GEO:Gene Expression Omnibus
GEOquery包安装
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GEOquery", version = "3.8")
生物信息学 | GEO介绍与安装
2021-12-09
204
版权
版权声明：
本文内容由阿里云实名注册用户自发贡献，版权归原作者所有，阿里云开发者社区不拥有其著作权，亦不承担相应法律责任。具体规则请查看《
阿里云开发者社区用户服务协议》和
《阿里云开发者社区知识产权保护指引》。如果您发现本社区中有涉嫌抄袭的内容，填写
侵权投诉表单进行举报，一经查实，本社区将立刻删除涉嫌侵权内容。
简介：
生物信息学 | GEO介绍与安装
目录
相关文章
|
3月前
|
数据采集
监控
JavaScript
|
6月前
|
数据可视化
数据挖掘
定位技术
|
6月前
|
数据可视化
算法
数据挖掘
|
9月前
|
数据采集
数据可视化
数据挖掘
NCBI GEO王炸：GEO2R直接分析RNA-seq数据，几家欢喜几家愁？
GEO2R是NCBI GEO团队针对上传到GEO的芯片数据开发的一款在线差异分析、可视化作图工具，是广大数据分析人员的福音。然而，一直以来GEO2R仅针对芯片数据，对于越来越多的测序数据，只能下载所上传的matrix矩阵，进行分析，若没有上传表达矩阵，或者基因组版本不合适的话，往往还得下载原始数据重新分析，耗时耗力。
最近，NCBI GEO团队推出了一项“王炸”更新：GEO2R可以直接分析RNA-seq测序数据了。
149
3
3
|
9月前
|
数据可视化
数据挖掘
关系型数据库
R语言中的地理空间数据分析
【4月更文挑战第26天】R语言在地理空间数据分析中发挥着关键作用，拥有如"sp"、"sf"和"rgdal"等扩展包。
186
1
1
|
9月前
|
机器学习/深度学习
数据挖掘
定位技术
地理数据分析：Python在GIS中的应用
【4月更文挑战第12天】本文探讨了Python在GIS中的应用优势和实践，包括其简单易学、开源、强大的数据处理能力以及丰富的GIS库。Python用于地理数据分析，涉及数据获取与处理、空间数据管理、空间分析、地图制作和机器学习。案例展示Python在城市规划、环境保护、资源管理和灾害响应中的作用。通过学习和实践，可以掌握Python在GIS中的技能。
407
0
0
|
存储
机器学习/深度学习
数据挖掘
利用 Python 中的地理空间数据与 GeoPandas
空间数据由与位置关联的记录组成。这些数据可以来自 GPS 轨迹、地球观测图像和地图。每个空间数据点都可以使用坐标参考系统（如纬度/经度对）精确地放置在地图上，以便在地图上精确放置，这使我们能够研究它们之间的关系。
662
0
0
|
数据可视化
定位技术
数据处理
|
移动开发
数据可视化
数据挖掘
|
存储
监控
数据可视化
热门文章
最新文章
1
解决kafka集群由于默认的__consumer_offsets这个topic的默认的副本数为1而存在的单点故障问题
2
oracle 11g 11204补丁信息
3
Python 命令行之旅：初探 docopt
4
时间之箭源于量子纠缠？
5
输入输出流体系图
6
Windows Server 2008 R2下部署OCS 2007 R2 边缘服务器
7
从码农到设计者，从单例模式入手设计代码
8
瑞典力推储能助太阳能发电计划落实
9
十张图告诉你互联网发展的八大趋势
10
第7周-任务3-复数模板类
1
DeepSeek——DeepSeek模型部署实战
126
2
基于FPGA的图像双线性插值算法verilog实现,包括tb测试文件和MATLAB辅助验证
105
3
基于电导增量MPPT控制算法的光伏发电系统simulink建模与仿真
29
4
基于排队理论的客户结账等待时间MATLAB模拟仿真
44
5
3天功能开发→3小时：通义灵码2.0+DEEPSEEK实测报告，单元测试生成准确率92%的秘密
62
6
Sentinel监测到了服务，但是实时监控不显示曲线图，应该怎么解决这个问题？
47
7
通义灵码 2.0 体验报告：AI 赋能智能研发的新范式
61
8
通义灵码 2.0 体验报告：AI 赋能智能研发的新范式
80
9
类和对象的简述（c++篇）
48
10
模拟实现c++中的vector模版
38