活动目录的设计主要包括逻辑结构设计和物理结构设计两大方面，具体涉及域（domain）、林（forest）、全局目录服务器 （Global Catalog，简称GC）、组织单元（Organizational Unit，简称OU）、站点（Site）、DNS（Domain Name System）、域控制器（Domain Controller，简称DC）7个关键点。
逻辑结构设计原则
原则一、域设计原则
◆在管理任务明显由区域划分的环境中可以独立设置域，如某公司的亚洲分部和欧洲分部等，可以设立域对各自独立的资源进行统一管理。
◆特殊情况下，如果域数据库中的对象（包括被管理的用户、计算机、打印机等）过多，超过100万时（对于中小型企业很难达到），需要考虑增加域。
原则二、 林设计原则
公司由于业务等需求需要设定多个名字空间，如需要corp.com和corp.cn两个名字空间，则必须建立林，该林中包含以corp.com为根 域和以corp.cn为根域的两棵树。并且，需根据实际情况为这2棵树之间确定好信任关系（即：授权2棵树中的用户相互访问各自管理的资源）。
原则三、OU设计原则
◆对于域安全准则一致的域，如果需要突出其中的某些业务和组织职能，则可以为域创建组织单元（OU），而没有必要重新创建单独的域。比如，对一个microsoft.com，底下划分为销售、人力等部门，可以创建sales、hr等等OU。
◆在具体的OU设计中，微软给出了地理模型、对象模型、成本中心模型等7个基本模型供参考。
物理结构设计原则
原则四、站点设计原则
站点设置的目的是控制网络产生的登录通信量和复制通信量。（1）登录通信量：每次当用户登录网络时，Windows 2000/Windows Server 2003/Windows Server 2008都会试图查找与用户在同一站点的DC，产生登录通信量。（2）复制通信量：将目录数据库的变动更新到多个DC，站点将控制该通信量如何以及何时产 生。具体的设定原则如下：
◆了解与站点设计相关的IP子网（IP Subnet）分配及物理链路情况，以确定站点的物理连接。
◆由于site内各DC间的复制流量及频度较大，为保证效率，需将高速连接（如高速LAN）的区域设置位于同一个site，将低速连接（如低速WAN）的区域设置位于不同site。
◆在一个site中至少配备一个DC、一个GC、一个DNS来对用户进行快速验证，并提供快速地信息查询和检索。
◆合理的设定站点内复制（Intrasite Replication）和站点间复制（Intersite Replication），隔离复制流量。按照微软AD的设计理念，站点间复制比站点内复制流量要减少80%-90%，原因是站点间复制采用了压缩机制。
原则五、GC设计原则
GC存储林中每个对象的一定数量的信息，这些信息通常是被频繁查询或者搜索的属性，当用户在域外查找对象时，使用GC可以避免调用目的地的DC，从而加快查询速度和减少网络流量。建议，每个site都配备一个GC。
原则六、 DC设计原则
DC的设计与用户的数量有很大关系，如下表所示：
原则七、DNS设计原则
◆尽可能使用与AD集成的DNS，为客户端登录寻找DC、DC间寻找提供定位服务。
◆DNS服务器应支持SRV资源记录外，并建议DNS服务器提供对DNS的动态升级。DNS动态升级定义了一个DNS服务器自动升级的协议，如果没有此协议，管理员不得不手动配置域控制器产生的新的记录。
