php执行exec把word转成pdf权限问题

服务器：ubuntu14.04
PHP:5.4
apache:2.0
我按照网上找的方法把jdk1.7.0_79，jodconverter-2.2.2都安装好了，然后用root登录服务器，直接输入命令java -jar /alidata1/source/jodconverter-2.2.2/lib/jodconverter-cli-2.2.2.jar /var/www/wwwroot/Upload/doc/test.doc /var/www/wwwroot/Upload/doc/'test.pdf是可以转的，但是把这段命令放到php文件里就执行不了，返回值一直都是int(127)，用whoami返回的结果是www-data,然后我把服务器上wwwroot、source的所属从root改成www-data，结果还是int(127)，
<?php
//shell_exec('whoami');
exec('java -jar /alidata1/source/jodconverter-2.2.2/lib/jodconverter-cli-2.2.2.jar /var/www/wwwroot/Upload/doc/test.doc /var/www/wwwroot/Upload/doc/test.pdf 2>/var/www/wwwroot/log.txt',$arr,$res);
var_dump($arr,$res);
?>

这样抓日志，得到的是sh: 1: java: not found。
有哪位大神知道这个到底是不是权限的问题，应该如何调整？感谢！