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云上高性能计算,加速生命科学发展

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精彩议程

Marvellous Agenda
生命科学产业现状分享
  • 14:00-14:15
  • 唐风 阿里云弹性计算产品解决方案架构师
  • 中国的生命科学行业正迎来发展的黄金时期。医学的发展和人们对健康的追求,正快速转换为生命科学整个产业链发展的新动能。世界乃至中国的生命科学行业,又有着多少值得注意的趋势?本分享将帮助您速览生命科学产业现状,看清产业发展阶段。
阿里云生命科学行业解决方案分享
  • 14:15-14:30
  • 马继雨 阿里云弹性计算产品解决方案架构师
  • 当前,生命科学企业上云已经成为新的趋势。云上HPC以全新形式提供海量丰富的计算资源和高效便捷的数据服务,在研发流程的统一管理和IT成本优化等方面具有传统模式不可比拟的优势,可以极大地缩减计算时间、提升研发效率,能够更好地帮助生命科学企业赢得机会。本次分享将解读生命科学企业业务上云的解决方案,通过云上HPC助力行业提升生产效率,降低生产成本。
云上高性能计算加速药物研发:深势科技案例分享
  • 14:30-14:45
  • 朱波 阿里云行业解决方案架构师
  • 新药的诞生通常需要经历药物发现、临床前研究、临床试验和审批等阶段后,最终才可以获批上市。在靶点发现、化合物合成等药物发现阶段以及化合物筛选等临床前研究阶段,往往需要借助高性能计算强大的计算能力才能加速研发过程辅助药物设计。
云上高性能计算助力基因测序:寻因生物案例分享
  • 14:45-15:00
  • 马颂 阿里云行业解决方案架构师
  • 基因测序的业务流程主要包括样本上机(测序仪)、测序文件生成、基因序列比对及结果分析(计算机),并将结果数据及报告交付至各科研医疗机构。其中,基因序列比对及分析环节极为耗时,涉及大量的生信领域专业软件,计算资源的算力性能及方案优化对生信研发效率起着至关重要的作用。

产品优势

Product Advantages
丰富算力
多规格异构算力,包括大内存、高主频等,满足多种作业
弹性降本
E-HPC可动态创建/删除计算节点,灵活配置伸缩策略,避免浪费
极简运维
自动搭建集群,提供运行性能分析,可视化呈现
开放兼容
最新算力及上百家合作伙伴集成阿里云,快速享受最新技术

架构介绍

Architecture Introduction
公共云解决方案
混合云解决方案
大内存解决方案
容器化解决方案
方案概述
业务全量部署在云端,依托阿里云E-HPC提供全链路服务与支持,集群的所有节点均为云上资源,并处于同一个VPC,也可以通过阿里云的云企业网打通多个VPC。
方案特点
一站式构建云上HPC集群
用户无需单独创建调度器和域账号服务。
按需弹性扩缩容
业务高峰自动扩容云上资源,按量计费;业务低谷资源自动释放,节省成本。
灵活调整配置
全部资源支持动态升降配,高效稳定支持业务增长。
选用产品
方案概述
按照资源管理节点所在位置可分为两个模式:管理节点在云上或云下。适用场景:拥有线下IDC数据中心,但算力偏旧,随着业务的快速增长,企业希望可以使用云上算力同时利旧IDC。
方案特点
管理节点在云上的模式
运维便捷,HPC维度的资源管理由云上E-HPC管控维护,纳管本地线下计算资源;弹性伸缩,按需计费。适用于想逐步淘汰线下资源,完全切换到云上方案的客户。
管理节点在云下的模式
习惯一致,云上资源加入线下调度集群,由Proxy节点代管理云上资源,原有本地HPC集群无需变更;弹性伸缩,按量计费。适用于想长期使用线下资源,仅在业务高峰时弹性使用云上资源的客户。
选用产品
方案概述
在基因测序数据分析过程中,每个细胞的表达量数据高达数十万条读取。针对这种海量级的数据分析的大内存容量需求,阿里云联合Memverge共同解决。MemVerge Memory Machine内存虚拟化软件,可实现ECS实例内存中数据的访问、分层及扩展,用户可透明使用大内存资源,消除基因测序等大内存数据分析场景带来的IO瓶颈。
方案特点
极致性能
i4p实例具有超大内存,可满足频繁读取要求。
高效便捷
E-HPC弹性伸缩、自动纳管MemVerge节点,节省成本。
选用产品
方案概述
针对生信类应用版本众多、依赖环境复杂,通过将应用打包成容器进行调度更为适合。例如,客户的生信应用工作流的逻辑顺序为A、B、C,A部分的业务基于CentOS 6和开源编译器构建,B部分的业务基于CentOS 7和商用编译器构建,C部分业务又可能与A、B不同。使用高性能容器应用eStack可以支持使用多种软件栈的生信应用运行在同一个平台。
方案特点
高便捷性
提供多种操作系统和生信类应用的系统镜像(如BWA,GATK等),且支持docker、singularity等主流容器镜像,开箱即用。
高兼容性
软件方面支持MPI、PBS、Slurm调度以及E-HPC的自动伸缩;硬件方面支持RoCE、IB等高性能网络,GPU等异构计算资源,CPFS、NAS等高性能存储。
选用产品

客户案例

Use Cases

媒体报道

Media Coverage