Biopython:Fasta格式转CSV格式

简介: Biopython:Fasta格式转CSV格式
#载入数据
meta=[]
sequence=[]
seq = ('ls_orchid.fasta')
for seq_record in SeqIO.parse(seq, "fasta"):
    meta.append(str(seq_record.id))
    sequence.append(str(seq_record.seq))
#print(sequence)
df= pd.DataFrame(data ={'Meta':meta,'SequenceID':sequence})
print(df)

image.png

#数据存入csv
df.to_csv("nc_data.csv", sep=',',index=False)

image.png

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