实践记录:使用minikube部署PolarDB-X集群

本文涉及的产品
云数据库 RDS MySQL,集群系列 2核4GB
推荐场景:
搭建个人博客
云原生数据库 PolarDB 分布式版,标准版 2核8GB
RDS MySQL Serverless 基础系列,0.5-2RCU 50GB
简介: 本文记录在虚拟机(centos 7) 上部署PolarDB-X集群及集群的扩展的全部步骤,参考文档https://polardbx.com/document

1 docker环境检查及升级

PolarDB-X部署要求docker版本不低于1.19.3,检查现在docker版本

[root@my_ob ~]# docker version

Client:

Version:         1.13.1

Server:

Version:         1.13.1

API version:     1.26 (minimum version 1.12)

Package version: docker-1.13.1-209.git7d71120.el7.centos.x86_64

Go version:      go1.10.3

Git commit:      7d71120/1.13.1

Built:           Wed Mar  2 15:25:43 2022

OS/Arch:         linux/amd64

Experimental:    false

现在的版本是1.13.1,需要升级到1.19.3以上版本,docker的升级实际上就是删除旧的版本,安装新的版本。运行下面的命令删除旧版本

[root@my_ob run]# yum remove docker \

                  docker-client \

                  docker-client-latest \

                  docker-common \

                  docker-latest \

                  docker-latest-logrotate \

                  docker-logrotate \

                  docker-engine

使用yum安装,先添加docker-ce yum源,

[root@my_ob run]#yum-config-manager \

   --add-repo \

   http://mirrors.aliyun.com/docker-ce/linux/centos/docker-ce.repo

     Loaded plugins: fastestmirror, langpacks, product-id, subscription-manager

     This system is not registered with an entitlement server. You can use subscription-manager to register.

     adding repo from: http://mirrors.aliyun.com/docker-ce/linux/centos/docker-ce.repo

     grabbing file http://mirrors.aliyun.com/docker-ce/linux/centos/docker-ce.repo to /etc/yum.repos.d/docker-ce.repo

     repo saved to /etc/yum.repos.d/docker-ce.repo

yum源配置好了,可以安装docker了,运行下面的命令

[root@my_ob run]# sudo yum -y install docker-ce docker-ce-cli containerd.io


     Installed:

       containerd.io.x86_64 0:1.6.6-3.1.el7    docker-ce.x86_64 3:20.10.17-3.el7    docker-ce-cli.x86_64 1:20.10.17-3.el7

     Dependency Installed:

       docker-ce-rootless-extras.x86_64 0:20.10.17-3.el7               docker-scan-plugin.x86_64 0:0.17.0-3.el7

安装成功后,检查一下docker版本

[root@my_ob run]# docker -v

     Docker version 20.10.17, build 100c701

dockers已经升级至最高版本了。

2 安装helm

先下载helm二机制包

[root@my_ob ~]# wget https://get.helm.sh/helm-v3.7.1-linux-amd64.tar.gz

     --2022-05-31 15:02:18--  https://get.helm.sh/helm-v3.7.1-linux-amd64.tar.gz

     Resolving get.helm.sh (get.helm.sh)... 2606:2800:247:1cb7:261b:1f9c:2074:3c, 152.199.39.108

     Connecting to get.helm.sh (get.helm.sh)|2606:2800:247:1cb7:261b:1f9c:2074:3c|:443... connected.

     HTTP request sent, awaiting response... 200 OK

     Length: 13862382 (13M) [application/x-tar]

     Saving to: ‘helm-v3.7.1-linux-amd64.tar.gz’

     100%[==============================================================================>] 13,862,382   379KB/s   in 38s

     2022-05-31 15:02:59 (358 KB/s) - ‘helm-v3.7.1-linux-amd64.tar.gz’ saved [13862382/13862382]

解压后进入解压后的目录,将helm文件移到/usr/local/bin目录下

[root@my_ob ~]# tar -xvf helm-v3.7.1-linux-amd64.tar.gz -C /usr/local

[root@my_ob ~]# cd /usr/local

[root@my_ob local]# cd linux-amd64

[root@my_ob linux-amd64]# ls

[root@my_ob linux-amd64]# mv helm ../bin

查看helm的版本

[root@my_ob local]# helm version

version.BuildInfo{Version:"v3.7.1", GitCommit:"1d11fcb5d3f3bf00dbe6fe31b8412839a96b3dc4", GitTreeState:"clean", GoVersion:"go1.16.9"}

3 安装minikube,创建k8s集群

minikube要求使用非root用户部署,创建一个新用户,名字为

[root@my_ob ~]# useradd -ms /bin/bash galaxykube

创建的用户要求能够通过docker.sock连接到docker,因此要求属于docker.sock所在的组,docker启动后,这个文件可以在/var/run目录下找到

[root@my_ob ~]# cd /var/run

[root@my_ob run]# ls -l  docke*

-rw-r--r-- 1 root root     4 Jun  9 15:55 docker.pid

srw-rw---- 1 root docker   0 Jun  9 15:55 docker.sock

可以看到这个文件的属组是docker,将创建的新用户加入此组

[root@my_ob ~]# usermod -aG docker galaxykube

下载minikube二进制文件,并将其移到/usr/local/bin目录下

[root@my_ob ~]# curl -Lo minikube https://storage.googleapis.com/minikube/releases/latest/minikube-linux-amd64 && chmod +x minikube && mv minikube /usr/local/bin/


 % Total    % Received % Xferd  Average Speed   Time    Time     Time  Current

                                Dload  Upload   Total   Spent    Left  Speed

100 69.2M  100 69.2M    0     0  3018k      0  0:00:23  0:00:23 --:--:-- 3732k


上面这条命令先现在minikube二进制文件,赋予其执行权限后,将其移动到/usr/local/bin目录下。命令执行完成后,看一下minikube版本

[root@my_ob ~]# minikube version

minikube version: v1.25.2

commit: 362d5fdc0a3dbee389b3d3f1034e8023e72bd3a7

现在可以启动一个k8s集群了,首先要切换到新创建的用户下

[root@my_ob ~]# su - galaxykube

使用参考文档中命令启动k8s集群

minikube start --cpus 4 --memory 10240 --image-mirror-country cn --registry-mirror=https://docker.mirrors.ustc.edu.cn

命令运行后,拉取映像时一直没有速度,百度了一下,使用下面的命令,设置了映像仓库和base 映像后速度快了很多。

minikube start  --image-mirror-country='cn' --image-repository='registry.cn-hangzhou.aliyuncs.com/google_containers' --base-image='registry.cn-hangzhou.aliyuncs.com/google_containers/kicbase:v0.0.28'

     * minikube v1.25.2 on Centos 7.9.2009

     * Using the docker driver based on existing profile

     * Starting control plane node minikube in cluster minikube

     * Pulling base image ...

         > registry.cn-hangzhou.aliyun...: 355.77 MiB / 355.78 MiB  100.00% 1.70 MiB

     * Creating docker container (CPUs=4, Memory=10240MB) ...

     * Preparing Kubernetes v1.23.3 on Docker 20.10.8 ...

       - kubelet.housekeeping-interval=5m

         > kubectl.sha256: 64 B / 64 B [--------------------------] 100.00% ? p/s 0s

         > kubelet.sha256: 64 B / 64 B [--------------------------] 100.00% ? p/s 0s

         > kubeadm.sha256: 64 B / 64 B [--------------------------] 100.00% ? p/s 0s

         > kubectl: 44.43 MiB / 44.43 MiB [---------------] 100.00% 2.95 MiB p/s 15s

         > kubeadm: 43.12 MiB / 43.12 MiB [---------------] 100.00% 1.48 MiB p/s 29s

         > kubelet: 118.75 MiB / 118.75 MiB [------------] 100.00% 1.96 MiB p/s 1m1s

       - Generating certificates and keys ...

       - Booting up control plane ...

       - Configuring RBAC rules ...

     * Verifying Kubernetes components...

       - Using image registry.cn-hangzhou.aliyuncs.com/google_containers/storage-provisioner:v5

     * Enabled addons: default-storageclass, storage-provisioner

    ! /usr/local/bin/kubectl is version 1.15.0, which may have incompatibilites with Kubernetes 1.23.3.

       - Want kubectl v1.23.3? Try 'minikube kubectl -- get pods -A'

     * Done! kubectl is now configured to use "minikube" cluster and "default" namespace by default


上面输出显示标红的部分提示kubectl和kubernetes的版本有兼容性问题,后面切换默认命名空间时总是不能成功,需要更新kubectl版本才可以。

查看一下k8s集群信息

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl cluster-info

     Kubernetes master is running at https://192.168.49.2:8443

     CoreDNS is running at https://192.168.49.2:8443/api/v1/namespaces/kube-system/services/kube-dns:dns/proxy

   

     To further debug and diagnose cluster problems, use 'kubectl cluster-info dump'.

k8s master节点已经运行

4 创建PolarDB-X集群

1) 创建PolarDBX operator命名空间

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl create namespace polar-oper-system

     namespace/polar-oper-system created

2) 安装PolarDBX operator

    这里通过 PolarDB-X 的 Helm Chart 仓库安装PolarDB-X Operator。首先在helm中添加PolarDB-X Operator

[galaxykube@my_ob ~]$ helm repo add polardbx https://polardbx-charts.oss-cn-beijing.aliyuncs.com

     "polardbx" has been added to your repositories

添加仓库成功后,安装PolarDB-X Operator

[galaxykube@my_ob ~]$ helm install --namespace  polar-oper-system polardbx-operator polardbx/polardbx-operator

     NAME: polardbx-operator

     LAST DEPLOYED: Fri Jun 10 09:08:35 2022

     NAMESPACE: polar-oper-system

     STATUS: deployed

     REVISION: 1

     TEST SUITE: None

     NOTES:

     polardbx-operator is installed. Please check the status of components:

   

         kubectl get pods --namespace polar-oper-system

   

     Now have fun with your first PolarDB-X cluster.

   

     Here is the manifest for quick start:

   

     ```yaml

     apiVersion: polardbx.aliyun.com/v1

     kind: PolarDBXCluster

     metadata:

       name: quick-start

       annotations:

         polardbx/topology-mode-guide: quick-start

     ```

安装完成后,检查PolarDBX operator状态

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get pods --namespace polar-oper-system

     NAME                                                           READY   STATUS    RESTARTS   AGE

     polardbx-controller-manager-76758cc4f4-n4w7q   1/1     Running   0          78s

     polardbx-hpfs-dxsvf                                              1/1     Running   0          78s

     polardbx-tools-updater-l4sz9                                1/1     Running   0          78s

等到上面显示的三个容器状态都为running后,PolarDBX operato成功完成启动,就可以创建PolarDB-X集群了,否则创建集群时会报错。报错信息如下

Error from server (InternalError): error when creating "STDIN": Internal error occurred: failed calling webhook "polardbxcluster-mutate.polardbx.aliyun.com": the server is currently unable to handle the request

创建集群使用参考文档的脚本

galaxykube@my_ob ~]$ echo "apiVersion: polardbx.aliyun.com/v1

     > kind: PolarDBXCluster

     > metadata:

     >   name: quick-start

     >   annotations:

     >     polardbx/topology-mode-guide: quick-start" | kubectl apply -f -

     polardbxcluster.polardbx.aliyun.com/quick-start created

可以看到集群创建成功了。

显示一下集群创建进度

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get polardbxcluster -w

     NAME          GMS   CN    DN    CDC   PHASE      DISK   AGE

     quick-start   0/1   0/1   0/1   0/1   Creating          7m21s

这次实验集群创建卡在了这个阶段,集群创建状态迟迟没有变化,同参考文档中93s就完成了dn和cn的创建相比,这里过了7分钟了状态还没有任何变化,按crtl+C退出这个命令,检查一下pod状态

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get pods

     NAME                             READY   STATUS         RESTARTS   AGE

     quick-start-4dn6-dn-0-single-0   0/3     ErrImagePull   0          7m6s

     quick-start-4dn6-gms-single-0    0/3     ErrImagePull   0          7m6s

可以看到在映像拉取时遇到了问题,起初怀疑是映像源出现了问题,打算放弃了,刚好关掉了虚拟机,过了一段时间,又启动过了虚拟机,启动了minikube后,映像拉取竟然成功了,集群中的pod状态是下面的输出显示的样子

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get pods

NAME                                            READY   STATUS            RESTARTS      AGE

   quick-start-4dn6-cdc-default-84f787f756-cpp7s   1/2     Running           1 (19m ago)   22m

   quick-start-4dn6-cn-default-756d99d485-xl8hk    0/3     PodInitializing   0 (30s ago)   22m

   quick-start-4dn6-dn-0-single-0                  3/3     Running           3 (19m ago)   63m

   quick-start-4dn6-gms-single-0                   3/3     Running           3 (19m ago)   63m

查看一下PolarDB-X集群的创建进度

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get polardbxcluster -w

   NAME          GMS   CN    DN    CDC   PHASE      DISK   AGE

   quick-start   1/1   0/1   1/1   0/1   Creating          68m

   quick-start   1/1   0/1   1/1   1/1   Creating          68m

   quick-start   1/1   1/1   1/1   1/1   Running    2.4 GiB   68m

集群创建成功了。创建的集群名称为quick start,看一下用户访问集群的服务

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get svc quick-start

   NAME          TYPE        CLUSTER-IP       EXTERNAL-IP   PORT(S)             AGE

   quick-start   ClusterIP   10.106.113.148   <none>        3306/TCP,8081/TCP   70m

将服务的3306端口转发到本地,这一步需要保持转发进程的存活,不能关闭窗口

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl port-forward svc/quick-start 3306

   Forwarding from 127.0.0.1:3306 -> 3306

   Forwarding from [::1]:3306 -> 3306

另开一个会话连接至虚拟机,切换到galaxykube用户下,查看polardbx_root 账号的密码

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get secret quick-start -o jsonpath="{.data['polardbx_root']}" | base64 -d - | xargs echo "Password: "

   Password:  ********

用本地mysql客户端登录集群

[galaxykube@my_ob ~]$ mysql -h127.0.0.1 -P3306 -upolardbx_root -p*******

Welcome to the MariaDB monitor.  Commands end with ; or \g.

Your MySQL connection id is 169

Server version: 8.0.3 Tddl Server (ALIBABA)

Copyright (c) 2000, 2018, Oracle, MariaDB Corporation Ab and others.

Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the current input statement.

看一下现有数据库

MySQL [(none)]> show databases;

+--------------------+

| DATABASE           |

+--------------------+

| information_schema |

+--------------------+

1 row in set (0.01 sec)

显示集群中的计算节点

MySQL [(none)]> show mpp;

+-------------+-----------------+------+--------+

| ID          | NODE            | ROLE | LEADER |

+-------------+-----------------+------+--------+

| quick-start | 172.17.0.7:3506 | W    | Y      |

+-------------+-----------------+------+--------+

1 row in set (0.01 sec)

显示集群中的存储节点

MySQL [(none)]> show storage;

+-----------------------+--------------------------------------+------------+-----------+----------+-------------+--------+-----------+-------+--------+

| STORAGE_INST_ID       | LEADER_NODE                          | IS_HEALTHY | INST_KIND | DB_COUNT | GROUP_COUNT | STATUS | DELETABLE | DELAY | ACTIVE |

+-----------------------+--------------------------------------+------------+-----------+----------+-------------+--------+-----------+-------+--------+

| quick-start-4dn6-dn-0 | quick-start-4dn6-dn-0-single-0:14316 | true       | MASTER    | 1        | 2           | 0      | false     | null  | null   |

| quick-start-4dn6-gms  | quick-start-4dn6-gms-single-0:17276  | true       | META_DB   | 2        | 2           | 0      | false     | null  | null   |

+-----------------------+--------------------------------------+------------+-----------+----------+-------------+--------+-----------+-------+--------+

2 rows in set (0.03 sec)

可以看出gms节点和DN节点都显示为存储节点

5 集群扩容

PolarDB-X集群可以在线扩容和缩容,增加或减少计算、存储节点,不会影响到业务运行。这次只做了增加存储节点的实验,使用kubectl工具编辑相应的polardbxcluster 即可

kubectl edit polardbxcluster quick-start

找到下面的topology部分,更改每个节点的副本数量即可实现扩容或者缩容,这里把dn节点的数量改为2。保存后退出。

 topology:

     nodes:

       cdc:

         replicas: 1

         template:

           resources:

             limits:

               cpu: "1"

               memory: 1Gi

             requests:

               cpu: 100m

               memory: 500Mi

       cn:

         replicas: 1

         template:

           resources:

             limits:

               cpu: "1"

               memory: 2Gi

             requests:

               cpu: 100m

               memory: 1Gi

       dn:

         replicas: 2

         template:

           engine: galaxy

           hostNetwork: true

           resources:

             limits:

               cpu: "1"

               memory: 1Gi

             requests:

               cpu: 100m

               memory: 500Mi

           serviceType: ClusterIP

显示集群扩容进度

[galaxykube@my_ob ~]$ kubectl get polardbxcluster quick-start -w

     NAME          GMS   CN    DN    CDC   PHASE       DISK      AGE

     quick-start   1/1   1/1   1/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   106m

     quick-start   1/1   1/1   1/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   106m

     quick-start   1/1   1/1   1/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   107m

     quick-start   1/1   1/1   1/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   109m

     quick-start   1/1   1/1   1/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   110m

     quick-start   1/1   1/1   2/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   110m

     quick-start   1/1   1/1   2/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   110m

     quick-start   1/1   1/1   2/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   110m

     quick-start   1/1   1/1   2/2   1/1   Upgrading   2.5 GiB   111m

     quick-start   1/1   1/1   2/2   1/1   Running     2.5 GiB   111m

     quick-start   1/1   1/1   2/2   1/1   Running     3.7 GiB   111m

集群阶段开始显示为upgrading,DN的节点数量变为2个,升级完成后,状态变为running,磁盘数据量由2.5GiB变为3.7GiB。

登录数据库,显示集群中dn

MySQL [(none)]> show storage;

     +-----------------------+--------------------------------------+------------+-----------+----------+-------------+--------+-----------+-------+--------+

     | STORAGE_INST_ID       | LEADER_NODE                          | IS_HEALTHY | INST_KIND | DB_COUNT | GROUP_COUNT | STATUS | DELETABLE | DELAY | ACTIVE |

     +-----------------------+--------------------------------------+------------+-----------+----------+-------------+--------+-----------+-------+--------+

     | quick-start-4dn6-dn-0 | quick-start-4dn6-dn-0-single-0:14316 | true       | MASTER    | 1        | 2           | 0      | false     | null  | null   |

     | quick-start-4dn6-dn-1 | quick-start-4dn6-dn-1-single-0:14933 | true       | MASTER    | 1        | 1           | 0      | true      | null  | null   |

     | quick-start-4dn6-gms  | quick-start-4dn6-gms-single-0:17276  | true       | META_DB   | 2        | 2           | 0      | false     | null  | null   |

     +-----------------------+--------------------------------------+------------+-----------+----------+-------------+--------+-----------+-------+--------+

     3 rows in set (0.03 sec)

集群中已经有2个dn了。












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6天前
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存储 SQL 缓存
PolarDB-X 在 ClickBench 数据集的优化实践
本文介绍了 PolarDB-X 在 ClickBench 数据集上的优化实践,PolarDB-X 通过增加优化器规则、优化执行器层面的 DISTINCT 和自适应两阶段 AGG、MPP 压缩等手段,显著提升了在 ClickBench 上的性能表现,达到了业内领先水平。
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1月前
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SQL 人工智能 自然语言处理
PolarDB-PG AI最佳实践 1:基础能力实践
Polar_AI 是 PolarDB 数据库的 AI 扩展,集成了先进的人工智能模型和算法,使数据库能够执行机器学习和自然语言处理任务。它支持 PostgreSQL 及 Oracle 兼容版本,通过标准 SQL 轻松调用 AI 模型,具备简单易用、灵活可定制、无缝数据融合、数据安全和高性能等优势。用户可以通过 SQL 快速实现文本转向量、情感分类等功能,并能自定义扩展 AI 模型。
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2月前
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关系型数据库 Linux 分布式数据库
rpm安装polarDB-PG的实践
安装PolarDB for PostgreSQL的实践,需要帮助到有同样需要的小伙伴
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2月前
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NoSQL Cloud Native atlas
探索云原生数据库:MongoDB Atlas 的实践与思考
【10月更文挑战第21天】本文探讨了MongoDB Atlas的核心特性、实践应用及对云原生数据库未来的思考。MongoDB Atlas作为MongoDB的云原生版本,提供全球分布式、完全托管、弹性伸缩和安全合规等优势,支持快速部署、数据全球化、自动化运维和灵活定价。文章还讨论了云原生数据库的未来趋势,如架构灵活性、智能化运维和混合云支持,并分享了实施MongoDB Atlas的最佳实践。
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3月前
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NoSQL Cloud Native atlas
探索云原生数据库:MongoDB Atlas 的实践与思考
【10月更文挑战第20天】本文探讨了MongoDB Atlas的核心特性、实践应用及对未来云原生数据库的思考。MongoDB Atlas作为云原生数据库服务,具备全球分布、完全托管、弹性伸缩和安全合规等优势,支持快速部署、数据全球化、自动化运维和灵活定价。文章还讨论了实施MongoDB Atlas的最佳实践和职业心得,展望了云原生数据库的发展趋势。
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3月前
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存储 关系型数据库 MySQL
阿里云PolarDB解决游戏行业全球部署高并发问题
阿里云PolarDB解决游戏行业全球部署高并发问题