AI变革药物研发:深势科技的云原生实践之路

本文涉及的产品
对象存储 OSS,20GB 3个月
文件存储 NAS,50GB 3个月
对象存储 OSS,恶意文件检测 1000次 1年
简介: 阿里云与深势科技联合推出Bohrium®科研云平台和Hermite®药物计算设计平台,通过分子模拟技术大幅缩短药物研发周期、降低成本并提升成功率,为生物医药行业带来变革。

药王孙思邈曾有言:“人命至重,有贵千金,一方济之,德逾于此”,药方的重要性可见一斑。但由于人体分子系统的复杂性,以及药品研发的过程充满了不确定性,因此,业界一直流传着“双十定律”的说法,即成功研发出一款新药,需要耗费超过10亿美元的资金和十多年的时间。不过,随着AI技术的快速发展,这个定律有望被打破。

近日,阿里云与深势科技联合推出创新的Bohrium®科研云平台和Hermite®药物计算设计平台,实现了分子模拟技术的飞跃。这两项先进的工业设计与仿真基础设施成果通过AI技术赋能科学研究和工业研发,不仅大幅缩短了药物研发周期,降低了成本,还显著提高了研发成功率,为生物医药行业带来了前所未有的变革,这是AI for Science领域的重大突破。

科学计算任务对资源的需求具有极致弹性,峰值资源需求可达数十万核,需要在亚分钟级甚至秒级完成计算和数据资源的准备。

其次,AI for Science全链路涉及多种异构算力和数据池化的需求,需要充分共享数据以满足不同环节的算力需求;此外,科学计算对性能要求极高,需要对热点小文件实现低延迟加速,并且在高频弹性任务中实现数据的极速加载和统一的数据集管理;最后,作为面向大量知名高校和科研学者的平台,深势科技还需要对终端客户的数据Quota进行精准的配额管理,以控制数据量。

AI for Science 新范式.png

深势科技基于阿里云提供的一套融合技术方案解决这些问题并不断迭代演进,经过多年演进,将科学计算的数据基础设施做了充分的分层设计:
• 数据缓存层:这一层作为近计算端高速数据层,用于满足超高速的数据读取需求。这一层使用阿里云Fluid将集群内的高速存储介质抽象成逻辑缓存,进行模型管理和加速加载,同时采用镜像缓存实现镜像的快速拉取,实现Pod在秒级快速拉起。
• 共享加速层:这一层作为共享加速层,用于满足多集群共享数据读写的需求。这一层采用阿里云通用型NAS方案,解决科学计算场景大量小文件热点读取的性能问题,同时提供弹性可分配的数据存储空间。
• 长期存储层:这一层作为全量数据存储层,用于满足模型文件、CKPT、数据集的长期低成本存储。这一层采用阿里云多级OSS对象存储方案,借助阿里云的全球一张网,实现一套Bucket数据跨地域加载传输的需求。

在实际应用中,深势科技的平台帮助用户从繁重的重复实验中脱离出来,将原本需要数年才能完成的药物筛选和优化工作,用更大规模的算力协同调度缩短至几个月甚至几周,极大地加速了新药的研发进程。同时,研发成本也得到了有效控制,相较于传统研发模式,节省了大量资金投入,为药物研发企业带来了可观的经济效益。


阿里云解决方案架构图.png
图丨阿里云存储解决方案架构图

此外,阿里云还提供了多租户成本控制的能力,帮助深势科技实现了对终端客户数据Quota的精准管理,有效控制了数据量和成本。除了在药物研发领域的合作,阿里云还具备其他多项相关技术能力,能够为不同行业的客户提供全面的解决方案。

例如,在能源领域,通过云和AI技术可以帮助进行能源消耗预测和优化,提高能源利用效率;在材料科学领域,高性能算力加速新材料的研发和性能模拟;在信息科学与工程研究方面,大数据处理和分析能力为研究提供强有力的支持。

对于此次合作,深势科技技术架构师李祥兵表示:“阿里云云原生计算服务结合云原生存储服务,实现了业务发展过程中对资源的充分有效利用,有效降低了业务上线过程的研发成本和管理成本,实现了业务敏捷高效。”

阿里云工程师也认为,与深势科技的合作是一次成功的实践,充分展示了阿里云技术在AI for Science领域的强大实力和广阔应用前景。未来,双方将继续深化合作,共同探索更多创新技术和应用场景,为推动科学研究和工业研发的发展做出更大贡献。

在实际应用中,深势科技的平台在多个能源、药物研发等项目中得到了验证。例如,在与某创新实验室的合作中,运用深势科技的勒贝格平台科研协作效率提升30%,最大资源管理规模超10万核,极大提升开发效率,除此之外深势科技也与业内超过50家生物医药、新能源和新材料企业进行合作,共同提升药物研发、新材料研发的开发效率。这些实践数据充分证明了深势科技与阿里云合作的成果为科研领域树立了新的标杆。

相关实践学习
基于ECS和NAS搭建个人网盘
本场景主要介绍如何基于ECS和NAS快速搭建个人网盘。
阿里云文件存储 NAS 使用教程
阿里云文件存储(Network Attached Storage,简称NAS)是面向阿里云ECS实例、HPC和Docker的文件存储服务,提供标准的文件访问协议,用户无需对现有应用做任何修改,即可使用具备无限容量及性能扩展、单一命名空间、多共享、高可靠和高可用等特性的分布式文件系统。 产品详情:https://www.aliyun.com/product/nas
目录
打赏
0
38
38
3
2366
分享
相关文章
OpenBioMed:开源生物医学AI革命!20+工具链破解药物研发「死亡谷」
OpenBioMed 是清华大学智能产业研究院(AIR)和水木分子共同推出的开源平台,专注于 AI 驱动的生物医学研究,提供多模态数据处理、丰富的预训练模型和多样化的计算工具,助力药物研发、精准医疗和多模态理解。
33 1
OpenBioMed:开源生物医学AI革命!20+工具链破解药物研发「死亡谷」
云原生成本精细化管理实践:企迈科技的成本中心建设之路
企迈实施成本中心建设的项目核心目标不仅是实现云资源的优化配置,还要为管理层提供清晰、实时的成本数据分析,帮助管理层做出更加精准的决策。通过精细化的云成本管控,逐步实现成本降低、资源合理分配和更加高效的云产品使用。
云原生成本精细化管理实践:企迈科技的成本中心建设之路
ACK Gateway with AI Extension:面向Kubernetes大模型推理的智能路由实践
本文介绍了如何利用阿里云容器服务ACK推出的ACK Gateway with AI Extension组件,在Kubernetes环境中为大语言模型(LLM)推理服务提供智能路由和负载均衡能力。文章以部署和优化QwQ-32B模型为例,详细展示了从环境准备到性能测试的完整实践过程。
ACK Gateway with AI Extension:大模型推理的模型灰度实践
本文介绍了如何使用 ACK Gateway with AI Extension 组件在云原生环境中实现大语言模型(LLM)推理服务的灰度发布和流量分发。该组件专为 LLM 推理场景设计,支持四层/七层流量路由,并提供基于模型服务器负载感知的智能负载均衡能力。通过自定义资源(CRD),如 InferencePool 和 InferenceModel,可以灵活配置推理服务的流量策略,包括模型灰度发布和流量镜像。
构建企业AI的信任与信心基石:从认知到实践的全面升级
本文探讨企业在人工智能(AI)广泛应用背景下面临的信任与信心挑战,提出通过数据安全、技术透明度及技能认证构建信任体系。重点介绍生成式人工智能认证(GAI),其能助力企业培养AI人才,提升团队专业能力。文章还建议企业加强内部培训、外部合作与实战应用评估,全方位推动AI战略落地,为企业发展提供支持。
通义灵码 2.0 评测:AI 赋能编程,开启高效研发新旅程
通义灵码2.0通过AI赋能编程,显著提升开发效率与代码质量。安装便捷,支持自然语言描述需求自动生成高质量代码框架及注释,大幅简化新功能开发流程。其单元测试Agent能快速生成全面测试用例,覆盖更多边界情况。相比1.0版本,2.0在智能问答和代码生成速度上均有显著提升,为开发者带来高效研发新体验。
90 6
深入理解云原生架构及其在现代企业中的应用
随着数字化转型的浪潮席卷全球,企业正面临着前所未有的挑战与机遇。云计算技术的迅猛发展,特别是云原生架构的兴起,正在重塑企业的IT基础设施和软件开发模式。本文将深入探讨云原生的核心概念、关键技术以及如何在企业中实施云原生策略,以实现更高效的资源利用和更快的市场响应速度。通过分析云原生架构的优势和面临的挑战,我们将揭示它如何助力企业在激烈的市场竞争中保持领先地位。
103 13
探索云原生技术:容器化与微服务架构的融合之旅
本文将带领读者深入了解云原生技术的核心概念,特别是容器化和微服务架构如何相辅相成,共同构建现代软件系统。我们将通过实际代码示例,探讨如何在云平台上部署和管理微服务,以及如何使用容器编排工具来自动化这一过程。文章旨在为开发者和技术决策者提供实用的指导,帮助他们在云原生时代中更好地设计、部署和维护应用。
云计算的未来:云原生架构与微服务的革命####
【10月更文挑战第21天】 随着企业数字化转型的加速,云原生技术正迅速成为IT行业的新宠。本文深入探讨了云原生架构的核心理念、关键技术如容器化和微服务的优势,以及如何通过这些技术实现高效、灵活且可扩展的现代应用开发。我们将揭示云原生如何重塑软件开发流程,提升业务敏捷性,并探索其对企业IT架构的深远影响。 ####
98 3
云原生时代的架构革新,Apache Doris 存算分离如何实现弹性与性能双重提升
随着云基础设施的成熟,Apache Doris 3.0 正式支持了存算分离全新模式。基于这一架构,能够实现更低成本、极致弹性以及负载隔离。本文将介绍存算分离架构及其优势,并通过导入性能、查询性能、资源成本的测试,直观展现存算分离架构下的性能表现,为读者提供具体场景下的使用参考。
云原生时代的架构革新,Apache Doris 存算分离如何实现弹性与性能双重提升

云存储

+关注