系统孤岛的问题不是一个或两个CIO遇到的问题，而是几乎所有CIO都会遇到的问题，否则“整合”之说今天也不会如此火热。只是CIO们因为企业资产分布和信息化建设时间长短等问题的原因，细分种类不尽相同。
比如很多外资厂商在国内的分厂,就会遇到本部信息系统与内地分厂信息系统不统一，信息传递不及时或者效率低下的问题。某台资厂在杭州分厂的信息系统顾问林顾问就曾经向本刊记者抱怨说：“台北和杭州有两套系统，很多时候两边的数据传输都要经过手工或者转化，很不方便，这已经成为了制约系统效率的瓶颈。”
还有不少国内大企业的CIO，他们所面对的问题则更复杂。企业信息化系统孤岛林立，人力资源系统是仁科的，财务是用友的，供应链管理是SAP的……在IBM某一年的整合论坛上，曾经有一位CIO说：“系统建设开始得早，边建边用，便缺少全面规划，那个时候还不时兴什么‘统一规划、分步实施’，到了今天，再想统一，已经很难了，别说领导不肯买单，而且这个损失的责任是不是由CIO来背，也很难说。”
这就是CIO面对孤岛问题时的左右为难。不改革原有系统，系统效率自然低下；改革原有系统，高昂的费用和责任又成了他们的顾虑。台资杭州分厂的林顾问最后获得了企业领导的支持，已经把台北本部和杭州分厂的ERP系统统一为用友的ERP产品，而目前国内的很多大型企业，面对IBM等厂商的大力宣传，正在小心翼翼地准备尝试系统整合。
