R语言ggsurvplot绘制生存曲线报错 : object of type ‘symbol‘ is not subsettab

简介: R语言ggsurvplot绘制生存曲线报错 : object of type ‘symbol‘ is not subsettab

预期

绘制生存曲线图

实际

object of type ‘symbol‘ is not subsettable

重现问题的步骤

library(survminer)

require("survival")


survie <- Surv(time, status) ~ sex
fit<- survfit(survie, data = lung)


ggsurvplot(fit, data = lung)

ggsurvplot()尝试从对象中捕获生存公式Surv(time, status) ~ sex,如下所示:  fit$call$formula

通过分解R代码,执行fit $ call $ formula的结果是“ survie”而不是  Surv(time, status) ~ sex 。这将导致错误消息。

请拟合并可视化生存曲线,如下所示:



library(survival)


fit <- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)


ggsurvplot(fit, data = lung)

如果您仍然想分解R代码,那么我建议使用surv_fit() [survminer软件包中的] 函数  ,它是对R基本函数的扩展,  survfit() 具有更多功能

您可以按以下方式使用它:


survie <- Surv(time, status) ~ sex


fit <- surv_fit(survie, data = lung)


ggsurvplot(fit, data = lung)

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