
|
8月前
|
存储 数据可视化 关系型数据库
绘制圆环图/雷达图/星形图/极坐标图/径向图POLAR CHART可视化分析汽车性能数据
绘制圆环图/雷达图/星形图/极坐标图/径向图POLAR CHART可视化分析汽车性能数据
|
8月前
R语言中绘制箱形图的替代品:蜂群图和小提琴图
R语言中绘制箱形图的替代品:蜂群图和小提琴图
跟着 Cell 学作图 | 柱状图+误差棒+蜂群图
跟着 Cell 学作图 | 柱状图+误差棒+蜂群图
223 0
如何用ggplot2绘制基因功能富集气泡图?
如何用ggplot2绘制基因功能富集气泡图?
|
人工智能 数据可视化
跟SCI学umap图| ggplot2 绘制umap图,坐标位置 ,颜色 ,大小还不是你说了算
跟SCI学umap图| ggplot2 绘制umap图,坐标位置 ,颜色 ,大小还不是你说了算
1194 1
|
数据可视化 Go
一行代码绘制高分SCI火山图
经过一段时间的文献阅读和资料查询,终于找到了一个好用而且简单的包——ggVolcano, 它是一个基于R语言和ggplot2绘图包开发的生物信息学数据可视化工具。它可以用于绘制火山图(Volcano plot),帮助研究者分析高通量实验数据,如基因表达谱或蛋白质组学数据,以识别差异表达或差异富集的基因或蛋白质。
437 0
ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来
ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来
131 0
|
数据可视化
R|散点图+边际图(柱形图,小提琴图),颜值UP
R|散点图+边际图(柱形图,小提琴图),颜值UP
362 0