【Spark Summit East 2017】Spark上基因组分析的算法和工具

简介: 本讲义出自Ryan Williams在Spark Summit East 2017上的演讲,主要介绍了Hammer构建于Spark上的几个基因数据分析工具以及使用RDDs进行一般性计算的库,并分享了其中最有趣的几个应用程序和算法:Guacamole、Pageant以及Magic RDDs。

更多精彩内容参见云栖社区大数据频道https://yq.aliyun.com/big-data;此外,通过Maxcompute及其配套产品,低廉的大数据分析仅需几步,详情访问https://www.aliyun.com/product/odps


本讲义出自Ryan Williams在Spark Summit East 2017上的演讲,主要介绍了Hammer构建于Spark上的几个基因数据分析工具以及使用RDDs进行一般性计算的库,并分享了其中最有趣的几个应用程序和算法:Guacamole、Pageant以及Magic RDDs。


d3b90fa615faca8bbb53a4ed2759fdc01c6793c5

f7319ea74588930974c1173cd33a2626a76452aa

3504b5dd6a40d41d92db353cabe24554d940b903

bf790ebee67b6a710d720b9dc034ea886185c4eb

b2f4748688e5fad83faebb69a6e188d631fdfd8a

34099b07412be4c562666392f877dd6126f74b2e

13dd499f6ee80b74f35e228dcf748465b386861c

e4ad698117d9d80508e049d26cc5ca8c5265ba39

135f799372baf34e201299e6ae359ec7fd3a7707

7211cf743b8bf69c07b67d1fcc0cd63a5fbb61c5

f135d93772ecf54688d8a8ef4708ee0e3c067b4e

025e13e4d151dc3add5e46067b3f36505768db8d

92ea24328d0a605bc30b9e35e6236f6ed6f10438

b73d58cb51a4bfdfb16f69a6bc87050ee815ffb2

48e5d80ad635e01c1d83ad76e7b7adcc381d57bb

ea6b697a6feb32d094ac1c0904e6d0ac7a4d50ad

e402e877c0f345d0f01337c009bfa09312107b47

1d86e1ec0020fc3cb017995ecff18952ecf167f6

470d992234e22168d47cef731fde530a14401e34

481371b0a70348498b5e58d77e2e2c9476ee3d29

4166ad3b7aea43d83a8c4c5ac6584b18b34034fb

60b11a8a01ae3fabc6c0f9e2c0a67f325d8ab230

334cb14e5b1b4a1177b50b9eb87a91f71e8247ca

5ed2f06086d2668bc926ea4cb93e0383acefda37

73b733e800f2fe51e478e9dbe930957b11b77a88

27ec601f6de6a9ed76730cb3311f17e35cbaf3a4

d5bb315c40dc6695405d02ea367e24580f9b7a17

相关文章
|
8月前
|
机器学习/深度学习 分布式计算 算法
Spark快速大数据分析PDF下载读书分享推荐
《Spark快速大数据分析》适合初学者,聚焦Spark实用技巧,同时深入核心概念。作者团队来自Databricks,书中详述Spark 3.0新特性,结合机器学习展示大数据分析。Spark是大数据分析的首选工具,本书助你驾驭这一利器。[PDF下载链接][1]。 ![Spark Book Cover][2] [1]: https://zhangfeidezhu.com/?p=345 [2]: https://i-blog.csdnimg.cn/direct/6b851489ad1944548602766ea9d62136.png#pic_center
251 1
Spark快速大数据分析PDF下载读书分享推荐
|
10月前
|
移动开发 分布式计算 Spark
Spark的几种去重的原理分析
Spark的几种去重的原理分析
191 0
|
21天前
|
SQL 分布式计算 Serverless
基于阿里云 EMR Serverless Spark 版快速搭建OSS日志分析应用
基于阿里云 EMR Serverless Spark 版快速搭建OSS日志分析应用
|
5月前
|
存储 分布式计算 算法
大数据-106 Spark Graph X 计算学习 案例:1图的基本计算、2连通图算法、3寻找相同的用户
大数据-106 Spark Graph X 计算学习 案例:1图的基本计算、2连通图算法、3寻找相同的用户
111 0
|
2月前
|
存储 算法 Serverless
剖析文件共享工具背后的Python哈希表算法奥秘
在数字化时代,文件共享工具不可或缺。哈希表算法通过将文件名或哈希值映射到存储位置,实现快速检索与高效管理。Python中的哈希表可用于创建简易文件索引,支持快速插入和查找文件路径。哈希表不仅提升了文件定位速度,还优化了存储管理和多节点数据一致性,确保文件共享工具高效运行,满足多用户并发需求,推动文件共享领域向更高效、便捷的方向发展。
|
4月前
|
分布式计算 Java 开发工具
阿里云MaxCompute-XGBoost on Spark 极限梯度提升算法的分布式训练与模型持久化oss的实现与代码浅析
本文介绍了XGBoost在MaxCompute+OSS架构下模型持久化遇到的问题及其解决方案。首先简要介绍了XGBoost的特点和应用场景,随后详细描述了客户在将XGBoost on Spark任务从HDFS迁移到OSS时遇到的异常情况。通过分析异常堆栈和源代码,发现使用的`nativeBooster.saveModel`方法不支持OSS路径,而使用`write.overwrite().save`方法则能成功保存模型。最后提供了完整的Scala代码示例、Maven配置和提交命令,帮助用户顺利迁移模型存储路径。
|
5月前
|
SQL 分布式计算 Serverless
EMR Serverless Spark:一站式全托管湖仓分析利器
本文根据2024云栖大会阿里云 EMR 团队负责人李钰(绝顶) 演讲实录整理而成
299 2
|
4月前
|
存储 JSON 算法
TDengine 检测数据最佳压缩算法工具,助你一键找出最优压缩方案
在使用 TDengine 存储时序数据时,压缩数据以节省磁盘空间是至关重要的。TDengine 支持用户根据自身数据特性灵活指定压缩算法,从而实现更高效的存储。然而,如何选择最合适的压缩算法,才能最大限度地降低存储开销?为了解决这一问题,我们特别推出了一个实用工具,帮助用户快速判断并选择最适合其数据特征的压缩算法。
106 0
|
5月前
|
设计模式 数据采集 分布式计算
企业spark案例 —出租车轨迹分析
企业spark案例 —出租车轨迹分析
164 0
|
9月前
|
存储 分布式计算 Hadoop
Spark和Hadoop都是大数据处理领域的重要工具
【6月更文挑战第17天】Spark和Hadoop都是大数据处理领域的重要工具
220 59

热门文章

最新文章