Thorbjorn在提问中认为Mono并不能称作是跨平台的.NET，理由如下：
- OpenJDK等Java提供商都通过了官方的Sun TCK来保证正常工作，Mono似乎并没有通过Microsoft TCK。
- Mono的发布总是落后于.NET，那么目前它又对.NET支持到什么程度呢？
- 如WinForm等GUI工具是否可以在Mono下正常工作？
- 商业用户不会将开源框架作为备选方案。
用户sparkie首先回应了以上几点疑问：
首先，CLI（Common Language Infrastructure）和.NET是有区别的，前者是公开标准，而后者是微软对这一标准的实现，Mono则是CLI的又一实现，它从来不是“可移植的.NET”。同样，C#也是一个公开标准，也不和.NET绑定在一起。
Mono相对于.NET是有些落后，但也只有一丁点而已。Mono可以运行C# 4.0的代码（最新的.NET版本），与此同时微软最近把所有的DLR代码都开源了（使用Apache 2.0授权协议），这意味着mono可以直接使用IronPython，IronRuby，同时F#也不久前也已经开源，再加上微软都会定期发布.NET的CTP版本，因此Mono开发人员几乎可以时刻和.NET保持同步。.NET中的部分工具和扩展，如Code Contract等等，它们并没有mono中的完整实现，不过它们的使用并不广泛。如果这些扩展变得流行起来了，那么Mono也会提供对应的实现。
WinForm没有得到完整的移植，因为它们是.NET的特性功能，而并非CLI的一部分。CLI中并没有定义特定的组件库。有一些组件库是跨平台的，例如GTK#和Silveright，如果你从编写应用程序的一开始就考虑到可移植性，那就不应该使用WinForm/WPF。此外，Mono提供了一个很薄的封装层，现有的WinForm应用程序可以可以比较容易地移植为GTK#（不需要完全重写）。
Mono提供了一个工具：Mono Migration Analyser（MoMA），它能检查一个.NET应用程序能否移植到Mono上（如，是否使用了不可移植的类库，或是P/Invoke）。
对于不愿意使用开源产品的商业应用，Mono可以使用另一种授权方案，这时候Mono代码的归属权则交由Novell负责，此时授权方案便不是LGPL了。
因此，如果要考虑“.NET可否移植”这个命题，我想如果你从一开始就考虑到框架的可移植性问题，则它是成立的。但如果换个说法“我有个使用.NET开发的Windows应用程序，它应该可以在Mono上运行”，那就不正确了——不过Mono让移植这样的应用程序变得简单许多。
随后Lloeki谈论了他的工作方式：
除了技术方面的因素以外，关键还是在于编写代码的方式。
无论是哪种跨平台的应用程序（例如Java，Python，Ruby……），如果在写代码时不考虑可移植性，那么你应该假设这些代码可以直接跨平台执行的可能性为零（即使实际上这样的可能性要高出许多）。你无法随便拿到一个程序集就保证它能在Mono下正确执行。
不过对于一个新项目（或是你可以轻易重构的项目），选择.NET/Mono作为可移植的方案之一则是明智的，不过对于跨平台的代码来说，你还是需要不断地进行测试。如果你使用持续集成，那么只要简单的创建一个Mono构建的节点即可。只要养成良好的习惯（例如路径的分隔符），很多问题可以在开发阶段就解决掉，而绝大部分代码只要使用单元测试以及其他一些常见的实践方式，再加上一点点先期规划就能得到很好的跨平台性。剩下的，例如平台相关的代码（如P/Invoke），则可以通过封装，为不同平台提供针对性的实现。这样产出的项目，几乎不会付出额外的代价就能得到很好的移植性。
当然，使用一个Mono中不存在或是不兼容的类库则另当别论，不过就我的个人而言还没有遇到这样的情况。这些是我们在工作中实际用到的做法，我可以放心的声称“.NET+Mono”是跨平台的解决方案。
对于Mono于.NET功能的支持程度，Robert和Michael谈到：
我用过Mono，我认为它就和其他开源平台一样好，只不过不是微软直接支持的而已。如果你能接受Clojure或Scala这样的开源项目，那么Mono也能让你满意。Mono对于.NET的支持程度可以参考Mono Roadmap页面。Mono并不等同于.NET，它们有或多或少的区别，例如现在你还无法使用Entity Framework。
Mono不是.NET的移植品，有些技术是Mono不会或不打算实现的（如Workflow Foundation或WPF），此外它们还提供了微软.NET外的其他一些技术，例如SIMD扩展。简单地说，Mono和微软.NET是基于相同基础——CIL和BCL——的两个不同项目。
在讨论中，Mono创建者Miguel de Icaza给出了最为详细的回应：
“.NET是否跨平台”是一个模糊的说法，无论是框架本身还是整体环境都在不断改变。
简单地说，作为.NET的基础架构，CLI标准是跨平台的，但如果要在不同平台上得到最好的体验，则势必要使用各自平台上有针对性的API。CLI技术家族从来没有试着要“一次编写，到处执行”，好比电话和大型机的区别实在是太大了。与其为不同平台提供统一的API和运行时，不如各自平台上的最佳体验提供最正确的工具。试想那些非Windows PC或Unix服务器的程序员，要知道如今已经出现了游戏设备，移动电话，机顶盒，分布式集群等太多激动人心的平台。
微软的.NET框架不是跨平台的产品，它只能运行在Windows上。其他系统上还有一些.NET框架的变体，例如Windows Phone 7，XBox 360和浏览器中的Silverlight，它们都有些许不同的配置（Profile）。
如今你已经可以在各个主流的操作系统，电话，移动设备，嵌入式系统或是服务器上使用基于.NET的技术，以下是各种CLI实现的列表，虽不完整，但应该可以覆盖99%的情况：
- 基于x86和x86-64的计算机：
- Windows：一般来说你会使用.NET或Silverlight，不过你也可以使用完整的Mono。
- Linux, BSD或Solaris：完整的Mono或Silverlight。
- MacOS X：完整的Mono或Silverlight。
- Android：Mono及Android的子集。
- ARM计算机：
- Windows Phone 7：Compact Framework 2010。
- Windows 6.5及更早：早期的Compact Framework。
- Android设备：Mono/Android。
- PowerPC计算机：
- 在Linux，BSD或Unix操作系统上使用完整的Mono功能。
- 在嵌入式系统中使用Mono，如PS3，Wii。
- 在XBox36上运行Compact Framework。
- S390, S390x, Itanium, SPARC计算机：
- 完整的Mono支持
- 其他嵌入式操作系统:
- .NET MicroFramework或Mono的移动配置。
有时候相同的代码很难四处运行。例如XNA代码不会在每个桌面上运行，反之亦然。为了.NET不同的配置里运行，你需要修改些许代码。以下是我所了解的一些配置：
- .NET 4.0配置
- Silverlight配置
- Windows Phone 7配置
- XBox360配置
- Mono核心配置：与.NET配置相同，可以在Linux，MacOS X，Solaris，Windows和BSD里使用。
- .NET Micro Framework
- Mono的iPhone配置
- Mono的Android配置
- Mono的PS3配置
- Mono的Wii配置
- Moonlight配置（与Silverlight兼容）
- Moonlight扩展配置（Silverlight和完整的.NET 4 API）
以上配置都有多多少少的不同，这不是坏事。每个配置的设计都适应其平台，去除任何一个都是不明智的。例如，Silverlight API可以控制浏览器，这不关电话什么事；由于缺少合适的支持，XNA的着色功能对PC硬件也没有多少意义。你越早认识到.NET不是个将开发人员绑定在特定硬件或平台上的解决方案，就能越早成为更好的开发人员。
这意味着，有些API或解决方案可以在多个平台中使用，例如ASP.NET可以用在Windows，Linux，Solaris，MacOS X上，因为.NET和Mono都提供了这些API。同时，ASP.NET则无法在某些微软支持的平台上使用，例如XBox或Windows 7，也不支持Mono的Wii和iPhone配置。
其他解决方案的本质也是一样的。要完整列出这些技术需要一张复杂的表格，我不知道如何在这里表现出来，不过这里有个特定技术与特定平台的列表：
核心运行时引擎（所有平台）：
- Reflection.Emit支持：除WP7、CF、XBox、MonoTouch和PS3外的所有平台 。
- CPU SIMD支持：Linux,、BSD、Solaris及MacOS X。即将支持PS 3、MonoTouch和MonoDroid。
- Continuations - Mono.Tasklets：Linux、BSD、Solaris、MacOS、PS3及Wii。
- 程序集卸载：只有Windows。
- VM注入：Linux、BSD、MacOS X及Solaris。
- DLR：Windows、Linux、MacOS X、Solaris及MonoDroid。
- 泛型：在iPhone和PS3上存在一些限制。
语言：
- C# 4：所有平台。
- C# 编译器即服务：Linux、MacOS、Solaris、BSD及Android。
- F#、IronRuby及IronPython：除WP7、CF、Xbox、MonoTouch及PS3外的所有平台。
服务器技术：
- ASP.NET：Windows、Linux、MacOS、BSD及Solaris。
- ADO.NET：所有平台
- LINQ to SQL：所有平台
- Entity Framework：仅Windows
- XML核心技术：所有平台
- XML序列化：除WP7，CF和XBox外的所有平台。
- LINQ to XML：所有平台
- System.Json：Silverlight，Linux，MacOS，MonoTouch，MonoDroid（译注：可移植到其他平台）
- System.Messaging：Windows、Linux、MacOS和Solaris的支持则需要RabbitMQ。
- .NET 1 Enterprise Services：仅Windows。
- WCF：完整版仅支持Windows。Silverlight、Solaris、MacOS、Linux、MonoTouch、MonoDroid支持其自己。
- Windows Workflow：仅Windows。
- Cardspace identity：仅Windows。
GUI技术：
- Silverlight：Windows、Mac和Linux（Moonlight）
- WPF：仅Windows
- Gtk#：Windows、Mac、Linux及BSD
- Windows.Forms：Windows、Mac、Linux和BSD
- MonoMac - 原生Mac集成：仅Mac
- MonoTouch - 原生iPhone集成：仅iPhone/iPad
- MonoDroid - 原生Android集成：仅Android
- Media Center API：仅Windows
- Clutter：Windows和Linux
图像类库：
- GDI+：Windows、Linux、BSD及MacOS
- Quartz：MacOS X、iPhone及iPad
- Cairo：Windows、Linux、BSD、MacOS、iPhone、iPad、MacOS X、PS3及Wii
Mono类库 - 跨平台，可以在.NET里使用，不过需要手动编译：
- C# 4编辑器及服务
- Cecil - CIL操作，工作流，CIL探测，链接器
- RelaxNG类库
- Mono.Data.* 数据提供者
- 完整的System.Xaml（用于安装程序，.NET没有提供这个技术）
MonoTouch为iPhone上运行的Mono，MonoDroid为Andriod上运行的Mono。PS3和Wii的移植只供索尼和任天堂认证的开发人员使用。
在讨论中Miguel de Icaza还表示，IBM至少完成了两个针对AIX的Mono移植，不过他们的移植团队没有得到反馈其成果的许可。
